100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Previously searched by you
Previously searched by you
logo
Samenvatting methoden in het biomedisch onderzoek 14/20! (E0F93A) $9.43
Add to cart
Quickly navigate to
Preview
  2.  
  3. Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)
  4.  
  5. Biomedische Wetenschappen
  6.  
  7. Methoden In Het Biomedisch Onderzoek 1 (E0F93A)

Summary

Samenvatting methoden in het biomedisch onderzoek 14/20! (E0F93A)

2 reviews
 13 purchases
  • Course
  • Methoden In Het Biomedisch Onderzoek 1 (E0F93A)
  • Institution
  • Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)

Gestructureerde en volledige samenvatting methoden in het biomedisch onderzoek. Gegeven door verschillende proffen in het eerste jaar biomedische wetenschappen aan KUL.

Preview 4 out of 104  pages

Document information

  • June 2, 2021
  • 104
  • 2019/2020
  • Summary

Subjects

  • studiemateriaal
  • staalbereiding
  • bio veiligheid
  • meten
  • schatten
  • basistechnieken
  • microscoop
  • spectroscopie
  • chromatografie
  • elektroforese
  • analyse dna
  • luminescentie

Written for

  • Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)
  • Biomedische Wetenschappen
  • Methoden In Het Biomedisch Onderzoek 1 (E0F93A)
All documents for this subject (40)

2  reviews

review-writer-avatar

By: yoniottenburgs • 1 year ago

review-writer-avatar

By: nettepeeters01 • 2 year ago

Translated by Google

wicked

reply-writer-avatar

By: MK2002 • 2 year ago

Translated by Google

What's bad about it? I got a 14/20 myself with this summary. For the rest, it has already been sold 8 times and I never had any complaints about it:))

reply-writer-avatar

By: MK2002 • 2 year ago

Translated by Google

Reply deleted by the user

Seller

avatar-seller
MK2002

Reviews received

Content preview

METHODEN
H1: INHOUD
 Inleiding: belang van methoden, doelstelling van de cursus, inpassing in de leerlijnen, organisatie,
inhoud, examens
 Biomedische vraagstelling en onderzoeksmethodiek
 Studiemateriaal en staalbereiding: humaan organisme, modelsystemen (weefsel, xenograften,
weefselcultuur, celculturen,, modelorganismen), staalbereiding (staalname, (micro)-dissectie en
fractionatie, cel sortering, bewaring en biobanking)
 Basisprincipes van bio-veiligheid: wanneer en waarom dragen we een labo-jas, veiligheidsbril,
handschoenen,…? Klassen van bio-veiligheid; basis van afvalproblematiek.
 Meten en schatten: eenheden en omzetten van eenheden; nauwkeurigheid en meetfouten;
systematische fouten; random fouten; absolute en relatieve fouten; beduidende cijfers; schatten van
grootteorders. Basis van excel (gemiddelde, mediaan,…)
 Elementaire basistechnieken: pipeteren; verdunningen, buffers en fysiologische oplossingen; meten
van de osmolariteit; pH-bepaling; sedimentatie en centrifuge
 Licht- en fluorescentiemicroscoop: fysica van licht en golven, basisprincipes van optica, principe van
de lichtmicroscoop en fluorescentemicroscoop.
 Luminescentie, fluorescentie: principe, toepassingen in biomedisch onderzoek
 Spectroscopie: infraroodspectroscopie, NMR-spectroscopie, massaspectrometrie, UV-zichtbaar licht-
spectroscopie
 Chromatografie: gaschromatografie, vloeistofchromatografie, HPCL,…
 Elektroforese, western blot: principe, toepassingen in biomedisch onderzoek
 Celbiologische methoden: celproliferatie, celdood, migratie, invasiteit, tissue engineering,…
 Analyse van DNA: isoleren, in vitro aanmaken van DNA, concentreren, kwantificeren, manipuleren,
DNA-sequentiebepaling


H2: BIOMEDISCHE VRAAGSTELLING EN ONDERZOEKSMETHODIEK

HET DOMEIN VAN HET BIOMEDISCH ONDERZOEK IS ZEER BREED
Disciplines
 Fysiologie: hoe werkt ons lichaam?
 neurowetenschappen, cardiologie, hematologie, endocrinologie,…
 Pathologie: wat loopt er fout?
 neurodegeneratieve aandoeningen, hart- en vaatziekten, kanker, diabetes, infectieziekten,…


ER IS EEN ZEER BREED GAMMA AAN VRAAGSTELLINGEN
Open exploratief  hypothese-gedreven
 Open exploratief onderzoek:
= onderzoek waarbij we breed gaan zoeken naar een antwoord zonder een specifieke richting te
kiezen. Vb. Hoe beïnvloeden androgenen het ontstaan en de progressie van prostaatkanker?
 onderzoeken welke genen/eiwitten worden geregeld door androgenen in prostaatkankercellen

 Hypothese-gedreven onderzoek:
= onderzoek waarbij we een antwoord vooropstellen (hypothese) en dit toetsen
Vb. Wordt prostaatkanker beïnvloed door androgenen via modulatie van het Ets gen?


1

,  de hypothese is dat Ets hierin een rol speelt deze hypothese kan experimenteel getest worden
Fundamenteel / translationeel / klinisch
 Fundamenteel
= gericht op een gedetailleerde analyse van de moleculaire bestanddelen en processen in de cel en in
het organisme
 Translationeel
= maakt de overgang tussen fundamenteel en klinisch onderzoek
 Klinisch
= patiëntgericht
 optimaliseren van diagnose
 verbetering van behandeling
 nieuw geneesmiddel
PICO principe van ‘evidence-based medicine’
(Patient – Intervention – Controls – Outcome)
Fasen 1 – 4
Analyses in vivo / ex vivo / in vitro / in silico
 In vivo: bepalingen bij levende organismen (bv. lichaamstemperatuur, bloeddruk,… meten)
 Ex vivo: metingen op stalen van een organisme (bv. immuunhistochemie van biopt,…)
 In vitro: metingen in de proefbuis (bv. bepaling van DNA concentratie, PCR reactie,…)
 In silico: analyses met een computer (bv. (re)analyse genexpressiedata,…)


ONTWERP VAN BIOMEDISCHE EXPERIMENTEN


Probleem


Literatuurstudie


onderzoeksvraag /hypothese


biologisch systeem / modelsysteem


bepaling van de variabele (wat meten?)


keuze van methode (hoe?)


uitvoering experiment


herhaling experiment


analyse van de experimenten + statististische testen


formulering van conclusie



2

,TWEE GROTE KLASSEN VAN METHODEN

Methoden voor analyse Methoden voor modulatie
We meten iets We veranderen iets aan het organisme/proefmodel
Voorbeelden: Voorbeelden:
- Klinische analyse (hormonen, metabolieten,…) - Behandeling met inhibitor
- Isolatie, meting, sequentiebepaling van DNA,… - Transfectie met plasmidencectoren
- Analyse van processen (gentranscriptie) - Transgenese
- RNA interferentie


STATISCHE BEPALINGEN VERSUS KWANTITATIEVE, DYNAMISCHE EN VERGELIJKENDE ANALYSE

Statische bepalingen Kwantitatieve, dynamische & vergelijkende analyse
We bepalen iets dat relatief onveranderlijk is of dat We bepalen iets dat makkelijk varieert en een range
discrete waarden (identificatie) geeft van waarden kan hebben
Voorbeelden: Voorbeelden:
- Bepaling van gensequentie - Meting van cholesterolspiegels
- Bepaling van intron-exon boundaries - Meting van suikerspiegels voor en na maaltijd
- Identificatie van interagerende eiwitten - vgl transcriptoom van gezond versus ziek weefsel


VEREISTEN / EIGENSCHAPPEN VAN METHODEN
 Precisie = variabiliteit: maat voor reproduceerbaarheid  standaard deviatie, coëfficiënt van variatie
 Accuraatheid: verschil tussen gemeten waarde en de “echte” waarde  populatiestatistiek
(confidentieniveau / confidentie-interval)
 Detectielimiet = gevoeligheid: kleinste waarde die met een bepaalde gekozen zekerheid kan gemeten
worden
 Analytische range / dynamic range: gebied dat reproduceerbare gegevens geeft
 Analytische specificiteit = selectiviteit: mate waardoor andere componenten in het systeem
interfereren
 Analytische sensitiviteit: maat van verandering in output tov. de verandering in input
 Robuustheid: mate waarin de methode een consistent resultaat geeft ondanks kleine verschillen in
experimentele parameters (bv. pH)


SELECTIE VAN METHODE
Criteria:
 Te meten variabele (bv DNA concentratie, DNA sequentie, eiwitfosforylatie,…)
 Vereiste precisie, detectielimiet (bv hoge versus lage DNA concentraties)
 Aantal stalen / waarden (bv DNA sequentie van 1 PCR product of van het hele genoom)
 Beschikbaarheid apparatuur (bv heb ik een fluorimeter voor DNA bepaling of een colorimeter)
 Kosten (wat kan ik besteden per assay?)
 Veiligheidsrisico’s (mag ik werken met radioactiviteit, virussen?)
 Vroegere / gepubliceerde ervaringen
 Persoonlijke voorkeur




3

, H3: STUDIEMATERIAAL

HUMAAN ORGANISME
 Studies op organisme zelf
Vb. klinische test, beeldvorming
 Fysiologische vloeistoffen (liquid biopsies):
Urine, speeksel, bloed (inclusief cellen), cerebrospinaal vocht (ruggenmergpunctie)
 Weefselbiotopen
Chirurgisch weefsel, naaldbiopten
 Voordelen: meest direct relevant voor geneeskunde
 Mogelijkheden: vgl. gezond versus ziek, voor en na behandeling, individuen onderling, meting van
parameters in functie van leeftijd of uur van de dag,…
 Nadelen: beperkte mogelijkheden voor testing en modulatie

Types studies
 Interventionele / niet-interventionele studie
 Patiënten / vrijwilligers
 Prospectieve / retrospectieve studie
 Cross-sectionele / longitudinale studie

Aandachtspunten bij studie-ontwerp
 Algemeen principe: maximale voordelen, minimale risico’s
 Gezondheid en veiligheid van deelnemers
 Databeheer
– EU General Data Protection Regulation (GDPR)
– Persoonlijke Informatie (persoonlijke, medische, genetische, …)
– Versleuteling stalen en gegevens
– Bewaring, toegang, beveiliging, delen
 Geïnformeerde toestemming en ethische goedkeuring

Ethische goedkeuring bij onderzoek met mensen of menselijk materiaal
 Vrijwillige en geïnformeerde toestemming
– Vrijwillige deelname, deelname kunnen weigeren of stopzetten zonder consequenties
– Begrijpbaar informatieformulier
– Informeren over doel, methode, procedure, voordelen, risico’s, recht op stopzetting
deelname
– Schriftelijke, ondertekende informed consent
– Speciale voorzorgen bij kinderen of kwetsbare groepen
 Goedkeuring Clinical Trial Center en Ethische Commissie UZ Leuven/KU Leuven
– http://www.uzleuven.be/ec/
– Maakt deel uit van arts-patiënt relatie
– Hoofdonderzoeker Good Clinical Practice certificaat
 Declaration of Helsinki
 EU en nationale wetgeving




4

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller MK2002. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $9.43. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

66184 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now

Start selling
$9.43  13x  sold
  • (2)
Add to cart
Added