ZEER uitgebreide cursus die ik zelf heb opgesteld omdat ik nood had aan een ordelijke en uitgebreide cursus om methoden 3 te kunnen studeren.
In dit document staat de informatie vanop de slides gecombineerd met de mondelinge uitleg die werd gegeven tijdens de hoorcolleges.
Metaboliet = elke organische molecule in het lichaam met een MW < 1500 Da
= peptiden, oligonucleotides, suikers, nucleosiden, organische zuren, ketonen, aldehydes, amines,
aminozuren, lipiden, steroiden, xenobiotica
> 200.000 verschillende moleculen
= metaboloom; Verbonden door metabole pathways
Overzicht
1. Specifieke testen van individuele metabolieten
= traditionele metabolietenanalyse
Vereist vaak specifieke opzuivering, optimalisering van scheidingscondities, soms arbeidsintensief
RIA, HPLC, GC, CE, MS
Vaak enzymatische testen gekoppeld aan kleurreactie
Bv glucosetest voor diabetici
o GO (glucose oxidase) zet glucose om & H2O2 komt vrij H2O2 omzetten naar een
kleurreactie: kleurloos substraat wordt omgezet naar een roze kleur = recht evenredig met
suikerconcentratie
2. Metabolomics
Metabolomics = allesomvattende en simultane analyse van metabolieten in een biologisch systeem
Metabonomics = kwantitatieve analyse van een metabole respons op een stimulus
Soorten metabolomics:
Untargeted: zoveel mogelijk moleculen gaan meten. Je weet op voorhand niet wat er in zit
Targeted: je weet welke moleculen je wilt meten + je gaat dit op een kwantitatieve manier doen
gebruiken van MRM = multiple reaction monitoring = met triple quadrupool werken, 1ste
quadrupool zetten op de massa van het intact molecule, laatste (3de) quadrupool (hiertussen zit
een collisioncel) zet je op een bepaald fragment je kan zo lang meten als je wilt
Vb toepassing metabolomics: biomerker voor falen orgaantransplantatie kijken of de transplantatie niet
gaat afgestoten worden
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, Keuze is afhankelijk van welke apparatuur je ter beschikking hebt en afhankelijk van de afweging van de
voor- en nadelen. Examen: basisprincipes van NMR en MS moeten absoluut gekend zijn !!
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