100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Samenvatting Microbiële Interacties tentamen 1 & 2(B-B2MINT10) $7.94
Add to cart

Summary

Samenvatting Microbiële Interacties tentamen 1 & 2(B-B2MINT10)

1 review
 19 views  3 purchases
  • Course
  • Institution

Samenvatting van alle behandelde tentamenstof voor deeltentamen 1 en 2.

Preview 3 out of 23  pages

  • December 14, 2022
  • 23
  • 2022/2023
  • Summary

1  review

review-writer-avatar

By: esmeehart2003 • 1 year ago

avatar-seller
Microbiële interacties

Micro-organismen: organismen die microscopisch klein en eencellig kunnen zijn + virussen

Opportunistisch pathogeen: een organisme dat meestal vrij levend is, maar onder
bepaalde condities ziekte kan veroorzaken
- Parasieten zijn vrijwel altijd eukaryoot

Primair pathogeen: een organisme dat door directe interactie ziekte kan veroorzaken in
een gezonde gastheer

Pathobionten: commensalen die ziekte veroorzaken

Virulentiefactoren zijn belangrijk bij MO interacties:
- Is het organisme kweekbaar?
- Is het organisme genetisch toegankelijk?
- Is er een goed modelsysteem voor de interactie?

Antoni van Leeuwenhoek heeft de bacterie ontdekt.

De celwand van een gram-negatieve bacterie bevat een dunne laag peptidoglycaan en een
membraan.

Schimmels bevatten ergosterol.

Mechanismen van horizontale genoverdracht:
- Natuurlijke transformatie: opname van DNA uit de omgeving via complexe
machinery (IV) en recombinatie
- Algemene transductie: lytische cyclus, een willekeurig stuk DNA is verpakt in een
viruspartikel wat vervolgens wordt geïntroduceerd in een acceptor cel en daar
recombinatie ondergaat
- Gespecialiseerde transductie: het DNA aanliggende aan de profaag wordt per
ongeluk meegenomen tijdens de release van het chromosoom, wat vervolgens wordt
geïntroduceerd in een acceptor cel en daar recombinatie ondergaat
- Conjugatie: overdracht van DNA (vaak via plasmiden) via cel-cel contact. Plasmiden
kunnen onafhankelijk repliceren

Wanneer de Lacl repressor afwezig is bij het Lac operon wordt het operon altijd hoog
afgeschreven, als er maar geen glucose is.
- Complete regulatie Lac operon
- Aanwezigheid lactose: binden lactose aan repressor en opheffen negatieve
regulatie
- Afwezigheid glucose: geen glucose, hoge concentratie cAMP, binden cAMP
aan CRP, binding complex aan binding site, binding RNA polymerase en
transcriptie

Er zijn minimaal 2 genen betrokken bij de quorum sensing regulatie in gram-negatieve
bacteriën.

, - Quorum sensing is een regulatiemechanisme waarmee bacteriën hun genexpressie
kunnen afstemmen op de populatiedichtheid aan de hand van signaalmoleculen:
- Luxl (I: inducer) maakt een klein molecuul, acetylated homoserine lacton,
autoinducer genoemd
- LuxR (R; regulator) bindt de autoinducer en zet in gebonden vorm de lux
genen aan, maar ook het luxl gen

Schimmels zijn vrijwel altijd haploid.

Een type III secretie systeem in gram-negatieve bacteriën is verwant aan de flagel en
betrokken bij het injecteren van effector eiwitten in eukaryote gastheercellen.
Het vaccin tegen de pokken bestond uit een verwante soort (koeienpokken) van de pokken

Soorten vaccins:
- Verwante niet-pathogene soorten
- Verzwakte stammen van het pathogeen
- Dode of geïnactiveerde organismen, door hitte of cross-linking
- Subunits vaccin
- Vector vaccin (ongevaarlijk micro-organisme/virus)
- DNA/RNA vaccin (genetisch materiaal dat codeert voor een antigen)

De PAMPs voor virussen: ongemethyleerd CpG DNA en dsRNA; voor bacteriën: flagellin,
lipopolysaccharide (LPS) en peptidoglycaan en voor schimmels: mannan
(oligosaccharide in de celwand) en beta glucaan (β glucan)

Macrofagen, dendritische cellen (DCs) en neutrofielen zijn de drie belangrijkste
fagocyten

Lysozym is een kationisch eiwit, verantwoordelijk is voor de afbraak van het bacteriële
macromolecuul peptidoglycaan in het fagolysosoom. Peptidoglycaan heeft een
beschermende functie voor de bacterie, dus als dat wordt afgebroken resulteert dit in sterfte
van de bacterie.

Interactie tussen binnendringende microbe en complement systeem:
1. Binding antilichaam van de gastheer aan het antigeen van de microbe
2. Interactie C1 met het antilichaam-antigeen complex
3. Opeenvolgende hydrolyse van C2, C3, C4 en C5 eiwitten
4. Formatie Membrane Attack Complex (MAC)
5. Lysis van de microbe

De kleinere eiwitten van het complementsysteem, C3A en C5B, zijn verantwoordelijk voor
het aantrekken van leukocyten (chemotaxis) en het verhogen van de vasculaire
permeabiliteit

Cytotoxische T-cellen: CD8+
T helper cellen: CD4+

Dendritische cellen presenteren antigenen aan T cellen in de lymfeknopen.

, Humane microbiota/ microbioom: alle micro-organismen op het menselijk lichaam
- Technieken om samenstelling te bepalen:
- Amplicon sequencing: DNA wordt geïsoleerd, waarna 16S rRNA genen
(prokaryoten) of andere genen/ loci amplificeren met PCR (universele
primers) en sequencen
- Niet alle microbiota kunnen interacteren met de universele primers; je
mist veel
- Eukaryoten kunnen slecht/niet worden geanalyseerd
- Informatie is beperkt
- Whole genome metagenomics: isoleren, fragmenteren en sequencen van al
het DNA
- Alle organismen en virussen kunnen geanalyseerd worden
- Geeft informatie over genen en hun functies
- Identificatie tot op stam mogelijk
- Veel (extra) informatie moet geanalyseerd worden

Dunne darm: mucus is niet aan het epitheel bevestigd en vormt een diffusie barrière met
antibacteriële producten die penetratie door bacteriën voorkomen

Een betere hygiëne zorgt voor een minder divers microbioom

Colon: bacteriën zijn gecompartimentaliseerd in de buitenste mucuslaag. De binnenste
mucuslaag, die aan het epithelium is bevestigd, is bijna vrij van bacteriën en beschermt het
epitheel

Microbiële gemeenschappen op de huid zijn over het algemeen stabiel door de tijd heen,
ondanks externe blootstelling

Kolonisatie resistentie: het is moeilijk voor een nieuwe bacterie stam om een stabiele
populatie te vestigen in een bestaand microbioom

Samenstelling darm microbiota (per persoon 150-200 soorten):
- Bacteria (98%), archaea (0,05-1%; vaak maar één soort) , fungi, virussen
- Twee dominante phyla
- Bacteroidetes
- Firmicutes

Functie microbiota:
- Productie vitamines: K12 en B
- Bescherming tegen pathogenen (kolonisatie resistentie)
- Intacte darmfunctie
- Reguleren immuunsysteem (zowel aangeboren als adaptief systeem)
- Ontwikkeling van hersenen en gedrag
- Afbreken van complexe polymeren en vorming short chain fatty acids (SCFAs), voor
extra energie (10% uit butaanzuur) en verzadiging

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller mbleeker. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $7.94. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

48298 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now

Start selling
$7.94  3x  sold
  • (1)
Add to cart
Added