100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Uitwerking alle werkcolleges genoom tot populatie $8.41
Add to cart

Other

Uitwerking alle werkcolleges genoom tot populatie

 1 purchase
  • Course
  • Institution

Uitwerking van alle werkcolleges van genoom tot populatie. Met vragen en duidelijke antwoorden. Handig ter voorbereiding van het tentamen.

Preview 4 out of 62  pages

  • April 8, 2021
  • 62
  • 2020/2021
  • Other
  • Unknown
avatar-seller
Werkcolleges GP
Inhoudsopgave:
Werkcollege 1: DNA replicatie, translatie en splicing....................................................2
Werkcollege 2: Effect van mutaties op fenotype..........................................................8
Werkcollege 3: DNA diagnostiek..............................................................................12
Werkcollege 4: Regulatie van gen expressie.............................................................19
Werkcollege 5: DNA-technieken..............................................................................26
Werkcollege 6: Modificatie van Mendeliaanse ratio’s door koppeling.............................31
Werkcollege 7: Cytogenetica, chromosomale variatie en chromosoomafwijkingen..........36
Werkcollege 8: Bioinformatica.................................................................................41
Werkcollege 9: Inteelt...........................................................................................49
Werkcollege 10: Erfelijkheidsgraad..........................................................................54
Werkcollege 11: Selectie op een continu ken- merk en het gebruik van moleculaire
merkers...............................................................................................................58

,Werkcollege 1: DNA replicatie, translatie en splicing

Opdracht 1.1
In de notatie van strengen DNA of RNA worden vaak de afkortingen A, G, C, T en
U gebruikt, die staan voor respectievelijk adenine, guanine, cytosine, thymine en
uracil of voor adenosine, guanosine, cytidine, thymidine en uridine.
- Wat is formeel het verschil tussen beide rijtjes?
Adenine etc. is de benaming voor de nucleotidebase zelf, adenosine etc. is de benaming
voor de nucleotidebase gekoppeld aan ribose (nucleoside).
- Zal ATP dus staan voor adenosinetrifosfaat of voor adeninetrifosfaat?
In ATP zit adenine gebonden aan ribose dus zal het adenosinetrifosfaat zijn.
- Welke vier nucleotiden worden bij de replicatie gebruikt door DNA
polymerase? (geef de officiële naam en de afkorting)? Zijn andere
nucleotiden helemaal niet betrokken bij de replicatie?
Deoxyadenosinetrifosfaat (dATP), Deoxyguanosinetrifosfaat (dGTP),
Deoxycytidinetrifosfaat (dCTP) en Deoxythymidinetrifosfaat (dTTP).
Andere nucleotiden (nucleosines) zijn betrokken bij het maken van de
RNA-primer (ATP, GTP, CTP en UTP)


Opdracht 1.2
De base 5-bromouracil (5BU) is een chemisch mutageen. Hij dankt zijn
mutageniciteit aan zijn eigenschap dat hij twee verschillende structuren kan
aannemen, die spontaan in elkaar kunnen overgaan. In zijn ene, normale, vorm
gedraagt 5BU zich als uracil en zal dus met adenine een paar vormen, maar in
zijn andere, bijzondere, structuur gedraagt het zich als een cytosine en zal dus
met guanine een paar vormen.




2

, a. Laat zien dat 5-Bromouracil zowel AT→GC als GC→AT mutaties (transities
want van purine naar purine) kan veroorzaken door een aantal replicatie
cycli van een DNA sequentie te tekenen waarin 5BU is ingebouwd.
5-Bromouracil kan twee verschillende structuren aannemen, het kan zich
gedragen als uracil en als cytosine. Uracil bindt aan adenine en cytosine bindt aan
guanine. Er ontstaat een mutatie als 5-Bromouracil spontaan overgaat in de
andere vorm.




b. Welke van de volgende mutaties in een eiwitketen kunnen veroorzaakt zijn
door 1 enkele wijziging in het DNA door het mutageen 5-bromouracil
(genetische code staat aan het eind van dit werkcollege)?
Lys  Glu
Asp  Ala  Geen transitie
Phe  Leu




Opdracht 1.3
Voordat we met translatie beginnen, nog even het verschil tussen replicatie en
transcriptie. Hieronder zie je een opname van DNA dat bezig is met replicatie en
van DNA dat getranscribeerd wordt. Geef aan welke figuur replicatie voorstelt en
welke transcriptie? Geef ook aan waar de volgende termen zich bevinden door ze
aan het begin van betreffende pijl(en) te zetten: RNA; Leading strand;
Lagging strand ; Origin of replication; Promoter; RNA polymerase; DNA
polymerase; Okazaki fragmenten

Transcriptie Translatie

Okazaki fragmenten/ lagging strand RNA polymerase
Leading strand




Promotor
Origin of
DNA polymerase (stukje DNA) RNA
replication
Okazaki fragmenten/ 3
Leading strand
lagging strand

, Opdracht 1.4
Het aminozuur op plaats 102 in de sequentie van een bacterieel enzym is
glycine, en het corresponderende codon in de mRNA sequentie voor het enzym is
GGA. Stel dat een mutatie die het codon verandert in GCA geen invloed heeft op
de activiteit van het enzym, maar dat een andere mutatie die het codon
verandert in UGA het enzym inactiveert. Verklaar deze waarnemingen en geef de
algemene namen van de 2 verschillende mutaties.


GCA codeert voor Alanine, Alanine en Glycine lijken heel erg op elkaar dus zal het eiwit
weinig veranderen (transversie, niet-synoniem, neutraal). UGA is een stopcodon dus heb je
maar een half eiwit, een half eiwit werkt vaak niet goed (transversie, non-sense, loss-of-
function).




Opdracht 1.5
Het is essentieel dat spliceozomen (snRNPs complexen) introns precies
verwijderen, d.w.z. tussen het laatste nucleotide van een intron en het eerste
nucleotide van een exon. Om te zien waarom dat zo nauw luistert,
veronderstellen we bijvoorbeeld even dat de sequentie op de grens tussen een
intron en een exon is


..........UUAG GCUAACGGCA..........
**
Intron Exon


Veronderstel verder dat een spliceozoom af en toe het RNA transcript
tussen de G en C residuen in het exon splitst, met als gevolg dat de
volgende twee moleculen ontstaan:


..........UUAGG CUAACGG.........


Wat zou de consequentie van deze splitsing zijn?

Er ontstaat een verandering van het leesframe  frameshift. Hierdoor zullen andere
aminozuren worden ingebouwd.




4

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller wenkesnijders. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $8.41. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

65040 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now

Start selling

Recently viewed by you


$8.41  1x  sold
  • (0)
Add to cart
Added