Summary
Samenvatting Genetica H
- Course
- Institution
- Book
Samenvatting van hoofdstuk 21 uit Concepts of Genetics voor het vak genetica uit het 1e jaar LST en Biologie aan de RUG. Samenvatting over collegestof en leerstof uit het boek.
[Show more]
Connected book
Book Title:
Author(s):
- Edition:
- ISBN:
- Edition:
More summaries for
-
GNE3702- Study Notes and diagrams
-
GNE2602-General Genetics B
-
GNE2601- General Genetics A
Seller
Follow
laura33
Reviews received
Content preview
Genomics, Bioinformatics andProteomics
Concepts of Genetics – Hoofdstuk 21
21.1
Alles wat je sequenst is veel kleiner dan je totale genoom.
Je begint met het fragmenteren van het genoom, want je kunt het niet in één
keer lezen.
Eigenlijk begin je met het fragmenteren van duizenden identieke (?) genomen.
Alle stukjes, die je wel kan lezen, moet je opnieuw tot een genoom maken
assembly.
Coverage hoe vaak is er een afdekking van een stukje genoom door alle reads.
Contigs grote stukken chromosoom waarvan je zeker weet op welke plaats ze
horen. Tussen die contigs zitten ‘gaten’. Omdat alle kleine stukjes samen een
continu DNA molecuul vormen, heten ze contigs.
Met behulp van ‘gemapte’ markers
kun je ‘scaffolds’ maken. Dit helpt je
bij de assembly.
Een scaffold bestaat uit meerdere
contigs. Uiteindelijk zullen de
scaffolds en genetische informatie
een assembled genoom opleveren.
21.2
Annotatie waar liggen de genen en de regulerende elementen etc.
Gen regulator elementen, niet-eiwit coderend stuk, wel eiwit coderend stuk en
exonen.
- Er moet een ‘open reading frame’ (ORF) zijn
- Als er introns zijn, zijn er meestal consensus sequenties voor splice donor
en splice acceptor sites
- Soms (niet altijd) is er een consensus regulator sequentie (of meer)
upstream van het gen.
ORF sequenties van drie nucleotiden die na transcriptie en mRNA splicing
worden getransleerd in een aminozuurvolgorde van een eiwit. Beginnen meestal
met ATG eindigen met de terminatie volgorde van nucleotiden.
21.3
Orthologs (homologe) genen die afstammen van eenzelfde voorouder.
Paralogs homologe genen in eenzelfde soort, (α en β globine).
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller laura33. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.21. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
67474 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now