Samenvatting Molecular Biology of the Cell, ISBN: 9780815344643 en bijbehorende hoorcolleges Celbiologie
18 views 0 purchase
Course
Celbiologie (5102CELB9Y)
Institution
Universiteit Van Amsterdam (UvA)
Book
Molecular Biology of the Cell
Samenvatting van alle benodigde tentamenstof voor alle 4 de deeltentamens van het vak Celbiologie van de opleiding Psychobiologie (UvA). Bestaat uit 4 modules: Module 1 is een samenvatting van een reader aangeboden door de UvA en de bijbehorende hoorcolleges en bevat alle tentamenstof voor het eers...
Alle hoofdstukken die noodzakelijk waren voor het tentamen van de opleiding psychobiologie (uva).
June 24, 2021
95
2020/2021
Summary
Subjects
celbiologie
moleculaire biologie
molecular biology of the cell
Connected book
Book Title:
Author(s):
Edition:
ISBN:
Edition:
More summaries for
Molecular Biology of The Cell, 7th Edition
Summary Molecular Biology of the Cell 2 (book) (WBFA007-04)
Summary Regenerative Medicine
All for this textbook (62)
Written for
Universiteit van Amsterdam (UvA)
Psychobiologie
Celbiologie (5102CELB9Y)
All documents for this subject (45)
Seller
Follow
gittevogels
Reviews received
Content preview
Celbiologie deel 1: Introductie biochemie
Introductie
Leven = Een zichzelf in stand houdend chemisch systeem met Darwiniaanse evolutie capaciteit
- Replicatie -> mutatie -> complexificatie -> selectie
Al het leven is ontstaan uit een supernova
Wat hebben we gemeen met LUCA?
- DNA / RNA
- Vetten
- Eiwitten
- Suikers
Waarmee interacteren moleculen? -> eiwitten
Atomen, moleculen en interacties
Scheikunde = De studie van compositie, structuur en eigenschappen van materialen wat alles met
een massa en wat ruimte inneemt.
In de natuur communiceren moleculen via non-covalente bindingen.
Geschiedenis:
De complexiteit van het leven komt door de chemische bindingen (interacties) van de individuele
atomen die samen moleculen vormen.
- Covalente binding = Wanneer twee atomen een binding hebben.
o Doel : Nobelgas vormen (buitenste schil vol met elektronen)
,Hoe komen deze hoeken tot stand?
- Orbitals : De ruimte waarin een molecuul kan bewegen in de ruimte. Deze ruimte heeft een
90% kans dat je daar een elektron gaat vinden.
o We spreken van de kans door de golffunctie van een deeltje (golf-deeltje wisseling)
- Elke orbital kan maximaal twee elektronen in zich hebben, hij kan er dus 0,1 of 2 hebben.
Orbitals:
1. S-orbitals = hebben een bolle vorm
2. P-orbitals = Hebben een langwerpige vorm
a. 3 dezelfde p-orbitals. Deze zitten op 3
assen, omdat ze elkaar allemaal
wegduwen want ze hebben allemaal
een negatieve lading.
Ze worden genoteerd als: 1s, 2s en 2p. Het nummer geeft de energie en grootte aan van de orbital en
de letter geeft de vorm aan.
1s = S- orbital van de eerste schil
1s (1)
Vb. B (5 elektronen) : 1s2 2s2 2p1 2s (2) 2p (3)
3s (4) 3p (5) 3d (7)
Aufbau principe: 4s (6) 4p (8)
Argon (Ar) is Neon met nog 8 elektronen erbij, dus Ar : [Ne] 3s2
3p6
Neon = 1s2 2s2 2p6
,Alkanen:
- Ground state (laagste energie) : Hierbij zijn er maar twee P-orbitals bezet met elk maar één
elektron en de S-orbitals hebben elk wel twee elektronen. Om een moleculaire binding te
maken moet je in elke orbital 2 elektronen hebben.
- Excited state : Hierbij heeft alleen 1s twee elektronen en alle andere schillen één elektron en
dus vier ongebonden elektronen. Dus heeft een atoom 4
valentie elektronen.
Om te zorgen dat ze elektronen kunnen delen in een binding
moeten de atomen overlappen.
a) Overlap van twee 1s waterstof orbitals
b) Overlap van een koolstof 2p en een
waterstof 1s orbital
Vb. methaan (CH4)
- Je kunt niet alle orbitalen zo met elkaar
optellen omdat koolstof hybrid-orbitalen heeft. Dit zijn gemixte orbitalen van s en p.
o Hybridisatie = Maken van nieuwe orbitalen door lineaire vergelijkingen te
combineren van atomische orbitalen van koolstof.
1x 2s orbitalen + 3x 2p orbitalen = 4 identieke orbitalen ->
perfecte tetraëder
- Sp3-hybridisatie
o Iets meer elektron donerend
- Alle 4 deze schillen zijn negatief geladen en duwen elkaar dus weg, hierdoor krijg je de 109,5
graden hoek.
o C-H binding = 1x 1s orbital met 6 sp3 orbitals
o C-C binding = de overige 2 sp3 orbitals
σ -> Enkele bindingen
Zijn de sterkste moleculaire binding en hebben symmetrie. Dat is waarom alkanen meerdere
structuurformules hebben (conformaties).
➔ Wanneer je door de as kijkt van de C-C binding krijg je de Newman projectie van de meest
stabiele conformatie.
- Staggered conformatie = Alle waterstof moleculen zo ver mogelijk uit elkaar
o Lager in energie dan eclipsed
- Eclipsed conformatie = De waterstof moleculen heel dicht op elkaar
Normaal moet een koolstof atoom 4 bindingen hebben, tenzij je een dubbele binding hebt.
, Koolstof:
- Elektropositief = Een gas wil elektronen kwijt om te zorgen dat hij een edelgas is, dus de hele
buitenste schil vol.
- Elektronegatief = Een gas wil een elektron erbij om ook te zorgen dat het een edelgas wordt.
o Koolstof : Eigenschappen van allebei. Het kan in een vorm komen waarbij het
elektronen wil ontvangen maar ook afstaan.
- Kan meerdere omringen hebben en zijn allemaal stabiel.
o Gaat bindingen aan met andere atomen om zo de edelgas configuratie te krijgen.
▪ Ook met zichzelf = dubbele binding of drievoudige binding
In het periodiek systeem zijn alle edelgassen links van
koolstof elektropositief en rechts van koolstof
elektronegatief
Atomen:
- Elektron affiniteit : Hoe graag willen ze een elektron
o Ligt aan de hoeveelheid elektronen in de buitenste schil
- Elektronegativiteit : Wat is de kans dat een atoom de elektronen naar zich toe trekt wanneer
een atoom zijn elektronen deelt met een ander atoom
o Iets is meer elektronegatief wanneer het meer protonen heeft en dus een sterkere
aantrekkingskracht naar de elektronen toe, want positief en negatief trekken elkaar
aan.
Periodiek systeem ga je van links naar rechts dan is iets meer elektronegatief en van boven naar
beneden minder elektronegatief.
π binding : -> Voor dubbele of driedubbele bindingen
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller gittevogels. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $13.38. You're not tied to anything after your purchase.
