Summary
Samenvatting zelfstudie EBC
- Course
- Institution
- Book
Samenvatting van alle zelfstudiestof van EBC
[Show more]
Connected book
Book Title:
Author(s):
- Edition:
- ISBN:
- Edition:
More summaries for
-
Test Bank to Accompany Essential Cell Biology, Alberts,5e
-
Essential Cell Biology Chapter 1,2,4,5,7&8 (Alberts)
-
Essential Cell Biology 5th Edition Chapter 1 Review
Seller
Follow
lonnekespek
Reviews received
Content preview
Zelfstudie 1Signal transduction depends on molecular circuits
1. Vrijlating van primaire messengers → door een trigger bv. wond
2. Ontvangen van primaire messenger → aan membraanreceptor die conformatie
ondergaat en informatie van omgeving naar inhoud van cel stuurt
3. Heruitzending door second messenger → worden geactiveerd door
conformatieverandering van receptor
a. Consequenties van second messengers:
b. Kunnen door heel de cel diffusseren en bv. genexpressie beïnvloeden
c. Signaal kan geamplificeerd worden, lage concentratie van signaalmoleculen
in omgeving kan dus grote intracellulaire signaal en reactie opwekken in cel.
4. Activatie van effectors die direct de fysiologische reactie veranderen, zoals pompen
en enzymen transcriptiefactoren
5. Verwijdering van signaal. Anders verliezen cellen hun reactie op nieuwe signalen, of
krijg je ongecontroleerde celgroei en kanker
Eicosanoid hormones are derived from polyunsaturated fatty acids
- Arachidonate, 20:4 vetzuur van linolaat
- Alle signaalmoleculen die hieruit afstammen heten
eicosanoids omdat ze 20 C-atomen hebben
- Het zijn lokale, autocriene, kort levende hormonen
- Prostaglandine stimuleert onder andere: inflammatie,
bloeddoorstroming naar organen, ion transport across
membraan, moduleren van synaptische transmissie
en induceren van slaap.
Steroid hormones are crucial signal molecules
- Binden en activeren transcriptiefactoren
- Androgene → mannelijke secundaire kenmerken
- Testosteron gereduceerd naar dihydrotestosteron
- Estrogens → vrouwelijke secundaire kenmerken
- Glucocorticoïden → gluconeogenese en opbouw
glycogeen
- Mineralocorticoïden (aldosteron) → bloeddruk
Gene expression is regulated by hormones
, - Nucleaire hormoon receptoren zijn oplosbaar want zitten in kern ipv membraan en
reguleren genexpressie door aan reguliere DNA sequentie te binden.
- Hebben 4 domeinen: amino terminal activation domain (AF1), DNA binding domain,
hinge domain(stuurt receptor naar nucleus) en ligand-binding domain met activatie
domain (AF2)
- Zinc-finger domains: cysteïne residuen in DNA binding domain binden zink ionen in
DNA
- Ligand binding allows de receptor om andere eiwitten aan te trekken die transcriptie
faciliteren door interactie met de activatie domeinen
- Coactivators(p16 familie): eiwitten die binden nadat ligand gebonden heeft. Samen
met andere eiwitten modificeren ze chromatine en de transcriptiemechanismen om
genexpressie te reguleren
- Als er geen ligand is dan zijn corepressor eiwitten gebonden aan binding domein van
coactivators op receptor. Als ligand bindt, ontbindt corepressor en kunnen
coactivators binden
- Agonisten binden aan nucleaire hormoonreceptor en activeren signaaltransductiepad
en antagonisten inhiberen juist dit pad.
Q: ze moeten door membraan heen
Receptor proteins transmit information into the cell
- Ongeactiveerd heeft G-protein GDP(een soort guanyl nucleotide) gebonden en is het
een heterodimeer van alfa, beta en gamma subunits. Alfa bindt de nucleotide.
- Ligand bindt aan receptor en dit complex interacteert met het G-protein en opent de
nucleotide bindingssite, waardoor GDP eruit gaat en GTP kan binden aan
bindingssite → alfa subunit laat los van beta en gamma → Galfa bindt aan adenylate
cyclase etc….
- 15 genen coderen voor Galfa, eentje wordt algemeen expressed en de andere
worden expressed in specifieke celtypen
- Galfa subunits hebben intrinsieke GTPase activiteit waardoor ze hun eigen GTP
kunnen hydrolyseren tot GDP. Dit gebeurt spontaan. AlfaG met GDP bindt dan weer
aan beta en gamma G
- Receptor gaat weer terug naar oude vorm doordat ligand loslaat. De kans dat de
receptor in ongebonden vorm blijft, hangt af van de concentratie van ligand in
omgeving
Q: cAMP en IP3 zijn vrij en DAG blijft in membraan
Q: in verschillende celtypen activeert PK-A verschillende andere eiwitten
Calcium ion is a ubiquitous cytoplasmic messenger
- Calmodulin wordt geactiveerd door binding van Ca²⁺ aan zijn 4
bindingssites, wanneer de cytoplasmatische calcium level is verhoogd
- Calmodulin is een EF-hand eiwit.
- Ca²⁺-calmodulin complex stimuleert een wijde variëteit aan enzymen,
pompen en andere eiwitten
- Targets van Ca²⁺-calmodulin complex zijn CaM kinase en Ca²⁺-ATPase
pomp(pompt Ca²⁺ de cel uit)
,Some receptors dimerize in response to ligand binding and recruit tyrosine kinases
- Conformatie van GPCR is een verandering in tertiaire structuur en dimeer vorming is
verandering in quaternaire structuur
- Voorbeeld groeihormoon receptor. Één groeihormoon bindt aan het extracellulaire
domein van 2 receptoren, waardoor die dimeriseren. Extracellulaire domeinen komen
hierdoor ook bij elkaar en ook de daarbij geassocieerde tyrosine protein kinases, die
aan elk intracellulair domein is gebonden. Hierdoor fosforyleren ze elkaar(cross
fosforylatie) waardoor de kinases worden geactiveerd die weer andere eiwitten
fosforyleren.
- Sommige groeifactoren(zoals EGF) binden aan de extracellulaire domeinen van
transmembrane receptoren die tyrosine kinase domeinen in hun extracellulaire
domeinen hebben. Deze receptor tyrosine kinases (RTKs) signaleren op dezelfde
manier als hierboven. Plaatje laat specifiek zien voor EGF.
- Grb-2 is een adaptor eiwit.
- Uiteindelijk worden kinases geactiveerd
- Sos is een guanine-nucleotide exchange factor (GEF). Opent de nucleotide-binding
pocket van RAS waardoor GDP eruit gaat en GTP erin
- Ras valt onder de kleine G-proteïnen(small GTPases) → reguleert celgroei.
- Wisselen tussen GDP en GTP gebonden en zijn monomerisch ipv dimeer(zoals
G-protein)
- Hebben ook intrinsieke GTPase activiteit voor verwijdering van signaal.
GTPase-activating proteins(GAPs) helpen hierbij.
Metabolisme in context: insulin signaling regulates metabolism
- Insuline wordt vrijgelaten door beta-cellen in pancreas na eten
- Insuline receptor is een tyrosine kinase receptor, maar verschilt omdat het altijd
in een dimeer vorm is en niet alleen met insuline gebonden. Zwarte streepjes op
plaatje is disulfidebinding
- Als insuline bindt vindt cross fosforylering van beide kinases plaats. Kinases
fosforyleren andere delen van receptor waar andere eiwitten binden zoals
insuline-receptor substraten (IRS). IRS worden ook
gefosforyleerd door de kinases van de insuline
receptor.
- IRS is adaptor protein en wordt herkend door
andere eiwitten. P-3-kinase fosforyleert PIP2 tot
PIP3 (ATP nodig). PIP3 activeert PDK1 en die
activeert Akt(ook wel protein kinase B)
, - Akt fosforyleert alle enzymen voor glycogeen synthese en ook GLUT4 die
naar membraan gaat en glucose de cel in laat gaan
- Kijk waar amplificatie is!
- Verwijdering van insuline signaal: Tyrosine fosfatases verwijderen fosforyl
groep van tyrosine residuen op insuline receptor. Lipide fosfatases
hydrolyseren PIP3 naar PIP2. Serine fosfatases verwijderen fosforyl groep
van geactiveerde kinases zoals Akt. Veel van deze fosfatases worden al
geactiveerd als insuline aan de receptor bindt.
Q: Serine en threonine
Defects in signaling pathways can lead to diseases
- Proto-oncogene zijn vaak signaaltransductie eiwitten. Bij mutatie kan
ongecontroleerde celgroei ontstaan en heet het een oncogen.
- Gemuteerde Ras heeft geen intrinsieke GTPase activiteit en staat dus altijd
aan en dus continue cel groei.
- Gemuteerde of overexpressed tyrosine kinases receptoren leiden ook tot
tumoren. Medicijn is antilichamen die aan receptor binden waardoor ligand
niet kan binden of receptor niet conformatie kan veranderen.
- Beide genen van tumor suppressor genen gemuteerd → celgroei wordt niet
geïnhibeerd. Tumor suppressor eiwitten stoppen signaal pad en triggeren celdood.
- In kanker vaak ook overactieve kinases. bijv. ontstaan door translocatie tussen
chromosoom 9 en 22 waardoor bcr-abl gen ontstaat waardoor tyrosine kinase dubbel
wordt geproduceerd.
Q: Ras is monomeer en G-protein dimeer. Ras is kleiner dan G-protein. Hebben beide
intrinsieke GTPase activiteit. Allebei cyclus met GTP binden en dan weer GDP.
Zelfstudie 2 HC4 en HC5
Passieve transporters move solute along its electrochemical gradient
- Passieve transporters, transporteren specifieke stofjes over het membraan met hun
elektrochemische gradiënt mee. Als stofje ongeladen is dan met zijn
concentratiegradiënt mee.
- Het stofje bindt aan de kant van de transporter waar een hogere concentratie is van
het stofje. De transporter verandert spontaan en random van conformatie, waardoor
stofje aan andere kant komt.
- De passieve transporters zijn heel selectief voor welke stofje ze binden
Pompen
- Transmembrane pompen pompen actief solutes(opgeloste stoffen) tegen hun
elektrochemische gradiënt in
- Figuur 12.10 blz. 397. Vaak combinaties van deze pompen. Bv. ATP-drive Na⁺-pomp
pompt Na⁺ tegen elektrochemische gradiënt in. Dan kan Na⁺ door de gradiënt-driven
pomp heen met zijn elektrochemische gradiënt mee. Hierdoor ontstaat een
elektrochemische gradiënt over het membraan en dit geeft weer de energie voor
actieve transport van een ander stofje om tegen zijn elektrochemische gradiënt in te
gaan.
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller lonnekespek. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $6.89. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
48072 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now