Summary
Samenvatting Biotechnologie Toegepaste Biologie
- Course
- Institution
Samenvatting Biotechnologie van de opleiding Toegepaste Biologie jaar 2. Alle hoorcolleges in een document samengevat als voorbereiding op het tentamen
[Show more]
Seller
Follow
plantman
Reviews received
Content preview
Samenvatting BiotechnologieTable of Contents
Regulatie en modificatie genexpressie .............................................................................. 3
Mechanismen die RNA-transcriptie, RNA-processing en RNA-interferentie reguleren ................ 3
Transcriptionele regulatie bij prokaryoten ........................................................................ 4
Transcriptionele regulatie ........................................................................................................ 4
Positieve regulatie: .................................................................................................................. 7
Negatieve regulatie: ................................................................................................................. 7
Transcriptionele regulatie van eukaryoten ........................................................................ 8
Distaal ........................................................................................................................................................... 8
Proximaal ...................................................................................................................................................... 8
Post-transcriptionele regulatie bij eukaryoten ................................................................ 10
RNA-interferentie (RNAi)........................................................................................................ 11
ncRNAs ........................................................................................................................................................ 11
RNAi............................................................................................................................................................. 11
MicroRNA (miRNA)...................................................................................................................................... 11
small interfering RNA (siRNA) ..................................................................................................................... 11
Celdifferentiatie en genexpressie .................................................................................... 14
Determinatie ............................................................................................................................................... 14
Ontwikkeling lichaamsbouwplan ............................................................................................ 15
Pattern formation ....................................................................................................................................... 15
Het bicoïd morfogeen ................................................................................................................................. 15
Genetische variatie in de natuur ..................................................................................... 16
Transformatie .............................................................................................................................................. 17
Voortplantingscyclus van een bacterieel virus ............................................................................................ 17
Algemene transductie (transductie 1) ........................................................................................................ 18
Gespecialiseerde transductie (transductie 2) ............................................................................................. 18
Conjugatie ................................................................................................................................................... 19
Genetische merkers ........................................................................................................ 20
DNA-technieken: ......................................................................................................................................... 20
Hoe kom je aan een DNA-molecuul? ............................................................................... 20
Je gaat het extraheren: .......................................................................................................... 21
Het openbreken van de cellen (lysis ........................................................................................................... 21
Eiwitten verwijderen ................................................................................................................................... 21
DNA ‘uit oplossing halen’ ............................................................................................................................ 21
Toepassen tools in PCR ................................................................................................... 22
PCR-ingrediënten: ....................................................................................................................................... 23
mRNA analyseren ........................................................................................................... 24
DNA zichtbaar maken............................................................................................................. 25
Conclusie: .............................................................................................................................. 25
,DNA en RNA-technieken ................................................................................................. 26
Sequentietechnieken ...................................................................................................... 26
Sanger sequencing (1st generation) ........................................................................................ 26
Next generation sequencing (2nd generation) ........................................................................ 27
Beyond next generation sequencing (3rd generation) ............................................................. 29
Merkertechnieken .......................................................................................................... 29
PCR-RFLP ............................................................................................................................... 30
Allel specifieke PCR ................................................................................................................ 31
PCR met microsatellieten ....................................................................................................... 32
Microarray............................................................................................................................. 32
RNA-sequencing analyses ....................................................................................................... 33
Kwantificeren qPCR & ddPCR ................................................................................................. 33
qPCR ............................................................................................................................................................ 33
ddPCR .......................................................................................................................................................... 34
qPCR vs ddPCR ............................................................................................................................................ 34
Genetische modificatie ................................................................................................... 35
CRISPR-CAS9 .......................................................................................................................... 38
Ethische zaken met betrekking tot modificatie van genen ............................................... 40
,Regulatie en modificatie genexpressie
Mechanismen die RNA-transcriptie, RNA-processing en RNA-interferentie reguleren
Reactiepaden (metabolic pathways) worden
op verschillende manieren gereguleerd:
- Snel: Negatieve feedback op
enzymactiviteit
- Langdurig: Regulatie van
enzymproductie door regulatie van
de genexpressie
Er zijn veel stappen bij de genexpressie, de
genexpressie kan in alle stappen van DNA
(DeoxyriboNucleicAcid) tot actief eiwit de
expressie ervan reguleren. De mechanismen
betrokken bij de regulatie van de
genexpressie worden epigenetische
mechanismen genoemd.
Regulatie chromatinestructuur:
- Acetylering met acetyl (-CH3CO) aan histonstaarten
- Methylering met methyl (-CH3) aan histonstaarten of aan cytosine in het DNA
- Fosforylering met fosfaat (-PO43-)
- DNA- en histonmethylering condenseren de chromatine
- Histonacetylering decondenseert
de chromatine
- De ontdekking van beïnvloeding
van chromatinestructuur door
modificatie van histonstaarten
heeft geleid tot de ‘histon-code-
hypothese’
Bij geslachtscelvorming wordt de meeste
methylering opgeheven. Het DNA wordt
gereset. Dit gebeurt niet altijd. De
overblijvende methylering is een
voorbeeld van genomische inprenting.
De markering is dan epigenetisch overerfbaar.
, Transcriptionele regulatie bij prokaryoten
Transcriptionele
regulatie
Post-transcriptionele
regulatie: RNA-
processing m.b.v. splicing
Post-transcriptionele
regulatie: RNA-
interferentie
Transcriptionele regulatie
DNA-bindingseiwitten binden altijd aan DNA met een specifieke nucleotidevolgorde,
bijvoorbeeld de TATA-box (speciale aanhechtingsplek) op de promotor van een gen.
Daarnaast zorgen DNA-bindingseiwitten voor een reactie op DNA, bijvoorbeeld transcriptie
met RNA-polymerase
Waar een blokkering plaatsvindt, ookwel, negatieve crontrole van de transcriptie door
repressie. Bij blokkering spreek je altijd van repressie.
Negative control is een mechanisme waar altijd een repressor aanwezig is die aan het DNA
bindt.
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller plantman. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.25. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
64438 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now