Exam (elaborations)
Zelfstudie opdracht 1: moleculaire biologie (vraag en antwoord)
- Course
- Institution
- Book
verbetering van zelfstudie opdracht 1 van moleculaire biologie: Is door de prof verbeterd!
[Show more]
Connected book
Book Title:
Author(s):
- Edition:
- ISBN:
- Edition:
Seller
Follow
lemmeslodders
Reviews received
Content preview
Moleculaire biologie Prof. Dr. Van Camp2e Ba BMW
ZSO 1: DNA REPLICATIE
Leermiddelen:
Diverse leermiddelen zijn terug te vinden op blackboard bij het vak Moleculaire biologie onder
de tab studiemateriaal en omvatten:
Tekst handboek: ‘DNA replication text’
Slides: ‘DNA replication slides’
Video-animatie: ‘DNA replication process (3D animation)’
Het aangeboden materiaal dient alvorens de zelfstudieopdracht te maken grondig doorgenomen
te worden.
Doelstellingen:
De student kan het proces van DNA replicatie beschrijven.
De student kan de functie van de verschillende proteïne en enzymen betrokken bij DNA
replicatie omschrijven.
De student kan de bijbehorende moleculair genetische terminologie verklaren en
gebruiken.
Instructie:
Algemene vragen:
Leg uit hoe DNA replicatie start en wat de functie is van de verschillende proteïnen die
bij DNA replicatie betrokken zijn.
DNA replicatie start bij de replicatie oorsprong. Daar ontstaan telkens 2 replicatievorken
doordat de DNA strengen ontwinden bij de oorsprong. De eukaryote cel heeft lange
chromosomen en om het snel te doen verlopen, zijn er meerdere replicatieoorsprongen.
DNA helicase gaat helpen bij het scheiden van de DNA strengen aan elke replicatievork
en het verplaatst zich in de 5’->3’ richting van de te vormen DNA streng. Het enzym
maakt gebruik van energie afkomstig van ATP om de DNA strengen te kunnen
ontwinden en de replicatievork voort te laten bewegen. Het scheiden (ontwinden) van
de DNA strengen leidt tot ‘supercoiling’ ( te vergelijken met de draad van de oude
huistelefoons dat sterk gaat winden) .
Het enzym DNA topoisomerase gaat dit probleem oplossen / vermijden door de drang
voor ‘supercoiling’ op te heffen.
Het is belangrijk dat de DNA strengen ontwonden / gescheiden blijven totdat de
complementaire dochterstreng volledig gevormd is. Omdat zo de streng kan dienen als
1
ZSO 1: DNA replicatie
, Moleculaire biologie Prof. Dr. Van Camp
2e Ba BMW
template en de complementaire basen kunnen zich er dan aan binden. Het enzym “
enkelstreng bindende proteïnen “ zorgt hiervoor.
Het enzym DNA polymerase, is verantwoordelijk voor het covalent aan elkaar binden
van nucleotiden zodat de DNA streng gevormd wordt. Bij de katalitische positie
verbreekt DNA polymerase de binding tussen de eerste en tweede fosfaatgroep en bindt
de resulterende nucleotide met 1 fosfaatgroep ( deoxynucleoside monofosfaat) aan de 3’
einde van de vormende dochterstreng aan de hand van fosfodiesterbinding. De energie
die nodig is om de onderlinge nucleotiden covalent met elkaar te binden, is afkomstig
van het verbreken van de covalente binding ( deoxynucleoside trifosfaat ->
deoxynucleotide monofosfaat) waarbij pyrofosfaat vrijkomt ( exothermische reactie) . De
pyrofosfaat wordt verder afgebroken tot 2 fosfaatgroepen.
DNA polymerase kan enkel zijn functie beoefenen als er al een stukje DNA of RNA streng
verbonden is aan de template. Als die template aanwezig is , zal DNA polymerase de
dochterstreng verder synthetiseren. Het enzym nodig voor de aanmaak van het stukje
DNA of RNA streng ( in geval van eukaryote cel is het een RNA streng) is “ DNA
primase”. Het stukje complementaire RNA streng van 10 à 12 nucleotiden lang wordt
een RNA primer genoemd. Eenmaal de synthese is gestart kan DNA polymerase , Dan
enkel synthetiseren in de 5’->3’ richting.
DNA ligase gaat de losse DNA strengen aan elkaar binden bij de Okazakifragmenten. Het
vult de plek van de RNA primers die eruit geknipt zijn door de DNA polymerase.
Wat wordt er bedoeld met bidirectionele replicatie?
Met bidirectionele replicatie bedoelt men dat de replicatie in 2 richtingen gebeurt ( links
en rechts). Het gebeurt bij beiden strengen. De ene is de leading en de ander is de lagging
strand.
Leg het verschil in vorming van de leading en lagging strand uit.
Leading strand:
Wordt in dezelfde richting gesynthetiseerd als de voortbewegingsrichting van de
replicatievork. Er wordt één continue streng aangemaakt.
Laggingstrand :
Wordt in de tegengestelde richting gesynthetiseerd als de voortbewegingsrichting van
de replicatievork. Er worden telkens verschillende stukjes strengen aangemaakt met
telkens een RNA primer aan de 5’ uiteinde in plaats maar van 1 RNA primer zoals bij de
leading strand. De aparte strengen worden Okazaki fragmenten genoemd. Deze worden
aan elkaar verbonden tot een continue streng wanneer eerst de RNA primers verwijdert
worden door DNA polymerase I en deze enzym zal vervolgens de lege gebied terug
opvullen met DNA. Het enzym gaat dan de opeenvolgende Okazaki fragmenten covalent
met elkaar binden zodat er een continue streng wordt gevormd.
Bespreek het mechanisme dat bepalend is voor de accuraatheid van het replicatie
proces.
Er gebeuren heel veel fouten tijdens de DNA replicatie, maar zeer weinig permanente
fouten. Dit komt doordat de DNA polymerase een proofreading uitvoert in de 3’->5’
2
ZSO 1: DNA replicatie
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller lemmeslodders. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $6.14. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
66579 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now