Summary
Samenvatting van Cel II: biochemie AJ
- Course
- Institution
Samenvatting van Cel II: biochemie AJ gedetailleerde samenvatting
[Show more]
Seller
Follow
medstudnt
Reviews received
Content preview
Biochemie Prof. GettemansDe cel: fundamentele concepten, structuur en functie Partim biochemie
1. Hoofdstuk I - zwakke krachten en hun rol in de biochemie
(MCB 2.1)
1.1. Waterstofbruggen tussen watermoleculen
• Levende organismen: 70-80% water
• Grote ENW van O-atoom ⇒ het zuigt het gemeenschappelijk elektronenpaar van covalente
binding met H- atoom naar zich toe ⇒ partieel negatief geladen O-atoom + partieel positief
geladen H-atomen ⇒ polariteit met dipoolmoment
è oriëntatie watermoleculen: vrije e-paar van O-atoom richt zich naar H-atoom van nabije
watermolecule
è Er ontstaat een zwakke interactie = H-brug (echter: geen elektronen gedeeld à lagere
bindingsenergie dan O-H)
è Ook de afstand tussen de atomen is verschillend à covalent = 1.2 Å en H-brug = 2.7 Å
è Dynamisch netwerk van water (à hoge kookpunt)
1.2. Waterstofbruggen tussen biomoleculen met geschikte functionele groepen (-OH,
-NH2, C=O, -CONH2) à met elektronegatief karakter
• Functionele groepen à H-bruggen vormen à goede oplosbaarheid in water = hydrofiel
è Molecuul dat waterstof ‘aanneemt’ = waterstofbrugacceptor
è Molecuul dat waterstof ‘aanbiedt’ = waterstofbrugdonor
(Zie vb. p. 9 cursus prof. Gettemans)
1
,Biochemie Prof. Gettemans
1.3. Ionaire binding
• ΔEN groot à overgang e-paar van waterstofbrugdonormolecule naar meer EN atoom/molecule
è ontstaan anion + kation (Zie vb. p. 10 cursus prof. Gettemans)
• I.t.t. covalente binding en H-brug is aantrekkingskracht onafhankelijk van richting; bepaald
door omgevingsfactoren, m.n. diëlektriciteitsconstante D
(voorbeeld: in water groter dan in vacuüm: doorlaatbaarheid ‘stroom’ in een medium ~ 1/D)
• Door dipoolkarakter van water à ionen goed oplossen: partieel negatieve ladingen richten zich
naar positieve lading van bv. metaalionen
è Ze krijgen een watermantel + hydratatie-energie komt vrij
1.4. Van der Waalsinteracties (= vdW)
• In niet-polaire moleculen à tijdelijke inductie van dipool à zwakke interactie, afh. van afstand
• Elk atoom neemt een bepaald volume in
è Te dicht: sterke afstoting (ze dringen elkaars volume binnen)
è Te ver: te zwakke kracht
è Optimale afstand: Van der Waalsradius (~ 2 keer de afstand van de covalente binding)
è Geringe energie; toch belangrijk
è Herkenning & binding van de juiste partners is belangrijk à complementaire stapeling (cf.
sleutel-slotsysteem)
2
,Biochemie Prof. Gettemans
1.5. Hydrofoob effect
• Hydrofobe verbindingen (moeilijk oplosbaar in water)
è Energetisch ongunstige situatie als één molecule in water wordt gebracht à verstoring
van het waternetwerk
è Minder ongunstige situatie als meerdere moleculen in water worden gebracht à
hydrofoben associëren met elkaar à hydrofobe oppervlakte wordt kleiner
Voorbeeld: spinnenwebben hebben hydrofobe Van der Waalsinteracties
1.6. De totaalsom
• Bovenstaande interacties = zwak
• Echter: transiënte stabilisatie = som van individuele bijdragen van alle zwakke interacties;
afzonderlijke krachten werken ook samen; ze zijn dus afhankelijk van elkaar (de één is het
gevolg van het ander)
è Dubbelstrengig DNA geeft aanleiding tot vormen van membraanstructuur à H-
brugvorming + hydrofobe krachten
è 3D-structuur van eiwitten à H-brugvorming + van der Waals interacties + hydrofobe
reacties
• Ruimtelijke en fysicochemische complementariteit is nodig voor herkenning
è De vormen van hun oppervlakken moeten gelijk zijn + de groepen moeten energetisch
gunstige interacties kunnen aangaan
è Nadelig: 2 gelijke ladingen tegenover elkaar, lading tegenover hydrofobe groep, geen
vormelijke complementariteit
(Zie ook figuur 1.6 op p. 14 cursus prof. Gettemans en fig. 2-24 in MCB)
3
, Biochemie Prof. Gettemans
2. Hoofdstuk II - lipiden en cellulaire membranen (MCB 10)
2.1. Inleiding
• Klassen organische macromoleculen (in de cel zelf gesynthetiseerd):
è Eiwitten
è Polynucleotiden
è Suikers
è Vetten (= lipiden)
• Lipiden
è Hydrofoob (soms hydrofiel gedeelte)
è Functies
1. Brandstof (cellulaire energiebron
2. Signaalmolecule
3. Onderdeel van biologische membranen
è 3 belangrijkste groepen in de membranen:
o Fosfolipiden
o Glycolipiden
o Cholesterol
• Ziektes door een probleem met lipiden:
è Multiple sclerosis (MS) = verlies van plasmalogen (lipide) uit myeline à demyelinisatie
(oogproblemen)
o Ether ipv ester in plasmalogen
è Hartaandoeningen: antilichamen tegen fosfolipiden à AUTOIMMUUNZIEKTE
(= aandoening waarbij jouw antistoffen je lichaamseigen componenten aanvalt)
è Alzheimer: verhoogde afbraak van membraan fosfolipiden
4
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller medstudnt. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $13.71. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
64438 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now