Class notes
Notities H10-12 en 3.1.6 Metabolisme en Metabole Regeling (Prof Schuit -2de Bach)
- Course
- Institution
- Book
Notities H10-12 en 3.1.6 Metabolisme en Metabole Regeling (Prof Schuit -2de Bach)
[Show more]
Connected book
Book Title:
Author(s):
- Edition:
- ISBN:
- Edition:
Seller
Follow
chlovanhove
Reviews received
Content preview
e-les 23Module 10.1.1: Metabolisme van basen en nucleotiden
Inleiding
- Basen worden afgeleid van AZ
- Kankercellen: Onsterfelijk, blijven delen en stoppen niet
- Kankercellen hebben ook een zwakke plek → met geneesmiddelen die zwakke plek
rake, antimetabolieten
Overzicht nucleotiden- en basenhuishouding van een cel
- Evenwicht van de verschillende nucleotiden
- Hergebruik basen = salvage weg
- De novo aanmaken van AZ en C-bron
- Overtollige basen afbreken en elimineren
- Pyrine en purine: 2 verschillende wegen
- Niet-essentiële AZ gebruiken om eventueel in grote hoeveelheden basen op te
bouwen
Nomenclatuur van basen, nucleosiden en nucleotiden → Tabel kennen!
Schema van de synthese van de verschillende nucleotiden
- De novo synthese begint met AZ en met een N-bron
- Drijfveer via de energy charge
Bouwstenen voor de opbouw van het purineskelet
- Eenvoudige bouwstenen die dienen om het skelet atoom per atoom op te bouwen op
de ribose ring
- N afkomstig van AZ
Vorming van de geactiveerde bouwsteen: PRPP
- Geactiveerde vorm van ribose
- Gaat base binden
- C1 is bijzonder → ATP gebruiken en de buitenste 2 P overdragen op C1
De novo purinesynthese: ingewikkelde anabole weg
- Purineskelet opgebouwd
- 10 reacties, gekatalyseerd door minder dan 10 enzymen
Metabole fluxcontrole van de purinesynthese
- 2de fase IMP laten diversifiëren
- Vertakte metabole weg
- Fluxcontrole aan het begin
De de novo synthese wordt mogelijk dankzij een “purinosoom”
- 10 enzymactiviteiten zitten in een ruimte dicht bij elkaar → in purinosoom
- GART trifunctioneel
- @kern 6 tal genen nodig voor die 10 activiteiten
- Promotor gedeeld door PPAT en PAICS
Chloë Van Hove
2de bach Biomedische Wetenschappen
,Voordeel van het bestaan van een “purinosoom”
- Aangetoond in celculturen met een antilichaam gericht tegen een enzym
- Cellen geen purines in kweekmedium → cellen zelf purines maken → enzymactiviteit
is puntvormig geconcentreerd
- Purines wel toegevoegd → purinosomen vallen uit elkaar → geen de novo synthese
→ fluorescentie heel diffuus
- Dynamisch systeem waar de fluxcontrole voor een deel berust op het opbouwen of
uiteenvallen van purinosomen
2 voorbeelden van salvage weg van purinesynthese
- Purines gebruiken om nucleotiden te maken = salvage weg
- Niet het purine skelet opbouwen atoom per atoom maar het purine in 1 stap op de
ribose ring plaatsen
- PRPP nodig → transfer reactie → adenine ipv pyrofosfaat
- PRPP nodig → transfer reactie → guanine ipv pyrofosfaat
De novo pyrimidine biosynthese: eerste fase
- Vrije basen opbouwen en in de laatste stap aan de ribose ring hechten
- Opbouw vrije basen → multifunctionele enzymen nodig
- 3 eerste reacties onderdeel van een trifunctioneel enzym
De novo pyrimidine biosynthese: tweede fase
- Vertakkingen!
De novo versus salvage weg van basen synthese
- Zowel voor de purines als de pyrimidines
- De novo: C-bron meestal glucose
- Salvage: Alleen PRPP nodig dat bevat alle E om te koppelen in 1 stap
Purine-analogen als antimetabolieten
- Stofjes gebruiken die inwerken op het metabolisme → verstoren → geneeskundig
voordeel uithalen
- Proliferatie van bepaalde virussen afremmen
- Herpes infecties: Stofje toedienen dat een nucleoside analoog is waarbij de ribose
ring structuur ontbreekt → ingebouwd in virale genoom → replicatie stopt
- HIV: Gebruikt reverse transcriptase om het RNA om te zetten naar cDNA
→ remmers voor dit transcriptase gebruiken
- Onderdrukken immuunsysteem
- Azathioprine: NS verbinding aan de base → verhinderen cellen om actief te worden
- Gebruikt na orgaantransplantatie
- Preventie van jicht
Extra stappen voor DNA synthese
- DNA bouwstenen → desoxyribose nodig
- Als base thymine nodig
Chloë Van Hove
2de bach Biomedische Wetenschappen
, Ribonucleotidereductase ⇒ desoxyribonucleosidedifosfaten
- Basen van de nucleotiden verschillen
- Rode d = deoxy
- 4 soorten reacties, lijken allemaal op elkaar → in dezelfde actieve site
- Interface = actieve site
- Radicaal valt de OH groep aan
- Naast een gewone fluxcontrole zijn er ook allosterische sites
Thymine synthese vereist…
- Uracil base veranderen in thymine base
- Methylering op de base zelf → werking van TYMS
- Serine nodig voor oplading → glycine
Waarom thymine als DNA base?
- Synthese thymine base: Op het niveau van monofosfaten
- Reductie van ribose: Op het niveau van difosfaten
- Waarom thymine als DNA base en niet uracil
- In DNA kan schade ontstaan door de oxidatieve deaminatie van cytosine
waarbij een N wordt vervangen door een O → cytosine wordt uracil
- G over U → fout → U weg
- U wel onderdeel van de 4 normale basen → herstelsysteem in problemen
Gevolg ⇒ gemethyleerde cytosine in DNA is mutageen
- T wordt niet herkend als fout
- Cel → replicatie → ingebouwd in de dochtercel
- Puntmutaties ten gevolge van gemethyleerde cytosines
“Antimetabolieten” van het pyrimidinemetabolisme
- Synthese van thymine uit uracil op het niveau van dUMP
Methotrexaat remt dihydrofolaatreductase
- Komt omdat het dus erg lijkt op de structuur die moet worden gereduceerd
- Competitie → geneesmiddel gaat ervoor zorgen dat er minder dihydrofolaat wordt
gereduceerd
Methotrexaat is een foliumzuur analoog (lijkt op dihydrofolaat)
- Beide structuren kunnen in de actieve site doordringen door hun gelijkenis
Methotrexaat is een competitieve remmer van dihydrofolaat reductase (DHFR)
- Methotrexaat remt de reductie van de dubbele binding in dihydrofolaat waardoor
tetrahydrofolaat niet meer ontstaat
Dihydrofolaatreductase vormt een enzym-substraat complex met zijn substraat
- 2 mogelijkheden
Methotrexaat neemt enzym “uit de circulatie”
- Substraat bindt niet maar de inhibitor
- Geen reactie
Chloë Van Hove
2de bach Biomedische Wetenschappen
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller chlovanhove. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $13.38. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
52510 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now