Summary
Samenvatting Inleiding systeembiologie
- Course
- Institution
Samenvatting van het vak Inleiding systeembiologie, gegeven tijdens het 3e jaar van Medische natuurwetenschappen.
[Show more]
Seller
Follow
boekentijger
Reviews received
Content preview
Balans opstellenK1+: deze reactie gaat naar rechts Massa actie kinetiek
K1-: deze reactie gaat naar links Snelheden
K2: deze reactie gaat maar 1 kant op, in dit geval naar rechts. Evenwicht & steady-state
Hoofdletters: naam
Kleine letters: concentratie
E: enzym
S: substraat Dit is een gesloten systeem, want
ES: gebonden enzym en substraat er wordt niks aan- of afgevoerd.
P: product
S: als een stof onderstreept is, dan betekent het dat het een constante
concentratie heeft. Er wordt dus steeds extra S toegevoegd om de
concentratie gelijk te houden. Voor deze stoffen hoef je nooit een balans
op te stellen!
1. Systeem definiëren
Parameter = constant
Variabele= niet constant
2. Balans opstellen
3. Kinetiek bepalen
V1 en V2 invullen
4. Stationaire punten bepalen
Stationaire toestand = wanneer de r.c. niet meer verandert
en dus geldt dx/dt = 0. Dit is op het snijpunt van V1 en V2.
Rate characteristic = een grafiek waarin te zien is hoe
processen afhangen van X.
Er zijn 2 soorten:
1. Massa actie kinetiek
2. Enzym kinetiek
Enzym kinetiek gebruik je als er enzym katalysatie bij betrokken is. Dit kan zijn: het vormen van een complex tussen 2
eiwitten / het binden van een ligand aan een receptor / spontane chemische reactie.
Belangrijk:
• De reactie gaat maar 1 kant op, dus gebruik je het
proces k1+.
• 2x moet je noteren als x2 in de balans.
• Je begint met 2 x en eindigt met 1 x, er gaat dus 1 x
af. Hierdoor schrijf je in de balans een - . Dit noem je
de storcheometrische coëfficiënt.
Summary Pagina 1
, Er zijn 2 soorten stationary states:
1. Steady-state
2. Equilibrium (evenwicht)
Voorbeelden:
S→X→P Heeft equilibrium. Uitleg: S, X en P zijn variabelen. Als je S toevoegt wordt dit omgezet in X. X wordt
omgezet in P. De reactie stopt wanneer alle stoffen in evenwicht zijn. De bijbehorende balansen zijn:
ds/dt= -v1. dx/dt=v1-v2. dp/dt=v2. Je kan het ook op een andere manier uitleggen; bij steady state geldt
er dat ds/dt=0. Dit betekent dat ds/dt = -v1 = 0. De snelheid van reactie 1 is dus 0. Als de snelheden 0 zijn,
is er sprake van evenwicht.
S→X→P Heeft equilibrium. Uitleg: stel je zet S op 1 dan wordt dit omgezet in X. X wordt omgezet in P. Er ontstaat
een evenwicht als alle stoffen een concentratie van 1 hebben. De bijbehorende balansen zijn: dx/dt = v1 -
v2. dp/dt = v2. Let op: je stelt dus geen balans op voor S.
S→X→P Heeft (meestal) een steady-state, maar dit is afhankelijk van de concentraties van S en P. Er is een
constante stroom door het systeem. Op het moment dat v1=v2 heb je een steady-state. Stel dat er geldt
v=0 op het moment van v1=v2, dan krijg je equilibrium. Dit is dus alleen bij specifieke/ unieke waarden
van S en P.
Heeft steady-state. Uitleg: er geldt V kinase = Vp, dus er is een steady state.
Volgorde van stappen tot systeembeschrijving?
1. Variabelen en parameters vaststellen
2. Balans opstellen
3. Kinetiek bepalen
4. Stationaire punten bepalen
Geef de balans van
dx/dt = v1 - v2
dy/dt = v2 - v3
dz/dt = v3 - v4
n.b. Z heeft ook invloed op X, maar dat hoef je niet te geven bij de balans. Als er gevraagd wordt om de
snelheden (rate equation), dan moet je wel rekening houden met Z.
Geef de balans van:
dx/dt = v1 - v2
dy/dt = v3 - v4
n.b. L heeft geen streep eronder dus je zou hier ook een balans voor kunnen opstellen, maar er zijn
verder geen stoffen die hem beïnvloeden. De stippellijn betekent regulatoire interactie, het heeft dus
invloed op een snelheid.
Summary Pagina 2
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller boekentijger. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.17. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
52510 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now