100% tevredenheidsgarantie Direct beschikbaar na je betaling Lees online óf als PDF Geen vaste maandelijkse kosten
logo-home
Eerder door jou gezocht
Eerder door jou gezocht
logo
The Biomolecules (Protein, CHO, Lipids) $7.99
In winkelwagen
Snel navigeren naar
Voorbeeld
  2.  
  3. Ateneo De Manila University
  4.  
  5. Biochemistry

College aantekeningen

The Biomolecules (Protein, CHO, Lipids)
 0 keer verkocht
  • Vak
  • Biochemistry
  • Instelling
  • Ateneo De Manila University
  • Boek
  • Harper\'s Illustrated Biochemistry Thirty-First Edition

Lecture notes study book Harper's Illustrated Biochemistry Thirty-First Edition of Victor Rodwell, David Bender - ISBN: 9781259837944, Edition: 31, Year of publication: - (medicine notes)

Voorbeeld 1 van de 6  pagina's

Document informatie

  • 27 augustus 2022
  • 6
  • 2021/2022
  • College aantekeningen
  • Dr.
  • Alle colleges

Onderwerpen

  • biomolecules
  • proteins
  • carbohydrates
  • lipids
  • biochemistry
  • harpers biochemistry
  • medicine

Gekoppeld boek

book image

Titel boek:

Auteur(s):

  • Uitgave:
  • ISBN:
  • Druk:

Meer samenvattingen voor studieboek

  • Class notes Biochemistry Harper's Illustrated Biochemistry Thirty-First Edition, ISBN: 9781259837944
  • Class notes Biochemistry Harper's Illustrated Biochemistry Thirty-First Edition, ISBN: 9781259837944
  • Class notes Biochemistry Harper's Illustrated Biochemistry Thirty-First Edition, ISBN: 9781259837944
Alles voor dit studieboek (9)

Geschreven voor

  • Ateneo De Manila University
  • Biochemistry
Alle documenten voor dit vak (12)

Verkoper

avatar-seller
compiler

Voorbeeld van de inhoud

MODULE 2: The Biomolecules (Protein, CHO, Lipids)

AMINO ACIDS, PEPTIDES & PROTEINS

1. Differentiate / define common L-a amino acids and unusual L-amino acids
- Monomer units from which polypeptide chains of proteins are constructed
- Only L-a-AA occur in proteins, though both D-AA and non amino acids occur in nature
- Subset of only 20 AA constitute monomer units from which polypeptide backbones of proteins are constructed
- All proteins contain varying proportions of the 20 L-a-AA
1.1. Unusual AA and proteins where they are found
- Arise by posttranslational processing (occurs after formation of polypeptide backbone) methylation, formylation, acetylation…
- Cysteine -> oxidation of –SH group of 2-cysteine to an S-S disulfide bond
- amino terminal glutamate of glutathione -> protein folding and metabolism of xenobiotics linked to cysteine by non peptide bond
- amino terminal of glutamate of thyrotropin-releasing hormone (TRH) is cyclized to pyroglutamic acid and the arboxyl group of the carboxyl terminal prolyl
residue is amidated.
- The non protein AA D-phenylalanine and ornithine are present in the cyclic peptide antibiotics (tyrocidin & gramidin S)
- Hepapeptide opioids dermorphin and deltophorin in the skin of South American tree frogs contain tyrosine and D-alanine
1.2. Describe how these unusual AA are formed
- linked by non peptide bonds / atypical peptide bonds

Common L-a AA & important roles in metabolic processes:
a. Ornithine, citrulline, argininosuccinate -> urea synthesis
b. Tyrosine -> formation of thyroid hormones
c. Glutamate -> neurotransmitter biosynthesis

Naturally occurring D-AA
a. free D-serine & D-aspartate -> brain tissue
b. D-alanine and D-glutamate -> cell wall of G(+) bacteria
c. D-AA -> peptides, antibiotics

*pH low enough to protonate carboxyl group, the amino group would also be protonated
pH sufficiently high for uncharged amino group to predominate, a carboxyl group will be present as R-COO(-)
uncharged -> no protonic equilibria

2. Describe the general structure of L-a AA
- absolute configuration L-glyceraldehyde
- dextrorotatory – R, levorotatory – L

Function of L-a AA:
a. nerve transmission
b. biosynthesis of porphyrins, purines, pyrimidines, urea
c. neuroendocrine system (hormones, hormone-releasing factors, neuromodulators…)

AA contain both amino and carboxylic acids function groups. In L- amino acid, both are attached in the same carbon atoms. Although some AA found in proteins
are dextrorotatory and some levorotatory at pH 7.0, all have the absolute configuration of L- glyceraldehyde and hence are L- amino acids.

3. Classify the 20 amino acids on the basis of their polarity and charge of the R group at physiologic pH
Nonpolar / Hydrophobic Polar / Hydrophilic
With Aliphatic Side Chains –HC R group Basic groups (-)
Glycine Arginine
Alanine Lysine
Isoleucine Histidine
Leucine Acidic groups and amides (+)
Valine Aspartic acid
With –S atoms Glutamic acid
Methionine With –OH groups
Cysteine Serine
With aromatic rings Threonine
Phenylalanine Tyrosine
Trytophan Neutral
Tyrosine Asparagine
Glutamine

4. Discuss the physical and chemical proteins of AA
4.1. Optical activity
- can rotate the plane of the plane-polarized light due to the tetrahedral orientation on the 4 different groups attached to 1 C atom
- AA are “chiral” (except glycine); achiral = symmetric
- d/t lack of a plane of symmetry = 2 stereoisomers* of AA (*one is non-superimposable mirror image of another)
4.2. Solubility
- reflects ionic character; in H2O, ionic attractions between ions in the solid AA are replaced by strong attractions between polar H2O molecules &
zwitterions* (molecules that contain equal number of ionizable groups of opposite charge& bear no net charge; internal transfer of H ion from –COOH to
–NH2 to leave an ion with both (+) and (-) charge)
- extent and nature of solubility varies, depending on size and nature of R group
- lack of solubility in non polar organic solvents such as HC is because of lack of attraction between solvent molecules and zwitterions
- soluble in polar solvents – H2O, ethanol
- insoluble in non-polar solvents – benzene, hexane, ether HC




AFK

Dit zijn jouw voordelen als je samenvattingen koopt bij Stuvia:

Bewezen kwaliteit door reviews

Bewezen kwaliteit door reviews

Studenten hebben al meer dan 850.000 samenvattingen beoordeeld. Zo weet jij zeker dat je de beste keuze maakt!

In een paar klikken geregeld

In een paar klikken geregeld

Geen gedoe — betaal gewoon eenmalig met iDeal, creditcard of je Stuvia-tegoed en je bent klaar. Geen abonnement nodig.

Direct to-the-point

Direct to-the-point

Studenten maken samenvattingen voor studenten. Dat betekent: actuele inhoud waar jij écht wat aan hebt. Geen overbodige details!

Veelgestelde vragen

Wat krijg ik als ik dit document koop?

Je krijgt een PDF, die direct beschikbaar is na je aankoop. Het gekochte document is altijd, overal en oneindig toegankelijk via je profiel.

Tevredenheidsgarantie: hoe werkt dat?

Onze tevredenheidsgarantie zorgt ervoor dat je altijd een studiedocument vindt dat goed bij je past. Je vult een formulier in en onze klantenservice regelt de rest.

Van wie koop ik deze samenvatting?

Stuvia is een marktplaats, je koop dit document dus niet van ons, maar van verkoper compiler. Stuvia faciliteert de betaling aan de verkoper.

Zit ik meteen vast aan een abonnement?

Nee, je koopt alleen deze samenvatting voor $7.99. Je zit daarna nergens aan vast.

Is Stuvia te vertrouwen?

4,6 sterren op Google & Trustpilot (+1000 reviews)

Afgelopen 30 dagen zijn er 65040 samenvattingen verkocht

Opgericht in 2010, al 15 jaar dé plek om samenvattingen te kopen

Begin nu gratis

Laatst bekeken door jou

Voordeelbundel ·

(0)

USPS SSA Window Exam Bundle

Tentamen (uitwerkingen) ·

(0)

OCS-Tactics Exam || All Correct.

Essay ·

(0)

PHIL 347N Week 5 Assignment: Journal

Tentamen (uitwerkingen) ·

(0)

Med-Surg: Fluid & Electrolyte

Tentamen (uitwerkingen) ·

(0)

SPLH 620 Exam Questions and Answers

Samenvatting ·

(0)

Mindmap Samenvatting Inleiding Film

Tentamen (uitwerkingen) ·

(0)

AML EXAM (CE)/15 QUESTIONS AND ANSWERS

Tentamen (uitwerkingen) ·

(0)

Hesi Exit Cat Exam 3, Answered

Samenvatting ·

(0)

Complete summary of 2nd part of EMF

$7.99
  • (0)
In winkelwagen
Toegevoegd