Summary
Samenvatting Begrippenlijst Moleculaire Biologie
- Course
- Institution
- Book
Alle nieuwe/moeilijkere begrippen uit de hele cursus met gevatte uitleg
[Show more]
Connected book
Book Title:
Author(s):
- Edition:
- ISBN:
- Edition:
More summaries for
-
Summary biomolecular architectures (NWI-MOL168)
-
Poster cell cycle overview (advanced molecular biology NWI-BB17C)
Seller
Follow
onavandermeiren
Content preview
DNA: deoxyribonucleic acid Proteïnen = eiwitten
Lipiden = vetten
Carbohydraten = koolwaterstoffen
Nucleïnezuren:
Genen: informatie-bevattende elementen die de karakteristieken van een individu, maar ook
soort van het individu bevat, coderen voor erfelijke eigenschappen
Alkaptonurie: erfelijke stofwisselingsziekte waarbij urine bij contact met lucht zwart kleurt
door hogere concentraties homogentisinezuur, recessief kenmerk waarbij 1 defect gen 1
defect enzym oplevert
Chromosomen: dragers van de genen
Differentiële (ultra)centrifugatie: steeds kleinere organellen worden naar de bodem van een
centrifugebuis gebracht door een toestel dat een hoge rotatiesnelheid gebruikt
Pellet: blijft na centrifugatie op bodem
Supernatans: bovenstaande oplossing na centrifugatie
Densiteitscentrifugatie: centrifugatie waarbij gebruik wordt gemaakt van verschil in
dichtheid = densiteit
Transformatie: wanneer bacteriën genen uit hun omgeving opnemen
S-stam: kolonies van deze bacteriën hebben een gladde (=Smooth) vorm, veroorzaakt
longontsteking
R-stam: kolonies van deze bacteriën hebben een ruwe (=Rough) vorm, niet in staat om
longontsteking te veroorzaken
DNA: suiker + fosfaat + basen, hierin zitten de genen vervat
Bacteriofagen: virussen die bacteriën infecteren door te parasiteren op reproductieve en
biosynthetische mechanismen, bestaat uit nucleïnezuurmolecule in een eiwitmantel
Radioactief fosfaat: 32P
Radioactief zwavel: 32S
Deoxyribose = bèta-D-2 deoxyribose: suiker in DNA
Nucleobasen: purines (adenine en guanine) en pyrimidines (thymine, cytosine, uracil) in DNA
Nucleoside: nucleobase verbonden aan ribose via N-bèta-glycosidische binding
Nucleotide: fosfaatgroep van een nucleoside is aan de 5’koolstof verbonden
Deoxyribonucleoside-tri-fosfaten = dNTP’s: via fosfoanhydridebindingen kunnen tot 3
fosfaatgroepen in serie aan het 5’koolstofatoom gehangen worden
Nucleotidetrifosfaten = NTP’s: dNTP’s waarvan de ribose niet gedeoxyleerd is, voornaamste
overdragers van biochemische energie = fosfaatenergie
Fosfodiesterbindingen: 5’koolstof van de ene deoxyribose wordt via een fosfaatgroep met
de 3’koolstof van de vorige deoxyribose verbonden
cAMP = cyclisch adenosine mofosfaat: signaalmolecule, gesynthetiseerd door
adenylaatcyclase
Adenylaatcyclase: alfafosfaat van ATP verbinden met 3’OHuiteinde van eigen ribose
cAMP fosfodiesterase: cAMP omzetten naar AMP, door hydrolyse van verbinding tss fosfaat
en 3’OH uiteinde van ribose
S-adenosyl-methionine: donor voor methylgroep op basen en eiwitten
Caffeïne: opwekkend middel in thee en koffie dat een inhibitor van fosfodiesterase is zodat
het de effecten van cAMP versterkt
, AZT: wordt gebruikt bij behandeling van AIDS (= acquired immune deficiency syndrome)
doordat het een reverse transcriptase inhibeert dat noodzakelijk is voor replicatie van HIV-
virus
Coenzyme A: betrokken bij acyltranfer-reacties, biomolecule waarin basen en nucleosiden in
aanwezig zijn
NAD = nicotinamide adenine dinucleotide: betrokken bij elektron transfer, biomolecule
waarin basen en nucleosiden in aanwezig zijn
FAD = flavin adenine dinucleotide: betrokken bij elektron transfer, biomolecule waarin
basen en nucleosiden in aanwezig zijn
Complementaire basen: 2 H-bruggen tussen A en T, 3 tussen G en C en de basenparen liggen
in een vlak bijna loodrecht op ruggengraat
Palindromische sequentie: de onderste streng van DNA die we van 5’ naar 3’, van rechts
naar links lezen heeft dezelfde sequentie als de bovenste streng
Escherichia coli (E. Coli): bacterie in de darm, talrijk aanwezig, wordt veel onderzocht,
prokaryoot (1 celkern)
Hyperchromiciteit: de absorptie van een DNA-oplossing die bij een bepaalde temperatuur
toeneemt tot een volgende plateauwaarde
Hybridisatie: fenomeen waarbij 2 complementaire DNA-strengen elkaar terugvinden op
voorwaarde dat het DNA-mengsel niet te complex is en de temperatuursdaling traag gebeurt
DNA elektroforese: gebruikt om (1) DNA te bekijken, (2) DNA-moleculen van verschillende
lengte te scheiden, (3) DNA fragmenten opzuiveren mbv agarose.
Agarose: hydrofiel, niet-ionisch, sterk gellerend polysaccharide dat uit zeewier wordt
gezuiverd en opgelost kan worden door opwarming
Ethidiumbromide: gebruikt om DNA zichtbaar te maken doordat het na UV-belichting
fluoresceert het, is een planaire stof die zich tussen baseparen in dubbelstrengig DNA zet,
carcinogene stof
Carcinogeen = kankerverwekkend
SYBRSafe: vervanging van Ethidiumbromide omdat het minder gevaarlijk is
, DNA-replicatie
DNA-replicatie: kopiëren van DNA
Semi-conservatieve replicatie: bij de replicatie van DNA wordt één streng doorgegeven en
de andere behouden (afkomstig van de moedercel)
14
N: normale N-isotoop
15
N: zware isotoop van N dat niet radioactief is
DNA polymerasen: staan in voor DNA synthese
dNMP’s: =2’-deoxynucleotide monophosphate, op de 5’positie worden 2 bijkomende
fosfaatgroepen aangebracht door kinasen waardoor dNTP’s (=deoxyribonucleoside-
trifosfaten) ontstaan
Pi: anorganisch fosfaat
ORI: =origin of replication, hier start de replicatie van DNA (+/- 250 bp lang en rijk in A/T bp,
waarbij specifieke enzymen zijn betrokken zodat dubbele helix smelt en DNA pol-complexen
kunnen aangrijpen)
Helicase: DNA-strengen uit elkaar halen doordat 1 van de 2 strengen door de ring van 6
moleculen gehaald word en hiervoor wordt E gebruikt uit ATP-hydrolyse (bij synthese van
DNA)
Topoisomerase I: relaxeert superwinding door 1 streng open te knippen, waardoor andere
DNA-streng uit de helix vrij kan ronddraaien waarna de breuk gesloten wordt (bij synthese
van DNA)
Topoisomerase II: introduceert een superwinding in DNA-helix doordat beiden DNA-
strengen in 1 dubbele helix verbroken worden, waarna een 2 de helix door de opening wordt
gehaald en dan wordt de geopende helix terug hersteld, ATP-verbruikend proces (bij
synthese van DNA)
Camptothecin: uit schors van camptotheca-boom, is een anti-tumor agens dat
topoisomerase I inhibeert, waardoor de replicatie in snel-delende cellen bemoeilijkt wordt
SSBP: =single stranded binding proteins, beschermd enkelstrengig DNA tegen afbraak (bij
synthese van DNA)
Primase: RNA-polymerase, maakt 3’OHuiteinde (die door DNA-polymerasen worden
herkend als startposities voor DNA-synthese) door korte RNA fragmenten complementair
aan enkelstrengig DNA te maken (bij synthese van DNA)
DNA-polymerase (DNA pol III voor E. coli, DNA pol delta bij EU): kan na herkenning van
3’OH als startpositie voor DNA-synthese DNA aanmaken in 5’-3’ richting
Sliding clamp: DNA-polymerase vasthouden zodat het met het DNA geassocieerd blijft en
zodat DNA-polymerisatie processief gebeurt
DNA pol I bij E. coli: RNA primertje gemaakt door primase vervangen door DNA aan de
uiteinden van de Okazaki fragmenten (bij synthese van DNA)
3 enzymatische activiteiten van DNA polymerase (bij synthese van DNA):
o 5’-3’ polymerase activiteit
o 5’-3 exonuclease activiteit: verwijderen van RNA-primers
o 3’-5’ exonuclease activiteit: DNA streng die net aangemaakt is thv polymerase-
centrum terug te verwijderen, speelt een belangrijke rol voor proofreading
Proofreading: foute nt zullen fout H-bruggen vormen en ontstaat een verwrongen helix,
waardoor het foute nucleotide niet meer in polymerase site maar in een exonuclease
centrum. Wanneer juiste nt in het polymerase centrum zit, dan is er juiste H-brugvorming
met template/matrijs, waardoor er een conformatieverandering plaatsvindt en polymerase
centrum kan werken
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller onavandermeiren. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.42. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
78252 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now