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GEN 2: Defining the Genome I - Chromosomes

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04-10-2023
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2022/2023

Lecture notes from Imperial College London, Medical Biosciences BSc, 2nd year, genetics and genomics (GEN) module. Focus on nuclear chromosomes: learn how 2 metres of DNA is somehow packaged into these tiny chromosomes and understand some key features of chromosomes that determine their structure and function. Understand the differences between autosomes, sex chromosomes and mitochondrial chromosomes, and their association with disease. learning objectives: - Recall the changes in number, position and condensation state of nuclear chromosomes during the mitotic and meiotic cell cycles. - Explain the relationship between Mendelian inheritance and the behaviour of meiotic chromosomes and gametes. - Understand and interpret basic pedigree analyses and karyotypes. - Describe some key components of chromosomes that determine their structure and function. - Differentiate between the properties and significance of nuclear and mitochondrial chromosomes.

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Defining the Genome I - Chromosomes
Mitosis & Meiosis
- cytogenetic: field where microscopic analysis of cellular structures (specifically nuclear chr) is used
to investigate inheritance
- mitosis: normal cell division (somatic cells)
=> 1 cell divides into 2 daughter cells (division of sister chr)
=> follow a S-phase (chr duplication)


(2 sets of chr - microtubules extend from centrosomes)
IS-phase)
(Condensation - mitotic spindle extends bw centrioles - membrane breaks down)

(Centrioles at opposite poles)




- meiosis: formation of gametes
=> 1 cell divides into 4 daughter cells with half amount of genetic inf. (haploid chr)
=> sex cells, gametes (sperm/ eggs)
=> 2 cell divisions: homologues (I) + sisters (II)
=> recombination between homologues (prophase I):
DNA from paired chr of parents cross over each other
to exchange nucleotide sequences => changed chr

, Cytogenetic and the human karyotype
- “metaphase spreads” to count chr: stop cell cycle in metaphase (condensed + distinguishable chr)
- X-shaped structure: pair of sister chromatides (DNA replication of 1 chr) joined at centromere
(end of each chromatid = telomere)




- karyotype = complete set of chr (numbered according to length)
=> determined via G-banding (dye Giesma stain chr: light/ dark bands), length, centromere position


22 homologous pairs (autosomes) + 2 sex chr (allosome)
(only father’s chr determine sex of child)




- euploid cells = normal chr number
- aneuploid = abnormal chr number
- fluorescent in situ hybridisation (FISH): DAPI stains chr
+ hybridisation of the fluorescently labelled DNA probes
identifies specific regions (telomere...)



Chromosomal theory of Mendelian inheritance
- Mid 19th: chr first seen
- Mid 19th: nuclear genetic material + inheritance through germ cells
- 1902: connection w/ Mendelian inheritance: homologous chr separate (haploid) and pair again
(diploid) during fertilisation
- 1905: gender determined by sex chr => genes carried by chromosomes

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Dokument Information

Hochgeladen auf
4. oktober 2023
Anzahl der Seiten
6
geschrieben in
2022/2023
Typ
Notizen
Professor(en)
Andy porter
Enthält
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