Summary Molecular Biology of the Cell 2 (book) (WBFA007-04)
Summary Regenerative Medicine
All for this textbook (62)
Written for
Universiteit van Amsterdam (UvA)
Psychobiologie
Celbiologie
All documents for this subject (45)
Seller
Follow
amber-cn
Content preview
Samenvatting celbiologie deeltentamen 2
HC1 – Translatie: tRNA en ribosomen (hoofdstuk 6)
- Moleculaire basis Alzheimer
- Afwijkende processing van beta-amyloïd eiwit
- Vorming van eiwitcomplexen (plaques) buiten de cel verstoorde cellulaire
communicatie.
- Door genetische mutaties in het membraaneiwit APP.
- Afwijking van het eiwittransport door tau-eiwitten
- Door hyperfosforylering tau: destabiliseert microtubuli, waardoor er geen of
verminderd transport van eiwitten en blaasjes met neurotransmitters mogelijk
is naar het axon uiteinde.
- Vorming van eiwitcomplexen binnen de cel
- Ophoping van tau-P.
- Ontstekingsreactie/verstoorde neurotransmissie
- Translatie: van mRNA naar eiwit (in het cytoplasma)
- Benodigde onderdelen: mRNA, tRNA met specifiek aminozuur en ribosomen.
- Er zijn 4 belangrijke codons op het mRNA: het startcodon (AUG, methionine) en de
stopcodons (UAA, UAG en UGA).
- Voor één aminozuur kunnen meerdere codons coderen: code is
gedegenereerd.
- tRNA heeft twee belangrijke plekken: het anticodon en het specifieke aminozuur.
- Het anticodon van een tRNA past op het mRNA codon (triplet).
- Wanneer in mRNA de volgorde 5’-UGG-3’ is, is de anticodon
volgorde 5’-CCA-3’.
- De peptideketen wordt gevormd op het ribosoom.
- De 1e base van het anticodon (3e base codon) is een wobble base als de binding die
hij maakt afwijkt van de normale baseparing (G-C en A-U/T).
- Een G kan bijvoorbeeld ook binden met een U (G-U wobble), maar de
binding die ontstaat is minder sterk).
- Wobble basen zijn nodig om de hoeveelheid tRNA die geproduceerd moet
worden te verminderen, doordat één anticodon op twee (of meer) codons kan
binden.
- In tRNA kunnen op de plek van de wobble base andere nucleotiden worden
ingebouwd, bijvoorbeeld inosine (I-wobble).
- Inosine ontstaat vanuit adenine (adenine wordt gemodificeerd) en kan
binden met U, A en C.
- In bacteriën wordt inosine vaker gebruikt als wobble base dan in
eukaryoten
- In tRNA moet een specifiek aminozuur matchen met een specifiek anticodon.
- Het koppelen van de twee wordt gedaan door tRNA-synthetase.
- Herkent het tRNA aan de anticodon regio, herkent het aminzoour en
plakt met behulp van ATP de twee aan elkaar.
- Hetzelfde eiwit zorgt ook
voor het proofreaden
(editen) van de koppeling
van aminozuur aan tRNA.
Het kan het verkeerde
aminozuur weer
verwijderen en net zo lang
doorgaan tot het klopt.
,- Ribosomen
- De ribosomen van eukaryoten en prokaryoten verschillen.
- Bij eukaryoot bestaat het grote deel van het ribosoom uit drie rRNA
eenheden, bij prokaryoot maar uit twee. Bij prokaryoot zijn de rRNA’s ook
korter. Ook zijn er meer eiwitten die binden aan eukaryote ribosomen dan
prokaryoten ribosomen.
- Translatie van prokaryoten en eukaryoten verschilt ook (eerste stap – initiatie).
- Bij prokaryoten: eerst bindt het kleine deel van het ribosoom aan de mRNA
streng, waarna het grote deel erbij komt. Dit kan omdat ieder mRNA een
ribosoom binding site heeft.
- Bij eukaryoten: eerst binden er aan het kleine deel van het ribosoom
verschillende eiwitten, dan met een eiwitcomplex (cap-binding complex) wordt
het kleine deel van het ribosoom aan de cap van het mRNA gebonden.
Daarna gaat dit complex opzoek naar de Kozak consensus, wat het
startcodon in een bepaalde sequentie is waar de translatie begint. Daarna
komt het grote deel erbij.
- Antibiotica zijn remmers van prokaryote translatie.
- Door het verschil in systeem tussen eu- en prokaryoot hebben de antibiotica
geen effect op de translatie van onze eigen cellen.
- Eukaryote eiwittranslatie initatie wordt
gevolgd door elongatie van de
peptideketen.
- In een eiwit wordt de peptidebinding
gevormd tussen een amino-terminus (N)
en een carboxygroep (C).
- Een stopcodon geeft het einde van de
, translatie aan.
- Aan een stopcodon bindt een release factor, waardoor het ribosoom uiteen
valt.
- Incorrecte tRNA’s worden verwijderd van de bindingsplek op het ribosoom: editen
op het niveau van de ribosoom.
- Dit kost GTP en zorgt voor een nog kleinere kans op fouten.
- Meerdere ribosomen kunnen op één mRNA tegelijkertijd aflezen: polyribosomen.
- Kun je met een elektronenmicroscoop zien zitten op het ER.
- Uit één mRNA kunnen dus meerdere keren eiwitten gemaakt worden.
- In neuronen vindt eiwitsynthese ook plaats in het cytoplasma.
- Er vindt transport plaats van mRNA, tRNA en ribosomen naar de axonen en
dendrieten voor lokale eiwitsynthese.
- Microtubuli (transportwegen) zitten door de hele cel heen. Hierop/langs lopen
transport eiwitten (kinesine en dyneine). Kinesine beweegt alleen naar het
plus-einde van de filamenten; dyneine altijd naar het min-einde. Deze
transporteren structuren door de hele cel.
- Vouwing eiwitten
- De primaire vouwing gebeurt tijdens de synthese (translatie), doordat aminozuren
bindingen met elkaar gaan vormen.
- Als de translatie klaar is, kan er een compleet eiwit ontstaan zijn.
- Post-translationele modificatie: de gevouwen peptideketen wordt gemodificeerd
door bijvoorbeeld glycolisering, fosforylering en acetylering.
- Kan nodig zijn om de quaternaire structuur (samenwerking met andere
eiwitten) mogelijk te maken.
- De vouwing wordt nauwkeurig gecontroleerd door chaperonne eiwitten (heat shock
proteins).
- Op twee momenten:
1. Hsp70s (grotere eiwitten) regelen de vouwing direct na het verlaten van het
ribosoom.
2. Hsp60s regelen de vouwing van vrijgekomen eiwitten in
afgesloten “tonnen”
, - Als er iets niet goed is met een eiwit wordt het door het proteasoom afgebroken.
- Als je actieve controle op de hoeveelheid eiwit uit wilt voeren (bijvoorbeeld als een
enzym niet meer nodig is) heb je polyubiquitine nodig als signaal voor eiwitafbraak.
- Het proteasoom herkent het polyubiquitine en breekt het eiwit af.
- Regulatie van de actieve controle van eiwit hoeveelheid: activatie van het UBI ligase
complex, activatie van een degradatie signaal, ligatie UBI aan doelwit eiwit, afbraak
van eiwit met poly-UBI keten.
- Als veel eiwitten in de cel door stress zich ontvouwen: unfolded protein response.
- Alle eiwitten gaan uit hun structuur, waardoor schadelijke effecten van
eiwitophoping voorkomen kunnen worden.
- Samenvatting uit dia (belangrijkste punten):
- Translatie van RNA naar eiwit: mRNA, genetische code, tRNA, Wobble base,
ribosomen.
- Eiwit synthese is nauw een gereguleerd proces van initiatie, elongatie en terminatie:
Proofreading van correcte Aminozuur-tRNA en aminoacyl tRNA-mRNA koppels
- In neuronen ook lokale eiwit synthese in groeiconusse en in dendrieten. Transport
polyribosomen langs microtubuli.
- Regulatie van vouwing door heat shock proteins (hsp70 en hsp60)
- Post-translationele modificaties
- Afbraak van eiwitten: algemeen en door het Ubiquitine-gestuurde Proteasoom.
Ubiquitine-ligase complex
- Link proteasoom afwijkingen en ziektebeelden: Alzheimer, Parkinsons
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller amber-cn. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.85. You're not tied to anything after your purchase.