Dit zijn uitgebreide aantekeningen met plaatjes die zorgen voor verduidelijking van de onderwerpen. Universiteit utrecht, jaar 1 biologie, vak: PMO.
Deze aantekeningen van de kennisclips bevatten de volgende onderwerpen: RNA polymerase, σ factoren in E. coli, regulatie eiwitten, negatieve en po...
Summary of unit 8, the ecology of life - Biology, a global approach, 12th edition
Samenvatting Biology chapter 19, 20, 21, 22, 23
Samenvatting Biology chapter 13, 14, 15, 16
All for this textbook (36)
Written for
Universiteit Utrecht (UU)
Biologie
Planten En Micro-organismen
All documents for this subject (38)
Seller
Follow
guillaine2000
Reviews received
Content preview
Kennisclips Regulatie
• Er vindt regulatie plaats op transcriptie, translatie en eiwit niveau → dit geldt voor alle
organismen
Prokaryoot vs eukaryoot
• Prokaryoten hebben een operon structuur (meerdere genen die afgeschreven worden vanaf een
enkele promotor → polycistronisch) en kunnen ook monocistronisch zijn
• Bij eukaryoten wordt er grotendeels maar 1 gen afgeschreven per promotor (monocistronisch)
• In prokaryoten is translatie en transcriptie gekoppeld
• Eukaryoten kunnen mRNA processen; introns, splicing, capping, transport vanuit de kern
RNA polymerase
• Bacteria heeft 1 soort van 5 subunits
• Archaea heeft 1 soort van 11-13 subunits
• Eukaryoten hebben 3 soorten van 12 of meer subunits
• Archaea en eukarya herkennen de TATA box en hebben een transcriptie factor nodig
RNA polymerase; bacteria
• Holoenzyme (gehele enzym) bestaat uit 4 subunits: β β’, α, ω, σ
• Geen algemene transcriptie factoren nodig
• σ factor is betrokken bij de promotor herkenning
(daarna kan de rest binden)
• Core enzyme: β β’, α, ω is betrokken bij de elongatie
→ Terwijl het RNA nog wordt afgeschreven wordt het
al afgelezen door ribosomen
• De σ factor herkent 2 sequenties waarvan één 35
nucleotiden (Consensus → TTGACA) en de ander
10 nucleotiden (Pribnow box → TATAAT) van de
transcriptie start
• Na het herkennen bindt het holoenzyme aan de
promotor waardoor de transcriptie kan beginnen
• De σ factor laat los en het core enzym gaat verder
met de transcriptie en maakt mRNA tot het bij de
transcriptiestop komt
Alternatieve σ factoren in E. coli
• σ 70: algemene σ factor waar de meeste promotors door herkend worden; transcriptie van
huishoud genen
• Er worden ook andere alternatieve σ factoren gemaakt onder bepaalde condities, die dan
ingeschakeld worden → deze concurreren met σ 70 waarbij ze binden aan de rest van RNA
polymerase en een andere set van promotors aanzetten die betrokken zijn bij de situatie
• Herkennen van andere sequenties
, DNA-bindende regulatie eiwitten
• Door te binden aan promotors in het DNA, de transcriptie blokkeren of laten verlopen
• Herkennen een speciale sequentie en vormen meestal dimeren → de sequentie is hierdoor vaak
een inverted repeat
• DNA sequenties zijn vaak inverted repeats
• In bacteriën is er vaak een helix-turn-helix motief (e.g. in het LacI repressor); bestaat uit een
helix die de sequentie in het DNA herkent, er aan bindt en de gen expressie reguleren, en een
helix die het motief stabiliseert
Positieve en negatieve regulatie
• Positieve regulatie:
- Is een activator die transcriptie mogelijk maakt → zonder activator geen transcriptie
- De activator reageert op een signaal (de effector) die de activator reguleert
- Activator bindt aan acitvator-binding site en transcriptie kan plaatsvinden
• Negatieve regulatie
- Is een repressor die de transcriptie blokkeert → als de repressor uitgeschakeld is, is er
transcriptie
- De repressor bindt aan een bepaalde sequentie → de operator
- Effector reguleert de repressor
- Repressie en inductie
Rood = Activator-binding site Geel = Operator
• Het LacI gen zorgt voor de transcriptie van de repressor
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller guillaine2000. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.24. You're not tied to anything after your purchase.
