100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Samenvatting van alle hoorcolleges en werkcolleges van de cursus Moleculaire Biologie van de Cel week 1 t/m 3 (BMW33416) $7.72   Add to cart

Summary

Samenvatting van alle hoorcolleges en werkcolleges van de cursus Moleculaire Biologie van de Cel week 1 t/m 3 (BMW33416)

 27 views  1 purchase
  • Course
  • Institution
  • Book

Deze gedetailleerde samenvatting behandelt alles wat aan bod is gekomen tijdens de hoorcolleges en werkcolleges tijdens week 1 t/m 3 (membranen, signaaltransductie en onderzoeksmethoden) van de cursus Moleculaire Biologie van de Cel aan de Universiteit Utrecht (BMW33416). Daarnaast zijn de correspo...

[Show more]

Preview 6 out of 160  pages

  • No
  • Unknown
  • October 29, 2022
  • 160
  • 2020/2021
  • Summary
avatar-seller
Samenvatting moleculaire biologie van de cel
Membranen, signaaltransductie en onderzoekstechnieken



Biomedische Wetenschappen
2020-2021




Door Nicole (studente BMW)

,Inhoudsopgave
Membraanarchitectuur ........................................................................................................................... 4
Membranen ......................................................................................................................................... 4
Membranen in evolutie ................................................................................................................... 4
Hydrofobe effect ............................................................................................................................. 7
Samenstelling ...................................................................................................................................... 7
Modelmembranen .................................................................................................................................. 9
Structuur en eigenschappen van lipiden ............................................................................................. 9
Vloeibaarheid membranen............................................................................................................ 11
Smelten van lipiden ....................................................................................................................... 12
Regulatie vloeibaarheid membranen ............................................................................................ 14
Lipide "pakking" (laterale drukprofiel) .......................................................................................... 15
Liposomen als drug-carriers .......................................................................................................... 16
Membraaneiwitten ........................................................................................................................... 18
Onderzoek ..................................................................................................................................... 22
Anesthetica .................................................................................................................................... 24
Membraandikte ............................................................................................................................. 26
Bacteriële thermosensor ............................................................................................................... 28
Interacties van wateroplosbare eiwitten met membranen .............................................................. 29
Microbiële peptiden ...................................................................................................................... 29
Helical wheel ................................................................................................................................. 31
Amyloïden...................................................................................................................................... 31
Membraanbiogenese ............................................................................................................................ 36
Biogenese van membraaneiwitten ................................................................................................... 36
Functies ......................................................................................................................................... 36
Transport ....................................................................................................................................... 36
Signaalsequenties .......................................................................................................................... 37
Biogenese van mitochondriën en chloroplasten............................................................................... 40
Mitochondriën................................................................................................................................... 42
Matrixeiwitten ............................................................................................................................... 43
Porines (β-barrels) ......................................................................................................................... 46
Binnenmembraan eiwitten en tussenmembraanruimte .............................................................. 47
Endoplasmatisch reticulum (ER)........................................................................................................ 47
Co-translationele eiwittranslocatie ............................................................................................... 48
Glycosylering ................................................................................................................................. 49
Kwaliteitscontrole (QC) ................................................................................................................. 51

1

, Integrale membraaneiwitten ............................................................................................................ 54
Single pass integrale membraaneiwitten ...................................................................................... 54
Double pass integrale membraaneiwitten .................................................................................... 56
Multipass integrale membraaneiwitten ........................................................................................ 56
Biogenese van lipidenmatrix in membranen .................................................................................... 57
Glycerofosfolipiden ....................................................................................................................... 57
Sfingolipiden .................................................................................................................................. 57
Sterolen ......................................................................................................................................... 58
Verdeling van lipiden ..................................................................................................................... 59
Analysemethoden lipide samenstelling ........................................................................................ 59
Specifieke functies membraanlipiden ........................................................................................... 61
Biosynthese van glycerofosfolipiden ............................................................................................. 65
Intracellulair transport van glycerofosfolipiden ............................................................................ 72
Regulatie van de biosynthese van cholesterol .............................................................................. 83
Signaaltransductie ................................................................................................................................. 88
Homeostase....................................................................................................................................... 88
Eiwitten signaaltransductie ............................................................................................................... 89
Dubbele remming .......................................................................................................................... 90
Belangrijke pathways ........................................................................................................................ 91
Eiwitten ............................................................................................................................................. 92
Domeinen ...................................................................................................................................... 92
Scaffold eiwitten............................................................................................................................ 96
Intracellulaire signaleringscomplexen ........................................................................................... 97
Post-translationele modificaties ................................................................................................... 99
Moleculaire schakelaars .................................................................................................................. 102
Kinasen ........................................................................................................................................ 102
GTPasen ....................................................................................................................................... 107
Monomere GTPasen .................................................................................................................... 108
Heterotrimere GTPasen .............................................................................................................. 113
Calcium ............................................................................................................................................ 122
cAMP ............................................................................................................................................... 125
PKA .............................................................................................................................................. 125
Hormoon geïnduceerde cel responsen ....................................................................................... 127
Enzym gekoppelde receptoren ....................................................................................................... 128
Receptor tyrosine kinasen (RTKs) ................................................................................................ 128



2

, Wnt-signalering ............................................................................................................................... 135
Negatieve feedback ..................................................................................................................... 138
Crosstalk .......................................................................................................................................... 138
Coincidence detector .................................................................................................................. 139
Kwantitatieve aspecten voor cel signalering ................................................................................... 140
Negatieve feedback ......................................................................................................................... 141
Positieve feedback........................................................................................................................... 143
Coöperativiteit................................................................................................................................. 144
Onderzoekstechnieken........................................................................................................................ 145
Body of knowledge .......................................................................................................................... 146
Lokalisatie ........................................................................................................................................ 147
Nuclear factor of activated T-cells (NFAT)................................................................................... 147
Conclusie ......................................................................................................................................... 159




3

,Membraanarchitectuur
Membranen
Goedwerkende membranen zijn essentieel voor gezonde cellen en hebben een aantal kenmerken:
• Permeabiliteitsbarrière en vorming microcompartimenten
• Selectief transport
• Communicatie tussen binnen en buiten de cel
• Energielevering / opslag (met behulp van gradiënten)
• Dynamisch

Daarnaast vormen ze een belangrijke barrière voor:
• Medicijnen
• Toxische stoffen
• Virussen

Membranen in evolutie
Zeepbellen ontstaan door zelf-assemblage van amfipatische moleculen in lucht met water.
Amfipatische moleculen bevatten zowel een hydrofiele als hydrofobe groep. Bij de zeepbellen
zullen de hydrofiele groepen zich naar het water richten en de hydrofobe groepen naar de lucht.




Figuur 1 Schematische weergave van de zelf-assemblage van zeepbellen in lucht en water.
Op het moment dat er geen lucht aanwezig is in de omgeving, maar alleen water, zal de oriëntatie
precies andersom zijn. Dit is het geval bij membranen, hierbij richten de hydrofiele kopgroepen van
de vetzuren zich naar het water en de hydrofobe staarten zich naar elkaar, waardoor er een lipide
bilaag ontstaat. Hierbij is het hydrofobe effect de belangrijkste drijvende kracht voor de vorming van
lipide bilagen. Daarnaast bevorderen de vanderWaals krachten, tussen de koolwaterstofstaarten, de
dichte pakking van de staarten.




Figuur 2 Schematische weergave van de zelf-assemblage van membranen in water.


4

, Naast bovengenoemde manieren van assemblage zijn er ook nog andere manieren van assemblage,
waaronder micellen en liposomen. Hierbij geldt dat de vorm van de moleculen bepalend is voor de
organisatie.

Micellen
Bij micellen zijn de kopgroepen dikker dan de vetzuurstaarten (kegelvorm). Hierdoor kunnen ze niet
recht naast elkaar gestapeld worden en ontstaat er een bol. Bij membraanlipiden zijn de kopgroepen
even dik als de vetzuurstaarten (cilindrische vorm) en kunnen ze dus lineair gestapeld worden:
• Micel → Kegelvorm en waterig milieu
• Lipide bilaag → Cilindrische vorm en waterig milieu




Figuur 3 Schematische weergave van de verschillen in vorm tussen een micel en een lipide bilaag.
Omgekeerde kegelvorm
Er zijn echter ook lipiden met een omgekeerde kegelvorm. Hierbij is de kopgroep erg klein en bevat
het twee vetzuurstaarten. Fosfatidylethanolamine is hier een voorbeeld van, de verschillen zijn
hieronder geïllustreerd. Op het moment dat er veel lipiden met een omgekeerde kegelvorm in een
waterig milieu zitten, zullen deze lipiden assembleren tot een hexagonale fase. Hierbij richten de
hydrofiele kopgroepen zich naar het water toe, waardoor de buizen als het ware gevuld zijn met
water. Daarnaast richten de apolaire staarten zich naar elkaar toe, waardoor elke 'buis' omringd
wordt door zes andere buizen.




Figuur 4 Schematische weergave van de verschillen in de vorm van lipiden.



5

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller xnicolevdz. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $7.72. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

67474 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now

Start selling
$7.72  1x  sold
  • (0)
  Add to cart