Class notes
College aantekeningen Bioinformatica LS 20/21 (TLSC-BID3V-17)
- Course
- Institution
Samenvatting van de colleges van het vak bioinformatica wat wordt gegeven in het 2e jaar van de opleiding life sciences.
[Show more]
Seller
Follow
laaaartjex
Reviews received
Content preview
lOMoARcPSD|4306819Gedownload door Lara vd Linde (Lara2001@casema.nl)
, lOMoARcPSD|4306819
Gedownload door Lara vd Linde (Lara2001@casema.nl)
, lOMoARcPSD|4306819
Samenvatting bioinformatica
Links
Gebruiken om restrictie-enzymen op te zoeken. Voeg het restrictie-enzym in de ‘SEARCH NEB’.
https://international.neb.com/
In Pubmed staat het originele artikel waarin deze sequentie (X80055.1) beschreven staat.
Gebruiken voor blast-analyse (inzichtelijk maken)
Gedownload door Lara vd Linde (Lara2001@casema.nl)
, lOMoARcPSD|4306819
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Voor het verkrijgen van het reverse-complement http://www.bioinformatics.org/sms/rev_comp.html
Hierbij worden alle coderende sequenties aan elkaar gemaakt. Dus geen intronen. Wel uit hetzelfde gen.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast
Alfabetisch gerangschikte commands. https://ss64.com/bash/
Officiële Linux pagina.
http://www.gnu.org/software/coreutils/coreutils.html
Genome browser. Deze databank bevat de complete genomen van verschillende organismen, waaronder
mensen. Als er een nieuwe versie van een genoom gesequenced is komt deze terecht in de USCS databank, alsmede
verbeterde versie van bestaande genomen. Het humane genoom is al vijf keer vernieuwd door verbeterde sequentie-
technieken. Deze databank bevat verschillende opties waaronder een “genome browser” waarin je overzichtelijk alle
genen per chromosoom kan zien + vele extra’s. Je kan ook je eigen data uploaden in parallel met een genoom, zodat je
datasets over elkaar kan leggen.
http://genome-euro.ucsc.edu/
Search translation EMBOSS transeq
https://www.ebi.ac.uk/services
Hierbij kan je DNA omzetten in aminozuren https://www.ebi.ac.uk/Tools/st/emboss_transeq/
Voor het vinden van het isoelectrisch punt en Molair weight. https://web.expasy.org/compute_pi/
Voor het zoeken van pathways in de cellen. Eerst een lijst met pathways en dan klik je de juiste aan. En alle kaarten
zijn in teractief als je klikt op KEGG pathways 6. Human diseases acute myeloid leukemia. HELP voor legenda
https://www.kegg.jp/
NCBI structure
Gedownload door Lara vd Linde (Lara2001@casema.nl)
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller laaaartjex. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.98. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
64438 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now