Les 1: Nucleus-genoom 3D organisatie
1. Bespreek hogere orde 3D genoom organisatieniveaus
1. DNA: Deoxyribonucleïnezuur. Dit is de eenvoudigste vorm bestaande uit een dubbele helix.
2. Chromatine (histonen rollen DNA op): DNA associeert met een aantal histon- en niet-
histoneiwitten, wat resulteert in een chromatinevezel. Histoneiwitten zijn dus
verantwoordelijk voor het oprollen/ontrollen van DNA.
3. Enhancerdomein (lussen): Chromatinevezels zijn georganiseerd in lussen (bijvoorbeeld door
promotor-enhancer-interacties te vormen). Deze enhancerdomeinen kunnen grote gebieden
in chromosomen controleren.
4. TAD (cluster van lussen in 1 topologisch gecontenteerd domein): De chromatinevezels
worden verder gecondenseerd tot domeinen van een paar honderd kilobasen lang, bekend
als topologisch geassocieerde domeinen (TAD's), die intern zijn verrijkt in cis-interacties.
5. LAD: TAD’s zijn dan op hun beurt georganiseerd in transcriptioneel actieve en inactieve
(bijvoorbeeld heterochromatine) compartimenten. Sommige van de heterochromatine
gebieden zijn gekoppeld aan het binnenste kernmembraan op lamina-geassocieerde
domeinen (LAD's). De kern is afgeschermd door nucleaire lamina eiwitten. LADs maken ook
contact met chromatine-eiwitten en gaan zo onze chromosomen verankeren. LADs kunnen
zich groeperen in transcriptie factories, waarbij de genen die dezelfde transcriptiefactor
bindingsplaats hebben, kunnen gecoördineerd worden.
6. Chromosomen: Meest compacte vorm van het DNA waarop de genen op een vaste plek
gelegen zijn per chromosoom.
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller student2018BMW. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.14. You're not tied to anything after your purchase.
