Summary
Samenvatting Methoden In Het Biomedisch Onderzoek Prof. Thorrez
- Course
- Institution
Samenvatting Methoden In Het Biomedisch Onderzoek, deel Prof. Thorrez
[Show more]
Seller
Follow
cedricbauters
Reviews received
Content preview
Samenvatting Methoden:Prof. Thorrez
Deel 1: Data intelligence
Hoe vind ik genexpressie data?
Hoe vind ik eiwit expressie data?
Hoe vind / maak ik interactie netwerken?
Help, ik heb een lijst van genen / eiwitten
Hoe literatuur zoeken?
Zoeken: ‘other cool stuff’
Verborgen voor Pubmed: patenten
Protocols zoeken
Data visualisatie
‘Databases’ en ‘webservers’ zoeken
Hoe vind ik genexpressie data?
In heel de cursus zijn er ondertussen al een groot aantal methoden uitgelegd die binnen een
(bio)medisch setting worden gebruikt. Daarentegen blijft het belangrijkste toestel dat een
onderzoeker gebruikt zijn / haar computer waar een groot aantal ‘internettools’ terug te vinden
zijn waarop heel veel informatie samen gebundeld zit. Met de stortvloed aan data zijn er heel
veel van die ‘tools’ ontwikkeld die onderzoekers in staat stellen om deze data te gaan
gebruiken en interpreteren. Dit zijn ‘tools’ en en bijgevolg ook vaardigheden die binnen de
(bio)medische wereld, maar ook daarbuiten, zeer gegeerd zijn om te gaan gebruiken voor tal
van toepassingen.
Om genexpressie daata te verkrijgen, zijn er drie veel gebruikte ‘tools’. Een eerste is
‘Genevestigator’ dat gebruik wordt om na te gaan in welke weefsels in organismen een
bepaald gen tot expressie komt. Zo kan aan de hand van deze ‘tool’ bv. nagegaan worden of
ribosomale proteïnen bv. RPL15 effectief ook goede referentiegenen zijn zoals ze ook worden
voorgesteld.
Een tweede belangrijke ‘tool’ is genaamd ‘Oncomine’. Deze ‘tool’ is een verzameling van
reeds verwerkte tumordata in verband met tumoren die bepaalde genen bv. PDGFA ‘up’- of
‘down’-reguleren. Zo kan de expressie van PDGFA bekeken worden in kanker versus
normaal weefsel.
Een derde en laatste ‘tool’ met betrekking tot genexpressie data is de ‘Gene Expression
Omnibus’ waar heel veel genexpressie daata bij elkaar is gebracht en waarbij kan gekeken
worden naar wat andere onderzoekers reeds hebben gedaan met betrekking tot een bepaald
1
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller cedricbauters. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $8.57. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
52355 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now