100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
Previously searched by you
Samenvatting van alle oude en mogelijke examenvragen en uitwerking van alle oefensessies van het volledige vak metabolisme (behaald resultaat 16/20): Dit bevat een uitgebreide samenvatting van metabolisme gegeven door professor Wullaert. De samenvatting b$8.09
Samenvatting van alle oude en mogelijke examenvragen en uitwerking van alle oefensessies van het volledige vak metabolisme (behaald resultaat 16/20): Dit bevat een uitgebreide samenvatting van metabolisme gegeven door professor Wullaert. De samenvatting b
3 views 0 purchase
Course
Metabolisme
Institution
Universiteit Antwerpen (UA)
Samenvatting van alle oude en mogelijke examenvragen en uitwerking van alle oefensessies van het volledige vak metabolisme (behaald resultaat 16/20): Dit bevat een uitgebreide samenvatting van metabolisme gegeven door professor Wullaert. De samenvatting bevat al de oude examenvragen (beginnende met...
Hoofdstuk 8: nucleotide
metabolisme
Welk reactiemechanisme/motief wordt vaak toegepast in de de novo purine nucleotide synthese?
Leg uit met bijhorende structuren en een concreet voorbeeld van een stap in de purine synthese.
Gemeenschappelijk reactiepatroon terug te vinden
o Opeenvolgende stappen van activatie door fosforylatie gevolgd door een
verdringingsreactie
C-atoom met ketongroep wordt gefosforyleerd
ATP geeft fosfaatgroep aan zuurstofatoom
Nucleofiel kan fosfaatgroep verwijderen door verdringing
Verdringingsreactie geeft veel vrijgave van energie
Voorbeeld van dit patroon
o Glycine wordt gefosforyleerd door ATP en vormt 5 fosforibosyl-1-amine
NH2 gebonden aan een ribose dient als nucleofiel en valt aan op
carboxylgroep → vrijgave van PO42-
Hoe worden AMP en GMP gesynthetiseerd vertrekkende vanuit inositaat (IMP)? Geef reacties en
structuren. Bespreek ook hoe de balans tussen de hoeveelheid AMP en GMP gereguleerd wordt.
Verschil in AMP en GMP zit hem in de positie van het aminogroep en de aanwezigheid van
een ketongroep
o Start met activatie van het C-atoom waarop de aminogroep wordt geplaatst
Bij vorming van AMP gebeurt activatie door een GTP molecule
Bij vorming van GMP zal koolstofatoom geactiveerd worden door oxidatie
met behulp van NAD+ en H2O → ketongroep in intermediaire vorm gevormd
Nadien fosforylatie door ATP
o Nucleofiele verdringing zal de fosfaatgroep vervangen
AMP: Aspartaat voert verdringing uit en plaats aminogroep op juiste positie
Aspartaat is gekoppeld en moet gereduceerd worden tot enkel een
NH2-groep door afsplitsen van fumaraat Slide 20 en slide 22
GMP: glutamine en water wordt glutamaat en NH 3
NH3 voert verdringingsreactie uit van ketongroep
Balans tussen productie van AMP en GMP door negatief feedback systeem en reciproke
substraat relatie
o Committed step kan geïnhibeerd worden door AMP, GMP en IMP
o Reciproke substraat relatie heeft een invloed op omvorming van IMP naar product
Indien GTP uitgeput is zal de reactie naar AMP minder snel doorgaan
, Indien ATP uitgeput is zal de reactie naar GMP minder snel doorgaan
Wat wordt er verstaan onder de salvage pathway? Bespreek dit voor de purine nucleotide
synthese.
De Salvage pathway is de vorming van nucleotiden vetrokken vanuit recuperatie van
aanwezige basenparen in de cel
o Afkomstig van turnover DNA of het dieet
o Basen worden makkelijk gekoppeld aan ribose-eenheden
Veel minder ATP nodig dan bij de de novo synthese
Er dienen geen intermediairen geactiveerd te worden
Salvage pathway verloopt in drie verschillende stappen met specifieke enzymes
o Adenine + PRPP → adenylaat (AMP) + PPi
Katalyse door adenine fosforibosyltransferase
o Guanine + PRPP → guanylaat (GMP) + PPi
Katalyse door hypoxanthine-guanine fosforibosyltransferase
o Hypoxanthine + PRPP → inosinaat (IMP) + PPi
Katalyse door hyposanthine-guanine fosforibosyltransferase
PRPP = 5-fosforibosyl-1-pyrofosfaat
Bespreek het verband tussen het nucleotide metabolisme en anti-kanker drugs
Snel delende cellen (zoals kankercellen) hebben een grote hoeveelheid aan dTMP nodig
o Zijn extra gevoelig aan inhibitie van TMP biosynthese
→ inzetten op inhibitoren van enzymes nodig voor synthese van TMP
Thymidylaat synthase, dihydrofolaat reductase…
Fluorouracil wordt in vivo omgezet naar fluorodeoxyuridylaat (F-dUMP)
o F-dUMP wordt naar thymidylaat synthase omgezet naar een product dat gebonden
zal blijven op de actieve site van het enzyme → intermediair kan niet meer verder
gaan in de reactie -> suicide inhibitor
Dihydrofolaat analogen zijn competitive inhibitoren voor dihydrofolaat reductase
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller lemmeslodders. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $8.09. You're not tied to anything after your purchase.
