Samenvatting : An Introduction to Genetic Analysis, ISBN: 9781319114770 Fundamentals of genetics (GEN11806)
All for this textbook (3)
Written for
Wageningen University (WUR)
Biologie
GEN-11806 Fundamentals Of Genetics And Molecular Biology (GEN11806)
All documents for this subject (3)
Seller
Follow
lisabusser
Reviews received
Content preview
Fundamentals of Genetics
Chapter 8
Fenotype: veroorzaakt door veranderingen (mutaties) in DNA
Verschillen DNA tot uitdrukking: transcriptie en translatie
Structuur RNA
Uracil ipv thymine
Ribose ipv deoxyribose
DNA: alleen 3’ OH
RNA: ook 2’ OH
1 streng: kan waterstofbruggen vormen met andere delen van dezelfde streng
Stems (dubbelstengs)
Loops (enkelstrengs, binding eiwitten)
Transcriptie in eukaryoten
1. 2% van het DNA is eiwit coderend
2. RNA polymerase I, II en III
3. Transcriptie vindt plaats in kern
4. DNA is verpakt met eiwitten tot chromatine
GTF’s (general transcriptie factors) brengen RNA polymerase naar start transcriptie
OH aan 3’
Fosfaat aan 5’
Alleen nucleotide aan 3’ OH: RNA groeit van 5’-3’
1 van 2 DNA strengen gebruikt als template
Hoe weet RNA polymerase waar hij moet beginnen?
TATA box – TATA box binding protein
Kristallisatiepunt andere eiwitten
RNA polymerase kan hierin landen
CTD verandert steeds: andere eiwitten kunnen binden – RNA processing
mRNA processing
Capping
M7G: gemethyleerd guanine
Tijdens transcriptie – ongeveer 25 nucleotiden
Bescherming RNA
Bindingsplek voor eiwitten
Polyadenylation
Einde: RNA polymerase schrijft iets te veel over – wordt afgeknipt
Lange staart A nucleotiden door eiwitten
Bescherming RNA
Splicing
Introns worden uit pre-mRNA gehaald
Dmv snRNAs: base paring met mRNA rondom introns
Splice site: begint met GU en eindigt met AG
Hulp andere eiwitten -> spliceosome knipt in het RNA (katalytische activiteit)
Alternative splicing
Verschillende manier aan elkaar knopen exons -> verschillende eiwitten
Exon skipping
,Afbraak mRNA
1. Poly(A) staart en cap worden afbgebroken door eiwitten: mRNA gevoeliger voor afbraak
Afbraak van 5’ -> 3’ en 3’ -> 5’
2. Small interfering RNAs (siRNAs)
Dubbelstrengs RNA moleculen wordt afgebroken door de cel
siRNA past op stuk RNA -> dubbelstrengs
Dicer eiwitcomplex herkent dubbelstrengs RNA – breekt het af tot stukjes van 21 nucleotiden
Beschermt cel tegen lichaamsvreemd DNA (viraal DNA)
RNA interferentie
Dubbelstrengs RNA: gericht RNA vernietigen
Mutaties maken – rol genen in organisme
, Chapter 10
1. RNA isoleren: zonder intronen – mRNA als template
2. Primer tegenaan zetten – reverse transcriptase: RNA -> DNA
3. mRNA afbreken – elkele streng DNA
4. Nieuwe primer met ligase tegenaan zetten
5. DNA polymerase maakt dubbelstrengs DNA
Nucleotidesequentie aan primer: restrictie enzym knipt een deel af -> losse uiteinden
complementair aan ander DNA
Plasmide: extra DNA in bacterie
Losse uiteinden – ander DNA aan plakken -> recombinant DNA molecuul
Plasmide:
Origin of replication
Cloning site met herkenningssite restrictie enzymen
Selectie marker: gen dat codeert voor eiwit om antbiotica af te breken
lacZ met polylinker: kleurt wanneer niet gerecombineerd
PCR
1. Primer op template DNA
2. Denaturatie bij 96 graden (DNA polymerase denatureert)
3. Strengen uit elkaar
4. Primers kunnen binden bij 60 graden
5. Taq polymerase synthetiseert DNA
6. Weer denatureren: nieuwe primers
7. Streng wordt weer verdubbeld
8. DNA scheiden op gel
9. Kleurstof toevoegen: zien waar DNA aanwezig is
DNA sequencing:
Dideoxy sequencing
DNA polymerase heeft OH nodig voor toevoeging volgend
nucleotide
Nucleotiden zonder OH (ddNTP): polymerase
stopt
Geautomatiseerd: fluorescente
dideoxyducleotide labels
Genetic engineering:
1. In vesikels
2. Inspuiten
3. Dmv virussen
CRISPR-Cas9
In bacterie gebruikt om binnendringers te
vernietigen
Stukjes RNA wordt herkend door bacteire en
afgebroken door Cas9
Cas9: kan midden in DNA knippen
1. 20 nucleotiden synthetiseren vooraf aan
plek wat je wil veranderen
2. Cloneren, overgeschreven tot single
guide RNA
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller lisabusser. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.83. You're not tied to anything after your purchase.
