100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Verzameling van alle mogelijke examenvragen van het vak scheiding en zuivering van biomoleculen (BMW: behaald resultaat 18/20) $7.04   Add to cart

Exam (elaborations)

Verzameling van alle mogelijke examenvragen van het vak scheiding en zuivering van biomoleculen (BMW: behaald resultaat 18/20)

 10 views  0 purchase
  • Course
  • Institution

Verzameling van alle mogelijke examenvragen van het vak scheiding en zuivering van biomoleculen (BMW: behaald resultaat 18/20): Hierin staat alles in wat de prof Xaveer Van Ostade heeft aangeven dat je moet kennen voor het examen. Leer deze oude examenvragen (die vaak terugkomen) en je bent er vlot...

[Show more]

Preview 3 out of 20  pages

  • November 3, 2021
  • 20
  • 2021/2022
  • Exam (elaborations)
  • Questions & answers
avatar-seller
Scheiding & zuivering

Elektroforese alle formules


Elektroforese = de beweging van een geladen molecule (macro-ion) in een elektrisch veld, de
nettolading van de molecule is q=ze, waarbij e de eenheidslading is en z het aantal
eenheidsladingen.

Elektroforetische mobiliteit U: is de verhouding van de migratiesnelheid op het elektrische
veld




U= elektroforetische mobiliteit
E= elektrisch veld
q= nettolading

Bovenstaande formule moest worden aangepast, omdat deze formule is voor macromolecule
opgelost in een solvent zonder tegenionen.
De volgende formule houdt wel rekening met elektrostatische krachten tussen de ladingen van
de moleculen en ionen die de elektroforetische mobiliteit verlaagt.




U= elektroforetische snelheid
ze= nettolading
n= viscositeit van de oplosssing
R= Stokes radius; afmetingen van het macro-ion
k= het omgekeerde van de straal r waarover macromoleculen elkaar nog kunnen beïnvloeden -
> beïnvloedt mobiliteit


Proteïnen, RNA en DNA hebben lading als gevolg van zure en basische groepen waardoor ze
migreren in een elektrisch veld bij een pH die verschilt van hun iso-elektrisch punt. De
migratie wordt bepaald door de verhouding van de lading tot de massa: sneller naar anode als
meer negatieve ladingen bevat.

Scheiding op basis van grootte: kleinere moleculen geraken gemakkelijker door de mazen van
het netwerk waardoor ze migreren tegenover grotere moleculen.

Bufferoplossing:
 pH in de elektrode reservoirs en in de dragen blijft constant
 de elektroliet concentratie is aanvaardbaard om de stroom te dragren

,  de elektroforese buffer mag niet reageren met de macromoleculen tijdens de
migratie


Types elektroforese
 Dunlaagelektroforese
 Gelelektroforese
o Agarase gelelektroforese
o Polyacrylamide gelelektroforese
o Iso-elektrofocusering
 Detectie van eiwitten en nucleïnezuren na gelelektroforese
 CBB
 Zilverkleuring
 Fluorochromen
 Identificatie van eiwitten en nucleïnezuren na gelelektroforese
 Western blot
 Southern en Northern blot
 Massaspectrometrie
 Capillaire elektroforese

Dunlaagelektroforese

Platen (glas, teflon, plastiek) worden bedekt met een drager (cellulose, silicia). De platen
worden bevochtigd en verbonden met de elektrodebuffers. De elektroforese wordt in een
afgesloten systeem uitgevoerd, omdat de elektrodebuffers een lage ionensterkte hebben en
vluchtige stoffen kan bevatten. Geladen moleculen gaan bewegen wanneer een spanning
wordt aangelegd. Er wordt gebruik gemaakt van geladen kleurstffen oom de elektroforese op
te volgen. De moleculen bewegen zich door de drager waarbij de drager als zeef fungeert.
(=1D)
2D elektroforese in twee richtingen loodrecht op elkaar in verschillende buffers of in één
richting gecombineerd met chromotografie in de andere richting, gescheiden stoffen zichtbaar
maken met kleurreactie




Gelelektroforese
Scheiding van macromoleculen in een gepolymeriseerd gelsysteem.
Voordelen:

,  Hoge capaciteit
 Gecontroleerde porositeit
 Verhindering convectie (door opwarming buffer)
 Minimaliseren diffusie
 Snelle eletroforetische beweging
Scheiding op basis van moleculair zeefeffect

Agarose gelelektroforese
Scheiding van nucleïnezuren

Agarose gel wordt gemaakt door het oplossen van agarosepoeder. De poriëngrootte wordt
bepaald door de concentratie agarose. Bv. als je grote moleculen wilt scheiden heb je grote
poriën nodig dus een lagere concentratie.
Agarose polymeriseert door afkoeling.
Relatie tussen de afgelegde afstand en de molecuulmassa: de snelheid daalt logaritmisch met
stijgende molecuulmassa:




Rf= afgelegde afstand
M= molecuulmassa
A en B= afhankelijk van elektroforesesysteem en zijn experimenteel te bepalen met referentie
moleculen

Polyacrylamide gelelektroforese
Scheiden van eiwitten en soms voor korte nucleïnezuren
Polyacrylamide gel wordt gemaakt door polymerisatie van acrylamide en N-N’-
methylenebisacrylamide in aanwezigheid van radicalen. De poriëngrootte wordt bepaald door
de concentratie acrylamide en de verhouding acrylamide/bisacrylamide.




T = totale concentratie aan acrylamide/bisacrylamide
C= concentratie crosslinker = bisacrylamide
a= gewicht acrylamide
b= gewicht bisacrylamide
V=volume mengesel
T + C veranderen -> verschillende porositeit




Continue buffersysteem: wanneer elektroforese wordt uitgevoerd met éénzelfde buffer in het
staal, gel en elektrode reservoirs. Scheiding bepaalt door zeefeffect. Nadeel: grootte van het

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller lemmeslodders. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $7.04. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

77858 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now

Start selling
$7.04
  • (0)
  Add to cart