Dit document omvat de samenvattingen van de hoofdstukken die werden gegeven tijdens de lessen moleculaire biologie. Deze samenvatting leverde een 17/20 als eindscore voor dit opleidingsonderdeel.
2. Genstructuur, genexpressie en organisatie van het mens genoom
2.1 Genen die voor eiwit coderen
Genoom versus exoom
Het genoom omvat alle genetische informatie van een organisme. Het omvat het hele DNA.
Het exoom is het gebied van het genoom dat codeert voor eiwitten. Slechts 1,2% van het genoom codeert voor
eiwitten. Het exoom is de verzameling van alle exonen = coderende segmenten.
Splicing
Een gen wordt door RNA polymerase afgeschreven tot
pre-MRNA. Deze RNA streng ondergaat nog het proces van
splicing. In dit proces worden de niet coderende delen
(introns) verwijdert. Het MRNA begint bij het 5’ einde en
eindigt bij het 3’ einde. Voor het startcodon en het stopcodon
zie je nog een extra sequentie : 5’ en 3’ UTR. Deze gebieden
zijn zeer belangrijk voor genregulatie. Wordt meer over verteld
in zelfstudiepakket.
Chemische modificatie van eiwitten
Eiwitten kunnen na splicing nog gemodificeerd worden.
Hierbij worden er extra chemische groepen toegevoegd aan de
vertaalde eiwitten.
Proteïne structuur
Eiwitten kennen 4 vormen van opvouwing
1) primair = lineaire sequentie
2) secundair = pad dat de eiwit ruggengraat vormt in locale regio’s
● alpha helix
● beta sheet
● beta turn
3) tertiaire structuur = globale drie dimensionale structuur
4) quaternair = globale structuur van multimeer eiwit
Secundaire vormen van opvouwing
alpha helix
een rigide structuur. Gestabiliseerd door waterstofbruggen tussen carbonyl zuurstof en waterstof
van de amino die 4 aminozuren verderop gelegen is.
beta sheet
gestabiliseerd door waterstofbruggen tussen tegenover elkaar gelegen peptide op een
parallelle of antiparallelle manier.
Disulfidebruggen
zijn covalente bruggen die het eiwit in structuur houden. onder gereduceerde vorm
binnen cel. geoxideerde vorm komt voor onder extracellulaire omstandigheden.
1
, 2.2 RNA genen
2.2.1 Noncoding RNA - historische visie
Noncoding RNA - regulatorische RNA moleculen
DNA wordt overgeschreven naar RNA. Coding RNA wordt nadien vertaald naar eiwitten.
Noncoding RNA zijn stukken RNA die niet vertaald zullen worden naar eiwitten.
Deze vorm van RNA zal voornamelijk huishoud functies uitvoeren. Voorbeelden :
● rRNA = ribosomaal RNA
● tRNA = transfer RNA
● snRNA = small nuclear RNA → splicing
● snoRNA = small nuclear RNA → chemische modificatie
Deze theorie beschrijft de oude visie op RNA.
Deze visie is niet fout, maar de theorie heeft nood aan aanvullingen.
2.2.2 Noncoding RNA - moderne visie
Noncoding RNA - Regulatorische RNA moleculen
Vroeger dacht men dat deze vorm van RNA op de achtergrond was gelegen.
Het blijkt dat deze vorm van RNA zeer belangrijk is voor genregulatie.
RNA world hypothese
De RNA world is een hypothetische periode die plaatsvond in tijden van de primitieve aarde.
Men geloofd dat tijdens deze periode RNA ook een drager was van de genetische info, en dat RNA ook dienst
deed als structurele elementen (wat nu de eiwitten zijn). Men geloofde dat RNA zowel genen als enzymen
vormden. Deze theorie is nooit bewezen geweest, maar men gaat er vanuit dat dit wel mogelijk is. Dit komt
door de structuur van RNA. RNA heeft net zoals eiwitten een ingewikkelde 3D opbouw. Omdat beide
structuren een gelijkaardige opbouw vertonen, zullen beide structuren dezelfde functies kunnen uitvoeren.
DNA is niet geschikt om deze enzymatische functies uit te voeren omdat DNA een enkelstreng is en geen
complexe 3D opbouw vertoond.
Verschillende soorten regulatorische RNA moleculen
We onderscheiden 3 soorten noncoding RNA
● lange ncRNA’s
○ antisens RNA
○ lange regulatorische RNA’s
● kleine ncRNA’s
○ miRNA’s (micro RNA)
○ Piwi protein interacting RNA’s (piRNA)
● competing endogenous RNA’s
2
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller silkeroofthooft. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $17.16. You're not tied to anything after your purchase.
