Opdrachten behorende bij DNA Fingerprint week 2
Probeer het antwoord op de volgende vragen in eigen woorden uit te leggen:
1. Leg het principe uit van fluorescentie.
Bijvoorbeel je gelred is een fluorescerende dye, bind met dsDNA. Als je met UV licht
aanslaat gaan de elektronen in een aangeslagen toestand, vallen terug in de
grondtoestand en zenden daarbij licht uit in een andere golflengte.
2. Op welke wijze worden de PCR fragmenten fluorescent gelabeld?
De fluorescerende labels worden aan 1 van de primers van het primer paar toegevoegd, met NHS-
esters en amino bindingen worden deze gekoppeld aan het 5’einde van de primer. Zo kan er
bijvoorbeeld een 6-carbon spacer worden toegevoegd label-(CH2)6-primer. Er kunnen
verschillende labels ingebouwd worden zodat producten met vergelijkbare lengtes te
onderscheiden zijn. De CCD camera neemt vervolgens dee labels waar en deze verschijnen als
gekleurde pieken.
3. Hoe kan het dat je met slechts 5 kleuren toch 24 verschillende markers kan
meten?
In een kleur ‘kanaal’ kun je verschillende markers meten mits ze niet binnen hetzelfde
amplificatiegebied vallen.
4. Welk humaan locus is het meest Polymorf en waarom zijn deze interessant voor
Forensisch Onderzoek?
Het HLA superlocus. Dit is een genomisch gebied dat codeert voor zes HLA-genen en ten
menste 132 eiwitcoderende genen die een belangrijke rol spelen bij de regulatie van het
immunsysteem en andere moleculaire en cellulaire processen.
5. Leg uit wat stutter is en welke verschillende vormen van stutter er bestaan.
Het polymerase dat het DNA synthetiseert heeft een repeat overgeslagen tijdens de
productie van het pcr product of hij heeft er eentje extra bij gezet, dat betekent naast het
echte pcr product je een pcr product krijgt dat 4 basen paren kleiner is of 4 basen paren
groter is. De tetranucleotiden hebben het minste kans op stutter.
6. Welke STRs hebben de grootste stutter pieken: dinucleotide, trinucleotide of
tetranucleotide repeats?
dinucleotide, want bij tetranucleotiden is minder kans op stutter omdat het fragment 1
base te kort is.
7. Open het Excel bestand
van https://scv10mr-cdnpre-p-cus-00.azureedge.net/-/media/files/products-and-
services/genetic-identity/str-analysis/1036-revised-allele-freqs-popstats-july-19-2017-
vs-3.xlsx?
rev=fbc0e03e7f3540f9994bc2c8f6bb4cd4&sc_lang=en&_gl=1*1c7amaj*_ga*MTc2ODUw
MDYzOC4xNjM3MjcwMTYz*_ga_3KTGR4JGE1*MTYzNzI3MDE2Mi4xLjAuMTYzNzI3MDE3
MC4w
Stel dat een persoon van alle markers uit de lijst in een profiel alleen de allelen en 20 en
21 heeft. Wat is de kans dat een willekeurig persoon ook dit DNA profiel heeft?
Probability = 0,1038*0,0643=0,0067
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller annakoolen. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.23. You're not tied to anything after your purchase.