Eiwitten zijn opgebouwd uit aminozuren, aan elkaar gekoppeld via peptidebanden,
en maken meer dan 50% van het drooggewicht van de cel uit.
Bij praktische ieder process dat in een cel plaatsvind zijn eiwitten betrokken, ze
zijn onmisbaar voor de structuur en het functioneren van de cel.
Om het moleculaire mechanisme van een willekeurig biologisch proces te
doorgronden moeten dus altijd eiwitten worden bestudeerd.
Biochemie is de tak van de wetenschap die zich bezig houdt met de studie van de
chemische samenstelling van levende materie en de chemische veranderingen (de
reacties van de processen) die in levende materie plaats vinden.
3.2 Aminozuren
Aminozuren hebben een zure carboxylgroep en een basische aminogroep
De zure en basische groep zitten aan hetzelfde koolstofatoom, het α
koolstofatoom
Daarnaast bevatten de aminozuren nog een restgroep R, die voor alle 20
aminozuren, die in eitwitten voorkomen, verschillend is.
De aminozuren worden in groepen ingedeeld op basis van hun restgroep.
Daarbij wordt vooral gekeken naar polariteit en lading.
o Apolaire alifatische restgroep (alifatisch = niet-aromatische koolwaterstof
structuur)
o Aromatische restgroep
o Polair ongeladen restgroep
o Positief geladen restgroep
o Negatief geladen restgroep
Deze eigenschappen van aminozuren (polair, apolair, lading) zijn zo belangrijk
omdat ze een cruciale rol spelen bij vorming, stabiliteit en functie van eiwitten.
Ondanks het feit dat deze bindingen individueel vrij zwak zijn in vergelijking met
covalente bindingen is het cumulatie effect van een groot aantal van dit soort
interacties zeer significant binnen eiwitstructuren.
Aminozuren worden vaak aangeduid met een 3-letter code. Het bestaat meestal
uit de eerste drie letters van het aminozuur.
Apolaire alifatische restgroepen
Aromatische restgroepen
Eigenschappen beide restgroepen
IEP van ongeveer 6
Apolair: vorming van hydrofobe
interacties en van der Waals interacties
Slecht oplosbaar in water
6
, Polair ongeladen restgroepen
Eigenschappen
IEP van
ongeveer 6
Polair: vorming
van
waterstofbinding
en
Wateroplosbaar
Zure restgroepen
Eigenschappen
IEP van ongeveer 3
Kunnen negatief geladen zijn: vorming van ionogene
bindingen
Wateroplosbaar
Basische restgroepen
Eigenschappen
IEP van 8-11
Kunnen positief geladen zijn: vorming van
ionogene bindingen
Wateroplosbaar
3.3 Peptideband, peptiden en eiwitten
Aminozuren vormen de bouwstenen voor eitwitten, doordat de α-aminogroep van
het ene aminogroep koppelt aan het α-carboxyl groep van het andere aminozuur
Er worden voor het maken van eiwitten 20
aminozuren gebruikt, ze koppelen aan elkaar
door middel van een covalente amidebinding
(ook wel peptide binding genoemd)
De vele verschillende combinaties en
volgordes zorgen voor de eigenschappen en
biologische activiteit van de eiwitten.
Omdat ook peptide en eiwitten zure en
basische groepen bestaan, bestaat er voor een
peptide of eiwit ook een pH, waarbij deze
positieve en negatieve ladingen elkaar
uitmiddelen en de gemiddelde nettolading dus
0 is
Ook peptiden en eiwitten hebben dus een iso- electrisch punt (pH waarbij de
nettolading 0 is) en ook hier kan men dus voorspellen of een peptide of eiwit bij
een bepaalde pH positief of negatief geladen zal zijn
6
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller Cristy123. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.88. You're not tied to anything after your purchase.