Summary
Samenvatting H3: concepten van overerfbare epigenetica
- Course
- Institution
Dit is een samenvatting van het 3e hoofdstuk van het keuzevak Epigenetica gegeven door prof. Van den Berghe
[Show more]
Seller
Follow
student2018BMW
Reviews received
Content preview
H3. concepten van overerfbare epigeneticamitotische erfelijkheid
1. cellulaire differentiatie
Meest bekende voorbeeld van overerving = celdifferentiatie
• Een cel moet specialiseren, eenmaal dit is gebeurd zal de cel nog proliferen maar is het niet
meer mogelijk om van functie te veranderen (levercel blijft levercel,…)
• Dus niet enkel DNA moet verdubbeld worden, ook de methylatiepatronen in de dochtercel
moeten gekopieerd worden
Eénmaal dat het weefsel gedifferentieerd is tijdens de embryogenese, heb je continue
weefselvervanging waarbij dus oude cellen vervangen worden door nieuwe cellen.
Na het vormen van bv een levercel, zal deze levercel vervangen worden door een nieuwe levercel
waarbij zowel het DNA als de epigenetische code van de levercel gekopieerd moet worden.
Werking
• Een embryonale stamcel heeft nog geen epigenetische code → deze stamcel is omnipotent
en heeft nog de mogelijkheid om te differentiëren in alle soorten celtypen
• Tijdens de ontwikkeling ontstaat de epigenetische barcode door externe signalen waardoor
een stamcel bv differentieert tot een levercel
• In weefsels die zich continu hernieuwen, heb je stamcelcompartimenten → dit zijn
weefselspecifieke stamcellen (maag, lever,…)
• Deze stamcellen hebben nog een zekere plasticiteit
en zijn niet finaal gedifferentieerd → ze gaan een
deel van de stamcelsignatuur van de lever mee
moeten kopiëren tijdens de celdeling waarbij dan
ook nog eens finale differentiatie plaatsvindt → Dit
alles moet gekopieerd kunnen worden in
nakomelingen
!! Elk gespecialiseerd celtype heeft een unieke DNA
methylatie code
!! Cellulaire differentiatie blijft behouden over veel
celdelingen
Celtype specifieke differentiatie
Dit proces is mogelijk door 2 master TF-complexen → polycomb en trithorax die een belangrijke
invloed hebben tijdens de embryogenese (organogenese, vorming ledematen,…)
1
, • zijn betrokken in de bepaling van de actieve of onderdrukte toestand van de genexpressie en
dus de cellulaire differentiatie
• Dit doen ze door verschillende methylatie patronen op het DNA te zetten
• Polycomb complexen zijn eiwitten die vooral zorgen voor silencing (repressie)
• Trithorax complexen zijn eiwitten die vooral zorgen voor activatie
• Celdifferentiatie vereist dat polycomb en trithorax eiwitten naar de juiste plaatsen getarget
worden in het genoom (in deze targetting zijn ncRNAs belangrijk) tijdens de
ontwikkelingsbiologie
• De embryogenese hangt heel hard af van het evenwicht tussen deze 2 eiwitten op de
verschillende genen
• Hoxa gen cluster is belangrijk → software om
organismen te maken
• Embyrogenese: in verschillende stadia zijn er
verschillende hoxa genen die aan of uit staan →
choreografie van hoxagenen wordt gestuurd
door de binding van trithorax en polycomb
complexen
• Long non coding RNA’s zijn belangrijk om
chromatinecomplexen te vormen → lnRNA gaan
juiste complexen op juiste genen steken →
targeting van polycomb en trithorax complexen
gaat heel sterk gestuurd worden door lncRNA’s
die juiste complexen op juiste hoxgenes gaan
afzetten
o Polycomb en trithorax TF-complexen zijn essentieel voor assemblering van
chromatinemodifiers (writers,erasers)
o Figuur : TA = transcriptional activator en TR = transcriptional repressor
Drosophila als model voor cellulaire differentiatie
Resultaat van chromatine activatie of repressie gaat hoxagenen aan of uit zetten zodat in bepaalde
regio’s van de vlieg de hoxagenen net wel of net niet tot expressie komen.
Figuur: kleurenpalet hoxagenen
• Heel gesegmenteerd → Eenmaal er segmentatie is
kan per segment een bepaald hoxa gen tot expressie
komen
• Spaciale expressieregulatie en extra regulatie door
epitranscriptomics
o als er nog geen segmentatie is (heel vroeg in
embryogenese) → nog geen compartimentalisatie → lokale translatie van
hoxagenen door epitranscriptoom regulatie → bepaalde RNA’s met een bepaalde
methylatie gaan naar één kant van embryo getransporteerd worden
• Aantal hox mRNA’s gaan zelf ook gemethyleerd worden waardoor je asymmetrische
expressie krijgt of translatie van sommige van die hoxagenen
2
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller student2018BMW. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.39. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
67096 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now