Summary
Samenvatting van Moleculaire Epidemiologie
- Course
- Institution
Een samenvatting van de cursus MolEpi en de antwoorden van de hoorcolleges van les 2 en 3.
[Show more]
Seller
Follow
kasjaclaess
Reviews received
Content preview
Moleculaire EpidemiologieInhoud
Les 1 – Inleiding moleculaire evolutie.......................................................................................................................3
De genetische variatie bij levende organismen uitleggen....................................................................................3
Het ontstaan van genetische variatie in populaties uitleggen..............................................................................3
De verschillende methoden van classificatie benoemen......................................................................................3
Het proces van evolutie en Darwin’s evolutie theorie uitleggen..........................................................................3
De invloed van natuurlijke selectie op de evolutie uitleggen...............................................................................4
Het concept van “the tree of life” en het begrip molecular clock uitleggen........................................................4
Het epidemiologisch effect van veranderingen in het genoom bij bacteriën benoemen....................................4
Selectie en antibiotica resistentie.....................................................................................................................4
De toepassingen van moleculaire technieken bij de bestudering van de verspreiding van infectieziekten
benoemen.............................................................................................................................................................4
Les 2 – Fylogenie.......................................................................................................................................................6
Het begrip fylogenie bij een phenetics of cladistics benadering uitleggen..........................................................6
Het belang van moleculaire markers binnen de fylogenie uitleggen...................................................................6
De betrouwbaarheid van een fylogenetische boom bepalen...............................................................................6
Toepassing van de fylogenetische bomen binnen de epidemiologie...................................................................7
De constructie en interpretatie van een minimum spanning tree.......................................................................7
Aantekeningen college......................................................................................................................................7
Les 3 – Bacterial typering by whole genome sequencing.........................................................................................8
SNP typing.............................................................................................................................................................8
MLST......................................................................................................................................................................8
Pair comparison of core genes..............................................................................................................................8
Accesory gene typing........................................................................................................................................9
Plasmide sequencing.........................................................................................................................................9
Het verschil tussen identificatie en typeren van bacterien..................................................................................9
Les 4 – Antibiotica resistentie.................................................................................................................................10
Mechansimen van antibiotica resistentie bij bacteriën benoemen...................................................................10
Verspreiding van een VRE wereldwijd en binnen het ziekenhuis uitleggen.......................................................10
Les 5: Moleculaire epidemiologie virussen.............................................................................................................12
Hepatitis B en C...................................................................................................................................................12
Genetische variatie bij HB en HC.........................................................................................................................12
Les 6 – HIV epidemie en evolutie van HIV resistentie.............................................................................................13
Artikelen – Hoorcollege’s........................................................................................................................................14
Les 2 TB................................................................................................................................................................14
,Les 3 – Bordetella pertussis.................................................................................................................................15
, LES 1 – INLEIDING MOLECULAIRE EVOLUTIE
Epidemiologie is de wetenschappelijke studie van het voorkomen en de verspreiding van ziekten onder de
bevolking. Er wordt niet rekening gehouden met diagnose en behandeling, maar met wie wordt getroffen en
welke factoren werken of niet.
Leerdoelen:
DE GENETISCHE VARIATIE BIJ LEVENDE ORGANISMEN UITLEGGEN
De genetische variatie binnen een soort vormt het uitgangsmateriaal voor evolutie via natuurlijke selectie.
Organismen die beter aangepast zijn hebben een selectievoordeel.
HET ONTSTAAN VAN GENETISCHE VARIATIE IN POPULATIES UITLEGGEN
De genetische variatie binnen een soort vormt het uitgangsmateriaal voor evolutie via natuurlijke selectie.
Genetische variatie ontstaat op 2 manieren:
1. Geslachtelijke voortplanting
Door het genetische materiaal van twee ouders te combineren wordt de helft van elk genetische genoom
overgenomen door de kinderen. Er is ook kans op crossing-over, waardoor er veel genetische variatie ontstaat.
2. Mutaties
Wijzigingen in de erfelijke eigenschappen van het genoom zorgen voor variatie. In principe zijn alle mutaties
toevallig, maar welke mutaties zijn gevoelig voor selectiedruk? De best aangepaste vogel zal zijn genen
doorgeven. Er zijn verschillende soorten mutaties:
- Insertie is een toevoeging van 1 of meerdere nucleotiden aan een DNA of RNA sequentie
- Deletie is een mutatie waarbij er 1 of meerdere nucleotiden worden verwijderd
Synonymous mutaties = Stille muaties = zorgen niet voor een verandering in de aminozuurvolgorde.
Selectiedruk heeft wel effect op nonsynomymous mutaties.
DE VERSCHILLENDE METHODEN VAN CLASSIFICATIE BENOEMEN
Carlos Linnaeus bracht het classificatiesysteem tot stand. Er zijn drie manieren:
1. Hiërarchisch classificatiesysteem
Soorten en geslacht
Familie en orde
Klasse en rijk
2. Onderlinge verwantschap
3. Systematiek; taxonomie
HET PROCES VAN EVOLUTIE EN DARWIN’S EVOLUTIE THEORIE UITLEGGEN
Charles Darwin is de grondlegger van de evolutietheorie, maar dit is nog steeds een theorie. Hij zag zoveel
variatie in de soorten om zich heen dat hij uiteindelijk op de tree of life is gekomen. Evolutie vind plaats door
middel van natuurlijke selectie. Organismen die beter aangepast zijn hebben een selectie voordeel Survivial
of the fittest.
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller kasjaclaess. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.21. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
50064 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now