Class notes
Tema 2: Transcripció en procariotes
- Course
- Institution
Apunts de classe (Apunts de classe)
[Show more]
Seller
Follow
mariaisamat
Content preview
TEMA 2: TRANSCRIPCIÓ EN PROCARIOTES1. DOGMA DE LA BIOLOGIA MOLECULAR
→ Transcripció és la síntesi de qualsevol RNA a partir de DNA.
- Tot el RNA de la cèl·lula (endogen, que no provenen de virus)
ve del DNA.
- Es molt diferent entre procariotes i eurcariotes, sobretot del
mRNA
→ Amplificació: En algunes plantes es dona la amplificació del RNA(sobretot en RNAs
d'interferència)
→ Retrotranscripció: La transcriptasa inversa dels retrovirus i dels retrotransposons
permet passar de RNA a DNA.
→ Replicació: De DNA i RNA
→ En principi no es pot passar de DNA a proteïna directament.
2. ORGANITZACIÓ DEL PROMOTOR
Seqüències consens: es construeixen fixant una posició i col·locant, de les 4 bases, la
més freqüent en aquella posició concreta, per un fragment determinat. (els nº indiquen la
freqüència amb la que es presenta la base)
El promotor és la seqüència de DNA on s'uneix RNA polimerasa (RNAP). Té 3
regions:
• Downstream: el que va en sentit de la transcripció (nº positiu)
• Lloc +1: inici de la seqüència a transcriure, normalment és una A o una G ( sempre
purines). Per davant i darrera del lloc d’inici hi ha una C i una T respectivament.
• Upstream: el que va en sentit contrari de la transcripció (nº negatiu). Es on es troben els
promotors dels seus respectius gens.
Regió -10 o Caixa Pribnow: seqüència (hexàmer) rica en AT (no confondre amb la caixa
TATA d’Eucariotas). Es el punt d’obertura que permet la transcripció, La RNA polimerasa
obrira la doble hèlix en una volta i començara a transcriure.
• Punt d'obertura de les cadenes de DNA per part de la RNAP (si l'eliminem es per a la
transcripció completament)
• És un regió molt conservada (TATAAT), més fàcil d'obrir que no CG
Regió -35: no està tan conservada com la regió -10., també és un hexàmer.
- Promotors dèbils:
- Promotors forts:
,Quan el promotor té una seqüència diferent que la consens la polimerassa es podra unir
igual pero amb una interacció dèbil, serà menys eficient i es produiran menys molecules.
= Promotor DÈBIL
EX: Laci, es un reversor de l’operador lac, es necesita en baixes quantitats i per això la
seqüència és molt diferent a la consens.
✓ Recordar que el nivell conservació marca la força de promotor. Els promotors forts
(com els de ribosomes o tRNA) tindran una seqüència molt similar a la consens.
Cadena sentit o Cadena + (no confondre amb la Cadena + de replicació): és la
cadena que té el mateix missatge que el mRNA, excepte amb el pas de T a U.
→ És a dir, quan es faci la transcripció la seqüència que veurem és la de la cadena amb
sentit, per la tant és la cadena antisentit la qual actua de motlle, la cadena amb sentit és
la que és apartada.
3. ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DE LA RNA POLIMERASA
Enzim molt gran amb estructura
quaternària. En E. Coli ha 2 RNAP (la
RNAP que sintetitza tot l'RNA, excepte
els fragments d'Okazaki que els
sintetitza la primasa).
, El centre actiu té àtoms de Mg per apantallar càrregues: un catió bivalent és necessari per
a la funció de la majoria de polimerases d'àcids nucleics (el tampó TAE elimina aquests
ions anul·lant la seva funció).
EDTA: quelant per tapar cations divalents com el Mg i el Zn, de
manera que la RNAP no pot funcionar.
3.1. SUBJECCIÓ I ENTRADA DEL DNA
Les RNA polimerases tenen forma de mà o pinça:
La β' (rosa) té un 'dit de Zn' (amb àtoms de Zn), que
és una estructura típica de subjecció i unió a l'ADN.
Hi ha un canal de 27 Å format per β’ i β: és
important perquè
l'amplada de l'hèlix encaixi de forma correcta.
Distància entre les dues
pinces β és de 110 Å.
Dins el canal s'obren aproximadament 1.5 voltes de
DNA, mentre que el fragment es subjecta per
aproximadament 0.75 voltes a cada costat (amb els
dits de Zn) el canal és més ample pel centre per
allotjar les voltes obertes (en total són 3 voltes).
Per produir-se una unió específica es necessita el factor sigma.
Llavors, un cop el DNA està unit, les pinces es tanquen deixant una
distància petita, però l’estructura global no canvia.
La subunitats α1 i α2 tenen dominis C-ter (CTD) (representats en
forma de boles a la imatge) estabilitzen les subunitats α i tota la
proteïna i intereccionen amb la regió -45 - -55.
o En el mecanisme d'activació de la transcripció per catabòlit, quan la proteïna CAP
s'uneix als CTD, els fa encara més estables, de manera que activa la transcripció.
❖ COMPLEX TANCAT:
EL factor sigma reconeix al promotor, es situa dins el canal de la polimerasa, i quan
s’uneix el DNA les pinces es tanquen. El reconeixament no implica la obertura de la doble
hèlix.
El factor sigma (sigma 70) té 4 dominis globulars de la mateixa cadena polipeptídica:
➢ El domini 1: Interacciona feblement, no existeix en algunes espècies de sigma (per
darrere a la imatge)
➢ El domini 2 Reconeix -10. El més important.
➢ El domini 3 Reconeix l'element estès de -10 (la seqüència -10 és més llarga del que es
pensava)
➢ El domini 4 Interacciona amb -35
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller mariaisamat. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $6.11. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
82871 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now