100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Samenvatting Moleculaire Biologie, hoofdstuk 10 (F.Claessens) BMW en THK $3.38
Add to cart

Summary

Samenvatting Moleculaire Biologie, hoofdstuk 10 (F.Claessens) BMW en THK

 0 purchase
  • Course
  • Institution

Samenvatting op basis van mijn notities en slides van de les. Voor de richtingen Biomedische Wetenschappen en Tandheelkunde, deze zien dezelfde leerstof in dit vak.

Preview 2 out of 5  pages

  • June 12, 2022
  • 5
  • 2020/2021
  • Summary
avatar-seller
Hoofdstuk 10: DNA technologie

Fragmenteren van DNA

● Probleem bij lokalisering van genen in genoom = lengte chromosomen en
repetitiviteit van basen
○ Eerste oplossing ⇒ DNA fragmenteren door breken via niet-specifieke
endonucleasen of via sonicatie
■ Nadeel = willekeurige breuken
○ Uiteindelijke oplossing bleek uit onderzoek uit bacteriën ⇒ doen aan
transformatie = opnemen van DNA, met bepaalde restrictie (niet elk soort
DNA kan worden opgenomen) door endonucleasen
■ = restrictie-enzymen ⇒ herkennen ‘vreemd’ DNA en deze afbreken
■ Herkennen bepaalde palindromen van 4,6 tot 8 basenparen lang en
knippen in of in de omgeving van deze sequenties
● Doen dit adhv van hydrolysering van de fosfodiesterbinding in
de ruggengraat van de DNA keten
○ In het midden van het fragment ⇔ exonucleasen
● = restrictiesites
● Hoe bescherming eigen DNA tegen verknipping?
○ 2de enzym ⇒ voert methylaties uit van specifieke bases in de
herkenningssites ⇒ sequentie wordt niet meer herkend door
restrictie-enzymen
● Resultaat van knippen
○ Complexiteit genomisch DNA daalt
○ 1 gen wordt altijd op dezelfde manier geknipt

Terugvinden van een specifiek DNA fragment

● Denaturatie DNA
○ Uit elkaar halen van 2 complementaire strengen
○ Door H-bruggen te verbreken op een hoge temperatuur
● Hybridiseren DNA
○ Vormen van een dubbele helix
○ Radioactief/fluorescent merken van een streng vòòr hybridisatie om
complementair fragment te lokaliseren = probing
■ Wordt gebruikt in FISH




1

, Klonen van DNA fragmenten
● Plasmiden
○ Extrachromosomale circulaire minichromosomen bij bacteriën
○ Moet ORI bevatten ⇒ anders verloren bij snelle delingen van bacterie
○ Bevatten selectieve merker, bv. Gen
■ Codeert voor voordeel voor gastheer
■ Bevat dit geen merker dan verdwijnt plasmide zeer snel
■ Vaak kenmerken zoals resistentie
○ Kloneren = inbrengen van reeks restrictie-sites naast elkaar
■ = multiple cloning site/polylinker
■ Meerdere restrictoesfragmenten in eenzelfde plasmide kloneren
● Transformatie + kloneren
1. Plasmide (=vector) wordt met bepaald restrictie-enzym geknipt
2. Vermenging met fragment X (=insert), ook behandeld met hetzelfde enzym
3. Uiteinden hybridiseren want compatibel + DNA ligase verbindt
4. Voedingsbodem met DNA + bacteriën ⇒ transformatie van bacteriën
5. Bacteriën, bv. E. Coli, vermeerderen
6. Bij groot aantal bacteriën wordt plasmide opgezuiverd

● Nieuwe manier om te kloneren
○ Vector is onafhankelijk van de restrictieplaatsen
○ Gezuiverde enzymen doen aan homologe DNA recombinatie tussen uiteinden
plasmide en DNA-fragment
○ Plasmide is lineair en wordt samen met fragment bekomen adhv PCR
○ Sneller en efficiënter

Bepaling van een DNA sequentie

Enzymatische methode

1. Plasmide met insert, fragment dat men in sequentie wilt zetten, wordt
gedenatureerd
2. Hybridisatie met oligonucleotide dat complementair is aan een sequentie 5’ vh insert
3. Mengsel wordt verdeeld over 4 recipiënten met een specifiek type
dideoxynucleoside-trifosfaten (ddNTP)
- Bevatten geen 3’OH-groep ⇒ DNA synthese stopt hier
4. Oligonucleotide wordt gebruikt als primer door DNA-polymerase ⇒ opbouw van een
complementaire streng op basis van deoxyribonucleotiden (dNTP’s)

Voorbeeld ddATP



2

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller EmilieFZ. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $3.38. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

64670 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now

Start selling

Recently viewed by you


$3.38
  • (0)
Add to cart
Added