Summary
Samenvatting Biochemie Van Lint (E04C1C)
- Course
- Institution
Samenvatting met alle te kennen leerstof van biochemie (inclusief achtergrondinformatie)
[Show more]
1 review
By: mettepeeters • 2 year ago
Seller
Follow
tinakosari
Reviews received
Content preview
Biochemie/moleculaire biologie VAN LINT1. Biomoleculen
‘Persoonlijkheid’ van biomoleculen wordt bepaald door hun functionele groepen.
De eigenschappen zijn vervat in alle organische elementen die men aantreft.
3D-structuur is minstens even belangrijk als de organische elementen
➔ Van belang voor de interacties (bv. met eiwitten; zie AcetylcoA)
Vb. 1 belang 3D-structuur:
R-thalidomide S-thalidomide
Organisch en chemisch identiek maar op biochemisch vlak helemaal niet:
S-thalidomide veroorzaakt geboorteafwijking
➔ Werd gegeven tegen ochtendmisselijkheid
➔ Bindt met heel andere eiwitten dan degene die nodig zijn
➔ Gevolg: verstoort ontwikkeling
R-thalidomide: harmless
Vb. 2 belang 3D-structuur:
R-Carvone: smaak van pepermunt
S-Carvone: smaak van karwij
Conclusie: 3D-structuur important as hell!
1
,1.1. Aminozuren
Posities in het AZ aangeven met Griekse letters of nummers.
Zijketen hangt aan de C met de carboxylgroep
α-C (COOH)
ε-C (NH3)
AZ komen voor in een D- of L-vorm (bij ‘dieren’ enkel L-aminozuren).
D-AZ vaak gebruikt door bacteriën voor speciale eiwitten (zie later).
Tabel: Groepen, afkortingen + pKR kennen.
2
, Apolaire, alifatische zijketens: Polaire ongeladen zijketens:
Alifaten: geen organische interacties + hydrofoob
Positieve geladen zijketens: Negatieve geladen zijketens:
Aromatische zijketens:
3
, 1) Glycine: Apolaire, alifatische zijketens
• Geen zijketen (H-atoom)
• Maar 3 verschillende substituenten
Geen assymetrisch C
• Assymetrisch AZ
• Grotere conformationele flexibiliteit:
Rond peptidebinding geen rotatie mogelijk
Bindingen op α-C: wel rotatie mogelijk
Rotatie met H-atoom veel gemakkelijker want kleiner dus weinig kans op botsingen met
andere atomen
Glycine vormt vaak scharnieren (voor het vormen van eiwitten)
Belangrijk voor functie van eiwit
2) Leucine, isoleucine, alanine, valine, methionine:
Apolaire, alifatische zijketens
• Inert en alifatisch
• Apolair en hydrofoob grote stabiliteit, geven
structuur aan eiwit
• Geen functionele groepen
• Zijketens clustreren samen
OPM: isoleucine
o Extra asymmetrisch centrum
OPM: methionine
o Thioether
OPM: alanine
Kleinste zijketen (CH3)
➔ Belangrijk voor in vitro mutagenesis / site directed mutagenesis
Welk AZ van eiwit X is belangrijk voor de functie van eiwit X? SDM gebruiken
Ideaal:
Zijketen afknippen zodat het niet meer kan bijdragen tot de functie van het eiwit
(Kan niet)
Equivalent:
In genetische code van eiwit: codon dat voor die functie codeert veranderen door
codon dat codeert voor een ander AZ (hier alanine)
➔ Grote keten wordt vervangen door kleine (CH3)
Indien proteïne nog steeds werking verricht: foute hypothese!
4
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller tinakosari. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $9.10. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
53068 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now