Eiwitten kunnen op verschillende manieren aan het membraan gebonden zijn. Dit kan zowel trans
membraan zijn als aan het membraan gekoppeld via een lipide. Daarnaast kan een eiwit ook weer
binden aan een transmembraan eiwit.
Eigenschappen van een alfa helix:
- Een alfa helix is rechtsdraaiend.
- Elke turn omvat 3.6 aminozuren.
- De lengte van de helix is 1.5 Angström per aminozuur.
- Een enkele alfa helix vormt geen porie.
- Een transmembraan alfa helix moet hydrofoob zijn en langer dan het membraan zijn.
Hiervoor zijn ongeveer 20 hydrofobe aminozuren nodig.
- Aan de hand van de hydrofobiciteitsschaal van aminozuren van verdelingsevenwichten in
water en organische oplosmiddelen kan bepaald worden of de alfa helix een trans membraan
eiwit is of niet. (een tabel die een waarde geeft welke aangeeft of het aminozuur liever in
waterige fase zit of in organische fase).
- Dit is te bepalen door wanneer je een eiwit hebt voor elk aminozuur de waarde te noteren.
Dit wordt uitgezet in een grafiek. Hierdoor wordt zichtbaar vanaf welk aminozuur het eiwit
hydrofoob is en dus door het membraan kan steken (in onderstaande afb. ongeveer vanaf
70).
- Je kunt ook bepalen of een peptide amfipatisch is door naar de aminozuurvolgorde te kijken.
Je weet 1 rondje = 360 graden, dit gebeurt bij 3.6 aminozuren. Ofwel 1 aminozuur maakt een
hoek van 100 graden ten opzichte van de volgende. Dit zet je uit in een helical wheel.
Vervolgens kijk je naar hydrofoob/hydrofiel en aan welke kant deze zich bevinden.
, Eigenschappen B-sheets en B-barrel:
- Aminozuurzijketens om en om boven en onder het vlak van de sheet (groene bolletjes, rood
is CO)
- H-bruggen om en om naar langs liggende ketens. De NH vormt steeds waterstofbruggen met
de CO . Hierdoor krijg je crosslinks.
- De lengte van de B-sheet is 3.5 Angström per aminozuur.
- In membraan: B-barrel: een kokertje van een amfipatische B-sheet.
- Ze kunnen zo een porie vormen.
- Hiervoor heb je hydrofobe aminozuren aan de buitenkant nodig en hydrofiele aan de
binnenkant.
- De B-barrels komen alleen voor in het E.coli buitenmembraan en de buitenmembraan van
mitochondriën.
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller MisterStudy. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $6.97. You're not tied to anything after your purchase.