TEST BANK FOR BIOCHEMISTRY, 7TH EDITION: BY JEREMY M. BERG
Biochemistry Exam 2 Notes / Study Guide / Summarized
Complete Test Bank Biochemistry 8th Edition Berg Questions & Answers with rationales (Chapter 1-36)
All for this textbook (14)
Written for
Rijksuniversiteit Groningen (RuG)
Life Science
Biochemie
All documents for this subject (9)
Seller
Follow
laura33
Reviews received
Content preview
DNA Replication, Repair and
Recombination
Biochemistry – hoofdstuk 28
28.1
Major en minor groeven in DNA
Major en minor groeven van DNA zijn heel belangrijk ze geven de mogelijkheid
tot het bekijken van DNA op een andere manier.
De oriëntatie van hoe het fosfaat op de suiker zit, zorgt voor de groeven. Dit komt
doordat de fosfaten en suikers aan dezelfde kant van de base zitten en in een
hoek op het platte basepaar staan. Dit zorgt ervoor dat er niet overal een gelijke
afstand is in de groeven van het DNA.
- Ieder basepaar heeft een andere ladingverdeling. Een eiwit kan dus aan de
ladingverdeling zien welke basen daar zitten. Dit is te zien in de major
groeve.
- In de minor groeve kan je zien dat er een basepaar zit, maar het is in ieder
basepaar hetzelfde, dus je weet niet welke er zit.
DNA polymerase
DNA polymerase is een template gestuurd enzym. Er is een primer nodig voor de
start en dNTP zorgt voor energie. ‘Proofreading’ vergroot de nauwkeurigheid
het zorgt dat basen selectief verwijderd kunnen worden.
Er zijn twee metaalionen nodig die helpen bij de coördinatie van DNA en
nucleotide. Deze metaalionen zitten in de
palm en zonder deze metaalionen kan het
enzym niet goed functioneren.
Twee H-banden met baseparen in de minor
groeve meten de afstand tussen baseparen.
Ze controleren of er wel een basepaar is
ingebouwd.
Een conformatie verandering na binding met
een nucleotide zorgt voor een ‘tight pocket’ in
DNA polymerase, waar alleen een correct
basepaar in past. De bovenste helix klapt dicht
als het precies past en de fosfodiester bond
wordt gemaakt. Als het niet past, gaat de
bovenste helix niet dicht en wordt er geen
fosfodiester bond gemaakt.
Polymerase kan daarna de goede base alsnog inbouwen.
DNA replicatie
Voor DNA replicatie is een primer nodig. Deze wordt gevormd doordat primase (in
een primosoom, gebied op het DNA) een RNA primer synthetiseerd van 5’ naar
3’. Vervolgens kan DNA replicatie plaatsvinden aan de RNA primer. De stukjes
RNA aan het begin van okazaki fragmenten worden vervangen door DNA door
DNA polymerase I.
Tijdens de DNA replicatie ontstaat er een replicatievork. De ene kant is de leading
strand en de andere de lagging strand. In de lagging strand zitten hele veel RNA
stukjes (in okazaki fragmenten). DNA ligase verbindt de okazaki fragmenten de
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller laura33. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.21. You're not tied to anything after your purchase.