Summary
Samenvatting het geneesmiddel H2
- Course
- Institution
Samenvatting van 5 pagina's voor het vak Het Geneesmiddel aan de KU Leuven (Samenvatting H2)
[Show more]
Seller
Follow
Nessie81
Reviews received
Content preview
H2: rationele drug designEen veelgebruikte methode bij de rationele ontwikkeling van geneesmiddelen is de moleculaire
modelling. De kennis van de driedimensionale structuur van moleculen is zeer belangrijk bij het
ontwerpen van geneesmiddelen en bij het optimaliseren van bestaande producten. Hierbij gaat men
aandacht besteden aan de interacties die tussen moleculen plaats kunnen vinden. De interacties
kunnen onderverdeeld worden op basis van de afstanden waarbij deze optreden.
Lange afstand: 2 moleculen die op een behoorlijke afstand van elkaar zijn moeten elkaar als
het ware ‘voelen’ en naar elkaar toekomen
Middellange afstand: 2 moleculen die al relatief dicht tot elkaar genaderd zijn moeten de
juiste positie t.o.v. elkaar innemen
Korte afstand: eigenlijke binding via interacties op korte afstand
1 INTERACTIES TUSSEN MOLECULEN
1.1 LANGE AFSTAND
Op lange afstand zijn er vooral elektrostatische interacties (tussen ladingen). Niet alleen ionen,
maar ook atomen kunnen een lading dragen omdat sommige atomen de neiging hebben om
elektronen van andere atomen naar zich toe te trekken.
EN: neiging van een atoom om elektronen in een covalente binding naar zich toe te trekken
Dit kan zorgen voor een partieel postieve en negatieve lading, de verdeling van deze partiële
ladingen in een molecule weerpsiegelt de elektrostatische eigenschappen van dat molecule.
1.2 MIDDELLANGE AFSTAND
Op middellange afstand treden waterstofbruggen op. . Dit zijn niet-covalente bindingen die
gevormd worden wanneer een waterstof die gebonden is aan een sterk elektronegatief atoom,
elektrostatisch wordt aangetrokken door een ander elektronegatief atoom dat nog een vrij
elektronenpaar ter beschikking heeft.
1.3 KORTE AFSTAND
Van der Waals interacties, hydrofobe interacties en aromatische interacties.
, 3 OPHELDEREN VAN DE STRUCTUUR VAN EEN MOLECULE
De 2 expermintele methoden die momenteel het meest gebruikt worden voor het bepalen van 3-
dimensionele structuren zijn kristallografie en Nucleaire Magnetische resonantie (NMR).
Als een bepaalde eiwitstructuur niet gekend is, maar de samenstelling van dat eiwit is wel bekend,
dan kan gezocht worden in databanken van het internet of er geen ‘verwant’ eiwit met een sterk
gelijkende aminozuursequentie (b.v. 60% gelijkenis) bestaat waarvan de ruimtelijke structuur wel
bekend is. Als dat het geval is kan moleculaire modelling het eiwit met de ongekende structuur
passen op dat met de gekende structuur door overeenstemmende bouwstenen op elkaar te
leggen. Dit proces heet “homologie-modelling”.
Geen verwante structuren gekend zelf structuur berekenen.
Verschillende conformaties vertegenwoordigen meestal een verschillende energie-inhoud.
Conformaties met een hogere energie-inhoud komen statistisch gezien veel minder voor dan deze
met een lagere energie-inhoud. Een ligand van een eiwit kan ook verschillende vormen aannemen,
maar meestal zal slechts één van die kunnen binden aan het doelwit. Deze ‘bindende vorm’ is dan
de bioactieve conformatie. De ideale situatie is dat deze bioactieve conformatie correspondeert
met de laagste energieconformatie, omdat dit degene is die statistisch gezien het meeste voorkomt.
Bij het ontwerpen van een geneesmiddel zijn er twee mogelijkheden ofwel is de receptor gekend
of de receptor is ongekend.
4 ONTWERPEN VAN GENEESMIDDELEN
4.1 GEKENDE RECEPTOR
Receptor gekend ligand ontwerpen/aanpassen die kan binden.
De bindingsplaats moet aan bepaalde voorwaarden voldoen. Hydrofobe interactie wordt
beschouwd als de sterkste kracht bij moleculaire interacties in water, een potentiële bindingsplaats
zal dus voldoende mogelijkheid moeten hebben om dergelijke interacties aan te gaan met een
ligand.
Bindingsplaats gekend:
Docking: in elkaar passen van ligand en doelwit
De novo: ontwerp van een ligand
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller Nessie81. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.75. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
67474 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now