Samenvatting Biochemie 1 (GA, 2e Bachelor Diergeneeskunde UGent), ik ben met deze samenvatting geslaagd in eerste zittijd en was in de top 5%. De samenvatting is gestructureerd, duidelijk en heeft een perfect detailniveau
Cluster 1: Basisconcepten metabolisme
X kennis
clip
Hoofdstuk 1: Co-enzymen
Co-factoren
• Bij enzymatisch gekatalyseerde reacties is dikwijls de medewerking vereist van reactieve groepen
verschillend van de aminozuren op de actieve plaats van het enzyme, de co-factoren:
◦essentiele kationen: zijn mineralen en sporen-elementen uit de voeding
‣ K⁺, Ca²⁺, Mg²⁺
‣ Zn²⁺, Fe²⁺, Cu²⁺
• carboanhydrase met Zn²⁺ : OH⁻ + CO₂ <-> HCO₃⁻
◦co-enzymen: zijn organische moleculen maar geen proteinen
Co-enzymen
• Binden op actief centrum als k
◦co-substraat (reversiebel): Worden door het enzyme omgezet zoals een S,
maar nadien gerecycleerd in een 2e reactie, zodat reactie 1 opnieuw kan
doorgaan
◦prostetische groep (irreversiebel): het treedt een irreversiebele binding aan
het enzym op, waardoor er een inactief enzyme in een actieve moet omgezet
en de prostetische groep naar de initiele vorm teruggebracht moet worden
• Er bestaan 2 bronnen van co-enyzmen:
◦Metbolieten ~ eigen synthese
◦Derivaten van wateroplossbare vitaminen
,Metabaolieten
• Adenosine-trifosfaat (ATP) en analogen: na
v
◦levert reactieve (P)Pi voor fosforylatie via kinase
‣ eerst wordt er energie in het systeem gestoken (∆G >0)
1 v
‣ de volgende stap van de fosforylate kan nu spontaan ca on a
µ µ
aflopen (G<<0), waardoor er een winst aan energie is a p o p a p o o
◦ATP heeft een kritische middenpositie met ∆G° = -32 kJ/mol 1 1 1 Hp
on at on
en levert daarom genoeg energie om efficient gebruikt te
kunnen worden, maar is niet te reactief en instabil
at at
• S-adenosyl-methionine (niet op examen)
• Ubiquinone (Q):
◦bevat centraal een chinon-sturctuur en zorgt oa. in de
binnenste mitochondriale membraan voor het
electronentransport door redox-reacties
‣ via twee 1-electron transfers van Q tot QH₂ via Q⁻ als
partiele reductietoestand
Ter info
• Cytochromen (a,b) c
◦bestaan uit een prostetische heem met variabele zijketens
◦functioneren via een 1-elektronen transport redox-reactie
aan de reactieve groep Fe³⁺ (ferri) <-> Fe²⁺ (ferro)
• Lipoamide (vitamine B)
◦bestaan uit lipoinezuur gebonden aan proteine (prostetisch)
◦functioneren via 2 SH groepen (thiol), die een thioester
vormen
◦kunnen van de meeste dieren synthetiseren
◦bestaat uit nicotinezuur, ribose, Pi
en AMP
◦functioneren via reactieve N⁺ en H⁻
groep door een katalyse redox-
reactie via dehydrogenase (2é
transfer)
◦NAD(P)⁺ + 2é + H⁺ <-> NAD(P)H
◦Voorbeeld: na de eindstap van de
gylcolyse kan via het NAD⁺ een
reversiebele anaerobe oxidatie
plaatsvinden van lactaat (S)
◦precurser = riboflavine (vitamine B2)
◦functioneert via reactieve groep die 2x H+ en é
bindt = H⁺ + H⁻: katalyse van redox-reactie via
dehydrogenase
◦vergelijkbaar mechanisme als coenzyme Q
• Coenzyme A = HS-CoA
◦precursoren = pantothenaat (vitamine
B3) + een amine en een fosfo ADP
◦functioneert via een reactieve HS
(thiol) groep
, • Thiamine pyrofosfaat (TPP)
◦precursor = thiamine (vitamine B1) + PPi (uit ATP)
◦functioneert via een reactieve C₂ groep van de thiazolium
ring met transfer OH-alkyl-groep na decarboxylase
• Pyridoxal fosfaat (PLP)
◦precusoren = pyridoxal of "PAL" (vitamine B6) + Pi (uit ATP)
◦functioneert via een reactieve aldehyde groep, die tijdens een transfeer
amino-groep via transaminase een Shiffse base reactie met een aminozuur
aangaat tot vorming van pyridoxamine-P,
• Biotine
◦functioneert via een reactieve
HN groep
I
◦Bijvoorbeeld bij CO₂ (HCO₃⁻)-
transfer via carboxylase
• Tetrahydrofolaat (THF)
◦precursor = folaat of foliumzuur, na reductie + gluketen
◦functioneert via 2 reactieve NH groepen voor methylatie
◦complexer metabolisme dan andere H₂O-oplossbare vitaminen
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller Postc. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $10.80. You're not tied to anything after your purchase.
