Opdracht 1
Roy van Gent
Julia Muskee
Roy Pijlman
Amsterdam, 10 januari 2022
, Red de banaan
BTG1
Scriptie
Opdracht 1
Roy van Gent
Julia Muskee
Roy Pijlman
Amsterdam, 10 januari 2022
Hogeschool Inholland
Biotechnologie
Coach: Paula van Schie1
1
Figuur omslag https://www.promusa.org/Domestication+of+the+banana geraadpleegd op 22-10-2021
, Samenvatting (Julia Muskee)
De mensheid in de wereld heeft een erge voedzame voedselbron en dat is de banaan. De banaan is
daardoor erg belangrijk voor ons voedselpatroon en leven op aarde, want deze vrucht wordt in grote
aantallen gegeten over heel de wereld. Deze belangrijke voedingsbron ligt onder vuur door de
Panamaziekte. De banaan moet zich beter kunnen verweren tegen de bedreigende schimmel om te
voorkomen dat de belangrijke banaan uitgestorven raakt.
In deze scriptie wordt een literatuurstudie uitgevoerd naar het gen dat zorgt voor resistentie tegen
de panamaziekte en naar de mutaties die deze resistentie beïnvloeden. Hierbij wordt gekeken naar
de verschillen in genotype tussen de wel resistente wild-type banaan en de niet resistente Cavendish
banaan en wordt er beschreven hoe de verhoogde resistentie in de banaan gedetecteerd kan
worden met bruikbare technieken.
De belangrijkste resultaten uit deze literatuurstudie zijn dat het resistentie-gen RGA2 tegen de TR4
schimmel een NB-LRR eiwit is. De werking van dit eiwit is driedelig. De NB-LRR genen hebben een
grote verscheidenheid ontwikkeld van effectoreiwitten waardoor ze drie verschillende
verdedigingsreacties aansturen: directe resistentie, indirecte resistentie en inductie van NB-LRR
resistentie-eiwit. De verdedigingstechniek van het RGA2 wordt op korte termijn opgewekt door
detectie van de pathogeen met de naam Effector triggered immunity (ETI). De verdedigingstechniek
op lange termijn wordt systemic acquired resistance (SAR) genoemd. De mate van fluorescentie bij
qPCR is een maatstaaf voor genexpressie van RGA2. Hierbij wordt gekeken naar de hoogte van de
Cycle-treshold. Met PCR-assay kan onderzoek gedaan worden naar de aanwezigheid van het RGA2
resistentie-gen in de banaansoorten. Met een bio-toets kan op natuurlijke wijze de werkelijke
resistentie aangetoond worden en of de Cavendish banaan genoeg resistentie vertoont tegen de TR4
schimmel. Met deze drie technieken kan een experimenteel onderzoek gestart worden naar het
RGA2 gen en de werking van het RGA2 gen in de Cavendish banaan.
Uit deze literatuurstudie is gebleken dat de oorzaak van de verlaagde eiwitexpressie van het RGA2
resistentie-gen in de Cavendish banaan nog niet wetenschappelijk beantwoord is. Ook is er nog geen
antwoord op de gevolgen van de verandering van eiwitstructuur in de Cavendish banaan. Het eiwit
waar het gen voor codeert valt onder de NB-LLR eiwitten. Dit brengt een aantal processen op gang
waaronder: ion-flux, oxidative-burst, ETI en SAR die niet alleen het pathogeen neutraliseren maar
ook verdediging opbouwen voor een mogelijke volgende besmetting.
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller juliaesme. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.39. You're not tied to anything after your purchase.