GENETICA EN EVOLUTIE
HOOFDSTUK 18
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) zijn de meest voorkomende soorten polymorfisme
- Polymorfisme = het voorkomen van twee of meer duidelijk verschillende vormen in de
populatie van een soort.
- De meest SNPs hebben slechts twee allelen – bijvoorbeeld A en C –
SNPs die voorkomen in eiwit-coderende gebieden van genen kunnen worden geclassificeerd in drie
goepen:
- Synonymous – de verschillende allelen coderen voor hetzelfde aminozuur
- Nonsynonymous – de verschillende allelen coderen voor verschillende aminozuren
- Nonsense – het ene allel codeert voor een stopcodon en het andere allel codeert voor een
aminozuur
Noncoding SNPs (ncSNPs) = SNPs die voorkomen buiten de coderende-sequentie
Silent ncSNPs = noncoding SNPs die geen effect hebben op genfunctie en fenotype
Men kan SNP-variatie in een populatie bestuderen:
1. Eerst moet men bepalen welke nucleotidenplaatsen in het genoom variabel zijn – oftewel
welke nucleotidenplaatsen een SNP vormen –
Dit wordt SNP-detectie genoemd genomen van een kleine steekproef van individuen van
een soort wordt gesequenced en vervolgens vergeleken met elkaar
2. Het genotype van verschillende individuen in de populatie bij elke SNP kan worden bepaald
DNA van een individu wordt gelabeld met
fluorescerende tags en gehybridiseerd met
de microarray. Elke vlek (SNP) op de
microarray zal rood fluoresceren voor de ene
homozygote klasse, groen voor de andere
homozygoot en geel voor een heterozygoot
Gene-pool = het totaal van alle alllelen in de
‘breeding members’ van een populatie op
een bepaald moment
N = 16
Totaal allelen = 2N = 32
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller femkesouren. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $6.95. You're not tied to anything after your purchase.