Deze samenvatting van de moleculaire diagnostiek bevat verschillende technieken, methodes en diagnostische testen om genen/eiwitten/nucleïnezuren etc. te detecteren en te analyseren. Er worden plaatjes bij weergeven om de technieken beter te begrijpen. Ook deze stof wordt getoetst op de tentamens...
Les 1
-Moleculaire diagnostieken:
>Analyseren moleculen DNA/RNA/eiwitten en/of antilichamen
>Pathogenen
>Afwijkingen in genetisch materiaal
-Introductie moleculaire diagnostieken:
>
-Isolatie pathogeen:
>Microscopie
>Cultuur
>Voordelen en nadelen
-Antigeen/antilichaam detectie:
>Serologie/immunologie
>Antigeen-antilichaam
>Interferon-y
>Voordelen/nadelen
-Eiwit detectie:
>MALDI-TOF
>Voordelen/nadelen
-Genoom detectie:
>PCR
>RRT-PCR
>Voordelen/nadelen
-Diagnostische testen:
>Belangrijke aspecten:
*Specificiteit (specifiek zijn voor wat je wilt aantonen)
*Gevoeligheid
*Looptijd (niet te lang duren)
*Training van personeel (niet te moeilijk qua training)
*Apparatuur/lab (wel of niet op het lab)
*Kosten
*Betrouwbaarheid
-Nucleïnezuuranalyse:
>Nucleïnezuur isolatie (en daarna vermeerderen)
>PCR, sequencing
>RNA -> omkeerbare transcriptase
>Geautomatiseerde NA isolatie
*Voorbeeld: Roche MagnaPure
Made by: Iris Gülcher
, >UV-spectrometrie:
*Kwantiteit en kwaliteit
>Gelelektroforese
>Amplificatie: PCR, sequencing (wordt het meeste gebruikt)
-PCR amplificatie:
>Conventioneel vs real-time PCR:
*Kwalitatief (semi-kwantitatief) (niet precieze hoeveelheid) // kwantitatief (precieze
hoeveelheid)
*Eindfasedetectie (je meet op het einde) // detectie exponentiële fase (je meet
voortdurend)
*Open systeem (veel contaminatie) // gesloten systeem (min mogelijk contaminatie
krijgen van het vermeerderde product)
*Minder gevoelig // gevoelig
*Goedkoop // duur
> *Conventioneel op het einde
op de gel zetten
*Als iets eerder opkomt in
expotentiële fase kun je
kwantificeren (omdat er
meer in je product zat))
*Cicle of Quantification (CQ)
treshold (hoe lager CQ hoe
meer je van product hebt)
-Analyse van amplificatie:
>Fluorescentie (het meten van de samples):
*Sybr Green: bindt dsDNA
*Probes: doelspecifieke binding (hybridisatie) (3de stukje nucleïnezuur dat in de
sequentie schuift)
-Sybr Green smeltcurve analyse:
>Doel en andere dsDNA:
*Primer-dimer
*Aspecifieke producten
*Amplificatie afgerond heb je bepaalde hoeveelheid fluorescentie, al het dsDNA ga je
verwarmen (uitsmelten) bepaalde temperatuur gaan de strengen uit elkaar
(enkelstrengs DNA wordt gevormd), fluorescentie signaal zakt en als alles
enkelstrengs is heb je geen fluorescentie meer (50% fluorescentie over =
smelttemperatuur)
Made by: Iris Gülcher
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller iris70. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.88. You're not tied to anything after your purchase.
