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Lösungsblatt zum Bioinformatikteil Orien Rousseau
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Lösungen zu den Bioinformatik Aufgaben von Orien Rousseau, KIT, 4. Semester, Allgemeine Biologie Bachelor
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Kurstag 1Gruppen Nummer 19
Name + Matr. Nr.
Name + Matr. Nr.
C1 Primersequenz incl. Schnittstelle
Sequenz primer_1 AAACCATGGTGTCCAGCGACCCGAATTTC
Sequenz primer_2 AAAGCGGCCGCAACGAACGCAACGGAAAGGC
* Tm Temperaturen bitte immer für die erste Runde der PCR angeben! Berechnung über APE
pET22_BE1 Sequenz
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cctcgctgcccagccggcgatggccatggTGTCCAGCGACCCGAATTTCTCGCTCATAAGCTTCTTGGAGTGCCTCA
ACGAGATCGAGCACGAGTTTCTGCGAGATAAAGGGGAGAATTACCCCGTTCTCGTGCGTAAACTCCGAG
AGCTGCAACAAAAGATACCCAACGACATTGCAAACCTACCCCGCGATCCCGAAACGATCCAGCAAATTCA
CCAGACTACACACAGGATTAGAGCCGTTGCCCAGGCATTTATACGTTTCGACCAGAAGTTCGTCTCTCTGT
GTTCCGAGGTCGTTCACGGCACGAGCAAAGTCATGCAGGAGTTCAATGTCGTAAGTCCTGATGTAGGGT
GTCGAAATCTTTCGGAGGATCTTCCTGCGTATCACATGCGTAAACACTTTCTCCTTACTCTCGACAACCCTT
ATCCGACTCAAGAAGAGAAAGAAACCCTCGTTAGGTTGACCAACGAATCCACAGCAAGAGTTGGCCAGT
CCAGCGTAAATCGTCCTCCGCTCGAGGTTCATCACGTCACGCTATGGTTCATTAACGCACGCCGTCGTTCT
GGATGGTCTCATATTCTGAAGAAGTTCGCACGCGAGGATCGTTCACGGATGAAACATCTGGTACGGGCC
AAGCTGTCTTCATCAAACCAGTCTACTCCTCCTTCATCGACGTATGATTCTCTCTCAAACAATCTAGACGAC
GTTCTATCAGACAACCTCGGACGACCACTCACACCTGTTGACAAGCAGCAGTTCGAAGATGACTGGGCAA
GCATGATCAGCTGGATCAAGTATGGCGTGAAAGAAAAAGTTGGAGACTGGGTCTATGATCTCTGCGCAG
CGAGCAAGAAGACTCCGAAGCCTGGCATGCCACGTCCCGTCACCACAGTAGCGAACCGGCATCCAGCGC
GCAAAACTAAACCAGCCGCAAAACCAAAGTCAAGAACAGCGAACCCGCGAGCAAGCACAACACCTTCCA
TTGACAGCACCTTGGACAGTTCAAAGCTAGAGTCGACTCCAGAACTCAGCATGTGTTCGACAGCGGACAC
GAGCTTCAGTACATTCGGGAGCAGTCTCTCAATGTCTCACTACAATCCCTTTCAGGATGGAAACGATATTC
TACAGAGTCCGACAGTCAAAGCCAGGGGCAATAGGAAAGTCAAAGCGCTTCCGAAGCGGGCTGGAAAG
CAGCAGCCTGACGAGGTCGACAATGGTAAGATTCCTTTCCTTTGCCTTTCCGTTGCGTTCGTTgcggccgcac
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,C2 Primersequenz incl. Schnittstelle
primername_fwd AAACCATGGTGTCCAGCGACCCGAATTTC
primername_rev AAAGCGGCCGCATCGTTTCCATCCTGAAAGGG
* Tm Temperaturen bitte immer für die erste Runde der PCR angeben! Berechnung über APE
Nukleotid-Sequenz des verkürzten bE1-Gens
ATGTCCAGCGACCCGAATTTCTCGCTCATAAGCTTCTTGGAGTGCCTCAACGAGATCGAGCACGAGTTTCT
GCGAGATAAAGGGGAGAATTACCCCGTTCTCGTGCGTAAACTCCGAGAGCTGCAACAAAAGATACCCAA
CGACATTGCAAACCTACCCCGCGATCCCGAAACGATCCAGCAAATTCACCAGACTACACACAGGATTAGA
GCCGTTGCCCAGGCATTTATACGTTTCGACCAGAAGTTCGTCTCTCTGTGTTCCGAGGTCGTTCACGGCAC
GAGCAAAGTCATGCAGGAGTTCAATGTCGTAAGTCCTGATGTAGGGTGTCGAAATCTTTCGGAGGATCTT
CCTGCGTATCACATGCGTAAACACTTTCTCCTTACTCTCGACAACCCTTATCCGACTCAAGAAGAGAAAGA
AACCCTCGTTAGGTTGACCAACGAATCCACAGCAAGAGTTGGCCAGTCCAGCGTAAATCGTCCTCCGCTC
GAGGTTCATCACGTCACGCTATGGTTCATTAACGCACGCCGTCGTTCTGGATGGTCTCATATTCTGAAGAA
GTTCGCACGCGAGGATCGTTCACGGATGAAACATCTGGTACGGGCCAAGCTGTCTTCATCAAACCAGTCT
ACTCCTCCTTCATCGACGTATGATTCTCTCTCAAACAATCTAGACGACGTTCTATCAGACAACCTCGGACG
ACCACTCACACCTGTTGACAAGCAGCAGTTCGAAGATGACTGGGCAAGCATGATCAGCTGGATCAAGTA
TGGCGTGAAAGAAAAAGTTGGAGACTGGGTCTATGATCTCTGCGCAGCGAGCAAGAAGACTCCGAAGC
CTGGCATGCCACGTCCCGTCACCACAGTAGCGAACCGGCATCCAGCGCGCAAAACTAAACCAGCCGCAA
AACCAAAGTCAAGAACAGCGAACCCGCGAGCAAGCACAACACCTTCCATTGACAGCACCTTGGACAGTTC
AAAGCTAGAGTCGACTCCAGAACTCAGCATGTGTTCGACAGCGGACACGAGCTTCAGTACATTCGGGAG
CAGTCTCTCAATGTCTCACTACAATCCCTTTCAGGATGGAAACGAT
, C3
Original AS Alanin
Original-Sequenz: ACGCTATGGTTCATTAACGCACGCCGTCGTTCTGGATGG
Primer-Sequenz: ACGCTATGGTTCATTAACCTGCGCCGTCGTTCTGGATGG
veränderte AS Leucin
Errechnete
Schmelztemperatur 78,33°C
Tm**: Anmerkung: Die Prozentwerte wurden gerundet.
** Tm Temperatur nach der AGILENT-Vorgabe
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