Summary
celmobi samenvatting: Hoofdstuk 16: RNA
- Course
- Institution
celmobi samenvatting: Hoofdstuk 16: RNA
[Show more]
Seller
Follow
ameliakirkov
Content preview
Hoofdstuk 16: RNA• Algemene eigenschap mRNA: onstabiel (+ grote lengtevariatie)
⤷ Hoge “turnover” nodig voor toelaten regulatie
→ Stabiliteit kan beïnvloed worden (zowel ⊕ als ⊝) door binding eiwitten
• mRNA in prokaryoten:
→ Halfwaardetijd: ong. 2 min.
→ Transcript niet geprocessed: ribosomen binden al tijdens transcriptie1
• mRNA in eukaryoten (algemeen)
→ Primair transcript = hnRNA → processing2 → mRNA →transport naar cytoplasma
▪ Verlaat de kern niet ⤷ ▪ Halfwaardetijd: 6 - 24 uur
▪ Halfwaardetijd: ong. 30 min.
• Interne modificatie bij eukaryote mRNA’s: splicing
→ Introns verwijderd uit primair transcript
• Modificaties aan uiteinden van eukaryotische mRNA’s:
→ 5’ “cap”:
▪ Transcript ong. 20 – 30 lang => toevoeging cap-structuur aan 5’-einde
▪ 7-methyl-guanine met fosfordiësterbinding op 1ste nucleotide mRNA-keten
▪ Uitgevoerd door guanylyl-transferase en guanine-7-methyl-transferase
▪ Nadien mogelijk bijkomende methylaties
▪ Rol bij transport van kern naar cytoplasma + bescherming tegen nucleasen +
herkenningsplaats voor ribosomen
→ Polyadenylatie:
▪ Afknippen 3’-uiteinde door endonucleolytische knip
⤷ ong. +11/+30 van polyadenylatiesignaal (consensussequentie: 5’ AAUAAA 3’)
▪ Toevoeging van polyA-staart (ong. 200 adenines)
▪ Belangrijk voor transport naar cytoplasma, translatie en bescherming tegen afbraak3
• rRNA: belangrijkste component ribosomen
→ Kleine en grote subeenheid (analoog in alle organismen)
→ RNA heeft katalytische + structurele functie binnen ribosoom (“geraamte”)
→ Op basis van rDNA-sequenties kan men evolutionaire boom maken
⤷ Geconserveerde sequenties + variabele gebieden
⤷ ITS (internal transcribed spacer) = spacer tussen rRNA-codes
⤷ Primers (voor PCR) worden voor geconserveerde gebieden gemaakt
• Bij pro- en eukaryoten: alle info voor rRNA in 1 transcriptie-eenheid
⤷ Behalve 5S bij eukaryoten
→ Eerst en voor kleine subeenheid (16S4 voor prokaryoten, 18S voor eukaryoten)
→ Nadien spacer (ITS)
→ Nadien gen voor grote subeenheid (23S voor prokaryoten, 18S voor eukaryoten)
→ In de spacer kan tRNA-gen voorkomen bij prokaryoten
→ Vaak zijn er meerdere kopieën van dit gen => multigenfamilie
⤷ 18S/5,8S/28 in clusters t.h.v. nucleolaire organisatieregio’s (NOR) v chromosomen
⤷ 5S-genen buiten NOR’s in clusters
• Transcriptie en processing van rRNA
→ Genen in 1 transcriptie-eenheid => samen primair transcript (pre-rRNA)
1
Koppeling van transcriptie en translatie
2
Zowel aan 5’ als aan 3’ kant en ook intern
3
Histon-mRNA’s hebben geen polyA-staart → korte levensduur
4
Grootte uitgedrukt in S (Svedbergsedimentatiecoëfficiënt)
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller ameliakirkov. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $10.53. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
52510 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now