Een erg uitgebreide samenvatting van het vak dataverwerking van de opleiding biologie & medisch laboratoriumonderzoek op de HU! Zelfs met notities erbij van de docent wat je wel en niet moet weten.
Het is een 5 EC cursus en het bestaat uit 2 onderdelen die elk afzonderlijk worden getoetst:
Dataverwerking
Hier wordt geoefend met het analyseren van experimentele data in SPSS. Het is een aanvulling op de
vaardighedenmodules waar de nadruk meer ligt op de praktische uitvoering van experimenten. In de beroepspraktijk is h
analyseren van gegevens en het formuleren van een conclusie een belangrijk onderdeel van de competentie
'experimenteren'.
Werkvorm: Het vak wordt gegeven in 6 werkcolleges op de computer waar gebruik gemaakt wordt van het
computerprogramma SPSS. Er geldt geen aanwezigheidsplicht.
Studiemateriaal: Al het studiemateriaal is te vinden binnen de Canvas cursussite.
Voorkennis: De stof van de cursus Statistiek en Excel wordt als bekend verondersteld.
Bioinformatica
Je leert hier kennis en vaardigheden van informatica en biologie toe te passen op vragen of problemen uit de moleculair
biologische/biomedische praktijk. Je analyseert met behulp van software moleculaire structuren, 'metabolic pathways',
taxonomie en eiwit-eiwit interacties. Verder komt het ontwerpen van PCR primers aan bod en wordt er gebruik gemaakt
van Linux voor eenvoudige analyses.
Werkvorm: Het bestaat uit 2 modules die beiden uit 5 lessen bestaan, waarbij verschillende casussen aan bod komen +
opdrachten. Het is de bedoeling dat je volledig zelfstandig de 2 modules doorloopt, alleen of met een groep studenten.
De eerste verplichte les geeft een uitleg over wat er van je verwacht wordt tijdens de cursus. De richtlijn is om 2 lessen pe
week te maken. Mocht je er niet uitkomen dan is er iedere week een spreekuur, een discussieforum binnen Canvas en een
speciaal email adres waarbij het mogelijk is om vragen te stellen om daarna weer zelf verder te kunnen.
Als je de opdrachten maakt krijg je gelijk feedback op de vraag met het correcte antwoord. Lees zorgvuldig de feedback
door en controleer zelf je antwoord.
Studiemateriaal: Al het studiemateriaal is te vinden binnen de Canvas cursussite.
Voorkennis: Er wordt verondersteld dat je kennis van de Moleculaire Biologie hebt. De processen die in de cel plaatsvinde
beheerst, maar ook de technieken begrijpt. Lees zo nodig het materiaal nog eens door.
Toetsing
Beide cursusonderdelen worden getoetst met een digitaal tentamen op de computer in TestVision. Om de studiepunten
van de gehele cursus te krijgen moeten beide toetsen met een voldoende worden afgesloten.
Toets 1: Tentamen dataverwerking
De leerdoelen van dataverwerking worden getoetst door middel van een digitaal tentamen in TestVision. Voor het
uitwerken van de opgaven is SPSS nodig. Andere computerprogramma's en internet zijn tijdens het maken van de toets
uitdrukkelijk verboden.
De summatieve toets wordt meerdere keren per jaar aangeboden. Ter voorbereiding op de summatieve toets is er een
oefentoets (formatieve toets) beschikbaar. Deze toets wordt in week 6 ter beschikking gesteld in TestVision.
Toets 2: Tentamen bioinformatica
De leerdoelen van bioinformatica worden getoetst door middel van een digitaal tentamen in TestVision. Tijdens de toets
mag gebruik gemaakt worden van het cursusmateriaal in Canvas en internet met uit zondering van niet-relevante sites (b
sociale media). Het gebruik van sociale media wordt als fraude gemeld bij de examencommissie.
Bioinformatica en dataverwerking Page 1
,sociale media). Het gebruik van sociale media wordt als fraude gemeld bij de examencommissie.
De summatieve toets wordt meerdere keren per jaar aangeboden. Ter voorbereiding op de summatieve toets is er een
oefentoets (formatieve toets) beschikbaar. Deze toets wordt in week 6 ter beschikking gesteld in TestVision.
Bioinformatica en dataverwerking Page 2
,Tuesday, September 7, 2021 10:40 AM
Les 1
• Data uit Excel importeren in SPSS
• Navigeren in SPSS tussen data en variabelen
• Hercoderen van data in een andere variabele in SPSS
• Maken van boxplots en histogrammen in SPSS
• Uitvoeren van beschrijvende statistiek in SPSS
Les 2
• Verschillende begrippen en definities kennen van de beschrijvende en inductieve statistiek.
• Het verschil kunnen uitleggen tussen beschrijvende en inductieve statistiek.
• De verschillende meetniveaus onderscheiden bij een gegeven dataset.
• Null hypothese (H0) formuleren
• Uitleggen wat het begrip significantie betekent en aangeven wanneer een toets een
significant resultaat heeft.
• Testen of kwantitatieve data normaal verdeeld is met de Shapiro-Wilk test in SPSS
Les 3
• Data uit een tekst bestand (notepad) importeren in SPSS
• Uitvoeren van de Shapiro-Wilk toets (en het formuleren van de juiste H0 voor deze toets)
• Een keuze maken of er een parametrische toets gebruikt mag worden op basis van de
onderzoeksvraag en de data.
• Indien er een parametrische toets uitgevoerd mag worden, kiest de student de juiste
parametrische toets op basis van de onderzoeksvraag en de data.
• De verschillende parametrische toetsen kennen en kunnen uitvoeren in SPSS.
• H0 van de Levene's test formuleren en de uitslag van deze test interpreteren in de context
van de independent- samples T test.
Les 4
• Data uit een CSV bestand importeren in SPSS
• De verschillende non-parametrische toetsen kennen en kunnen uitvoeren in SPSS
• Een keuze maken uit de verschillende non-parametrische toetsen op basis van de
onderzoeksvraag en data.
Les 5
• Uitleggen wat een verband onderzoeksvraag is en vertalen naar een H0
• De verschillende toetsen voor verbanden kennen en kunnen toepassen in SPSS
• Een juiste toets kunnen selecteren die een verband aangeeft tussen twee variabelen op basis
van de onderzoeksvraag en data
• Scatterplot maken in SPSS
• Regressie analyse
Bioinformatica en dataverwerking Page 3
, Tuesday, October 19, 2021 2:46 PM
Bioinformatica en dataverwerking Page 4
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller suzannevandervliet. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.81. You're not tied to anything after your purchase.
