Class notes
Biochemie 2 course 5 blok 2 volledig tentamenstof
- Course
- Institution
- Book
In deze samenvatting zit alle informatie dat vermeld is in de colleges van biochemie 2.
[Show more]
Connected book
Book Title:
Author(s):
- Edition:
- ISBN:
- Edition:
More summaries for
-
Test Bank For Lehninger Principles of Biochemistry 8th Edition By David L. Nelson; Michael M. Cox | 9781319228002 | | Chapter 1-28 | Complete Questions And Answers A+
-
Test Bank - Lehninger Principles of Biochemistry, 7th Edition (Nelson, 2022), Chapter 1-28 | All Chapters
-
Test Bank For Lehninger Principles of Biochemistry 6th & 8th Edition By David L. Nelson; Michael M. Cox | 9781319228002 | | Chapter 1-28
Seller
Follow
sammessing
Reviews received
Content preview
Aminozuren zijn de bouwstenen van eiwittenStandaard vorm van aminozuren
De roze C wordt de Alpha-carbon genoemd. Het staat centraal in het molecuul, want alles zit vast aan dit
atoom. De NH2 groep heet de amino groep en de COOH groep heet de carboxyl (zuur) groep. Dit samen wordt
een aminozuur.
De restgroep is verantwoordelijk voor de variatie van aminozuren. Hoe groter de restgroep hoe minder flexibel
het aminozuur is.
Aminozuren nummeren van C-atomen
• Organisch: begin te tellen bij het eerste koolstof atoom (1,2,3,4 etc...)
• Biochemisch: begin te tellen bij het alpha carbon atoom en sla de carboxylgroep over, tel gelijk door
naar de rest groep.
Aminozuren als zwakke zuren en zwakke basen
Bij een lage pH zijn alle groepen compleet geprotoneerd. (veel H 3O- in oplossing)
Bij een neutrale pH worden er dipolar zwitterions gevormd
Bij hoge pH doneren alle groepen hun protonen. (veel H+ in de oplossing)
pKa waarde is de pH waarop de helft van de aminozuren hun H + heeft afgegeven.
pKa = -log(Ka)
1
,pKa1 is het omslagpunt waarop de carboxyl groep (COOH) zijn H + afgeeft waarna deze in COO- verandert.
pKa2 is het omslagpunt waarop de amino groep (NH3+) zijn H+ afgeeft waarna deze in NH2 verandert.
Iso-elektrisch punt
*‘’pI’’ is het iso elektrisch punt.
Op het iso-elektrische punt is:
- de netto lading 0.
- het aminozuur het minst oplosbaar in water.
- wil het aminozuur niet migreren in elektrische velden.
Voorbeeld:
Glycine heeft een pKa1 van 2.3 en een pKa2 van 9.6
(2.3 + 9.6) / 2 = 6 (pH) = iso-elektrisch punt
pKa & lading
pKa1 van aminozuur:
De pH waarop 50% van de protonen (H+) van de COOH- groep zijn afgekapt.
R-COOH → R-COO- + H+
50% 50%
pKa2 van aminozuren:
De pH waarop 50% van de -NH2 groep is geprotoneerd.
R-NH3+ → R-NH2 + H+
50% 50%
2
,Restgroepen kunnen ook een lading hebben
Aminozuren: classificatie
Aminozuren kunnen onderverdeeld worden in vijf groepen door naar de rest groep te kijken.
• Nonpolair, aliphatisch
• Aromatisch
• Polair,ongeladen
• Positief geladen
• Negatief geladen
*Polair betekent of iets goed oplosbaar is (in water).
*Aliphatisch betekent niet-aromatisch.
*Aromatisch betekent dat de C’tjes van de restgroep in een benzeenring (6x C) liggen.
Nonpolaire, aliphatische restgroepen
Gly, Ala, Pro, Val, Leu, Ile, Met
*Glycine is de enige non-chiral amino acids.
*Chiraal betekent dat ze niet overeenkomen met hun spiegelbeeld!
*Methionine is altijd het eerste aminozuur in een eiwit (startcodon)
Aromatische restgroepen
Phe, Tyr, Trp
*Aromatische restgroepen bevatten een benzeenring.
*Tryptophaan is het enige aminozuur met een ‘dubbel ring’.
*Tyrosine is als enige polair, de andere twee zijn nonpolar (a-polair).
3
, Polaire, ongeladen restgroepen
Ser, Thr, Cys, Asn, Gln
*Deze restgroepen kunnen waterstof bruggen vormen.
*Cysteine kan disulfide bindingen vormen.
Positief geladen restgroepen
Lys, Arg, His
*Positief geladen restgroepen zijn positief geladen als de pH onder de pKr waarde is.
Negatief geladen restgroepen
Asp, Glu
4
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller sammessing. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.43. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
66184 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now