100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Previously searched by you
Previously searched by you
logo
Samenvatting voor het theoretisch examen van het vak: Geïntegreerd practicum: moleculaire biologie en genetica (16/20) $12.40
Add to cart
Quickly navigate to
Preview
  2.  
  3. Universiteit Antwerpen (UA)
  4.  
  5. Biomedische Wetenschappen
  6.  
  7. Geïntegreerd practicum: moleculaire biologie en genetica

Summary

Samenvatting voor het theoretisch examen van het vak: Geïntegreerd practicum: moleculaire biologie en genetica (16/20)

1 review
 124 views  1 purchase
  • Course
  • Geïntegreerd practicum: moleculaire biologie en genetica
  • Institution
  • Universiteit Antwerpen (UA)

Samenvatting voor het theoretisch examen van het vak: Geïntegreerd practicum: moleculaire biologie en genetica (behaald resultaat 16/20). Als je deze samenvatting kent dan slaag je zeker voor dit vak.

Preview 2 out of 7  pages

Document information

  • November 5, 2021
  • 7
  • 2021/2022
  • Summary

Subjects

  • examen
  • theoretisch examen
  • eva geuensguy van camp
  • guy van camp
  • eva geuens
  • biomedische wetenschappen
  • examen geïntegreerd practicum
  • geïntegreerd practicum moleculaire biologie en genetica
  • samenvatting
  • c

Written for

  • Universiteit Antwerpen (UA)
  • Biomedische Wetenschappen
  • Geïntegreerd practicum: moleculaire biologie en genetica
All documents for this subject (5)

1  review

review-writer-avatar

By: tommy123 • 1 year ago

Seller

avatar-seller
lemmeslodders

Reviews received

Content preview

Geïntegreerd practicum: moleculaire biologie en genetica
1. Principe segregatie analyse + toepassen
Segregatieanalyse wordt gebruikt om te bepalen of familiegegevens voor bepaalde
aandoeningen of andere kenmerken compatibel zijn met specifieke manieren van
overerving. De overervingsttestende modellen in de segregatieanalyses zijn monogene
(Mendeliaanse), digene of polygene modellen.
 Oefeningen hoogswaarschijnlijk niet gevraagd op examen, vooral handig voor later

2. Analyseren van resultaten TPA 25 en VNTR D1S80
ALU TPA25 analyse
 Dat zit in een tissue plasminogen activator gen
 ALU repititief DNA element van 300 bp dat je hebt of niet hebt
 Aantonen met PCR:
o Afwezig: band bij 100 bp
o Aanwezig: band bij 400 bp
 +/+: homozygoot aanwezig
 +/-: heterozygoot aanwezig
 -/-: homozygoot afwezig

VNTR (D1S80)
 Variable Number of Tandem Repeats
o D1S80: tandem repeat van 16 bp die je verschillende keren kan hebben
o Aantal repeats zijn polymorf
 Lengte PCR fragment bepaalt door aantal repeats
o Primer en flankerende sequentie = 2x20 bp + 148 bp
o Lengte D1S80 = lengte van repeat (16 bp) * aantal repeats
o Berekening aantal repeats (n):
 N= (lengte PCR product -148 bp)/16 bp

3. Principe HRM en analyseren van resultaten
Principe
 High resolution melting (HRM) analyse
 Detecteren van:
o Polymorfismen of mutaties in dsDNA via DNA smeltcurve analyse
o Smelttemperatuur (Tm):
 T waarbij complementaire DNA strengen voor de helft gescheiden zijn
 T is afhankelijk van de DNA sequentie
o Verschillen in DNA sequentie zijn aantoonbaar door de verschillen in
smelttemperatuur  verandering in smeltcurve
o NIET mogelijk om SNP-genotype te bepalen, wel zeggen of een SNP aanwezig
is of niet
 Smelttemperatuur (Tm):
o T waarbij complementaire DNA strengen voor de helft gescheiden zijn
o T is afhankelijk van de DNA sequentie
o Verschillen in DNA sequentie zijn aantoonbaar door de verschillen in
smelttemperatuur  verandering in smeltcurve
 PCR targetsequentie is fragment rond SNP of mutatie

,  Monitoring van proces in real-time via:
o SYBR-green
o Taqman probes
SYBR-green:
 Fluorescentie molecule
 Bindt aan kleine groeve van dsDNA
 Fluorescentie:
o Niet fluorescent als DNA enkelstrengig is  denaturatie en annealing fase
o Fluorescent wanneer gebonden aan dsDNA  elongatie fase
 SYBR-green bindt enkel aan dsDNA, dus als dsDNA in PCR reactie overgaat naar
ssDNA verlaagt de fluorescentie (SYBR-green wordt losgemaakt van de strand)

Taqman probes:
 Primer en probe nodig
 Primer bindt op fragment
 Probe:
o Bindt ook op fragment
o Complementair aan de target regio van DNA
o Bevat 2 labels:
 Fluorescent reporter label aan 5’uiteinde  wanneer geëxciteerd
door laser, zendt het fluorescent licht uit
 Quencher of dover label aan 3’ uiteinde
 Fluorescentie:
o Niet fluorescent in denaturatie en annealingsfase
 Beide labels bevinden zich dicht bij elkaar
 Quencher interfereert met fluorescentie van de reporter
o Fluorescent in extensie fase  afknippen van fluorofoor en quencher tgv
probe displacement
 Wanneer Taq polymerase DNA amplificeert  verwijdering van het
reporterlabel (Taq polymerase: 5’-3’ nucleaseactiviteit)  reporter
wordt niet meer geïnterfereerd door de quencher fluorescentie kan
uitgezonden en gedetecteerd worden
o Meer dsDNA, meer fluorescentie

Volgorde:
 Gewone PCR met gewone primers om target DNA te amplificeren
 dsDNA denatureren met snelle renaturatie (mismatchen voorkomen)
 graduele denaturatie (systematisch stijgen van T)  dsDNA valt uiteen 
fluorescentie meten  bepalen wanneer DNA uit elkaar gevallen is (dit hangt van
genotype af)

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller lemmeslodders. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $12.40. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

56326 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now

Start selling
$12.40  1x  sold
  • (1)
Add to cart
Added