100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Previously searched by you
Previously searched by you
logo
Samenvatting genoom e-module week van 3, regulatie van transcriptie (toets in 1 keer gehaald) $3.77
Add to cart
Quickly navigate to
Preview
  2.  
  3. Universiteit Utrecht (UU)
  4.  
  5. Genoom (BMW21614)

Summary

Samenvatting genoom e-module week van 3, regulatie van transcriptie (toets in 1 keer gehaald)
 0 purchase
  • Course
  • Genoom (BMW21614)
  • Institution
  • Universiteit Utrecht (UU)

Dit is een uitgebreide samenvatting compleet met plaatjes van de e-module van week 3, die gaat over de regulatie van transcriptie

Preview 3 out of 25  pages

Document information

  • January 1, 2023
  • 25
  • 2022/2023
  • Summary

Subjects

  • transcriptie
  • controle
  • factoren
  • eiwitten
  • e module
  • utrecht universiteit
  • genoom
  • week 3
  • mrna degradation control
  • rna localization control
  • protein activity control
  • samenvatting
  • protein degradation control

Written for

  • Universiteit Utrecht (UU)
  • Biomedische Wetenschappen
  • Genoom (BMW21614)
All documents for this subject (47)

Seller

avatar-seller
RutgerHek

Content preview

E-module week 3

E-module 1

Gene control




Multicellular Organism Contain the Same DNA (p.397)
Cellen van één organisme hebben hetzelfde DNA maar verschillen van elkaar in RNA en eiwitmoleculen. Het
DNA in en organisme verandert dus niet, maar door verschillen in genexpressie worden er van hetzelfde DNA
wel andere eiwitten gemaakt.


Different Cell Types Synthesize Different Sets of RNAs and Proteins
(p.398)
Cellen van één organisme hebben hetzelfde DNA maar verschillen van elkaar in RNA en eiwitmoleculen.
- Veel structurele eiwitten zin hetzelfde
- Sommige RNA's en eiwitten zijn specifiek voor 1 type cel
- RNA's komen vaak in een andere hoeveelheid tot expressie in verschillende cellen

, - De hoeveelheid mRNA zet niet alles over de hoeveelheid eiwit of over hun post-translationele
modificaties.


The Spectrum of mRNAs Present in a Cell Can Be Used to Accurately
Identify the Cell Type (p400)
Het is mogelijk om alle mRNA's in één cel te karakteriseren (single cell RNA-seq). Op basis
van dit soort metingen kan nauwkeurig vastgesteld worden om welk type cel het gaat. Elk
celtype heeft namelijk zijn eigen karakteristieke set van mRNA's (=expressiepartoon). Op
deze manier zijn er naast de klassieke celtypes die door microscopie onderscheidden zijn,
nog allerlei subtypes van cellen ontdekt die onder de microscoop niet van elkaar te
onderscheiden zijn.


External Signals Can Cause a Cell to Change the Expression of Its
Genes (p.400)
De genexpressie in cellen kan gesturd worden door respons op extracellulaire signalen,
zoals hormomen. deze signalen binden aan receptoren op of in de cel. Doordat
verschillende celtypen verschillende receptoren kunnen hebben, kunnen ze ook verschillend
op dezelfde hormonen reageren.


Gene Expression Can Be Regulated at Many of the Steps in the
Pathway from DNA to RNA to Protein (p.401)
Alle stappen in het proces van DNA tot eiwit kunnen worden gereguleerd:
- Transcriptional control: wanneer en hoe vaak en gen wordt getranscribeerd.
- RNA-processing control: reguleren van splicing en processing van het RNA.
- RNA-transport and localization control: de selectie van het mRNA dat word
geexporteerd uit de nucleus, en bepalen waar in het cytosol dit mRNA terecht komt.
- Translation control: selecteren welke mRNA's worden getransleerd door ribosomen.
mRNA degradation control: bepaalde mRNA's destabiliseren in het cytoplasma.
- Protein activity control: deze valt uiteen in drie stappen:
o Bepaalde eiwitten inactiveren/activeren
o Bepaalde eiwitten afbreken
o Transport of compartimentalisatie van bepaalde eiwitten.
Voor de meeste genen is regulatie op het niveau van transcriptie het meest prominent...

, Gen-specifieke en algemene transcriptie factoren




Dimerisatie
Twee eiwitten binden aan elkaar en vormen op die manier samen een functionele eenheid.


Homodimeer
Een dimeer die bestaat uit twee identieke eiwitten.


Heterodimeer
Een dimeer die bestaat uit twee verschillende delen.


Waarom zorgt dimerisatie voor een hogere affiniteit en specificiteit van
transcriptieregulatoren?
Monomeer transcriptiefactoren herkennen 4 tot 8 nucleotiden en zin daardoor niet heel
specifiek. Wanneer twee monomeren dimeriseren, word de lengte van herkenning twee keer
zo groot. Dit betekent dat er 8 -16 nucleotiden juist moeten zijn in de cis-regulatoire
sequentie. De specificiteit wordt dan verhoogd. Ook de affiniteit wordt verhoogd, doordat er
meer verbindingen gemaakt kunnen worden tussen de twee eiwitten en de sequentie.


Wat is het kenmerkende verschil tussen niet-coöperatieve binding en
coöperatieve binding van transcriptieregulatoren?
Bij niet-coöperatieve binding stijgt naar verhouding het gebonden DNA exponentieel
vergeleken met ongebonden DNA bij een toenemende concentratie eiwit.
Bij coöperatieve binding ontstaat er een soort alles-of-niets situatie. Als je de
eiwitconcentratie uitzet teen de hoeveelheid gebonden DNA krijg je daarom een sigmoidale
curve. Zie ook figuur 7-11. Bij lage concentraties eiwit is er vrijwel geen DNA bezet en bij
hoge concentraties is vrijwel al het DNA bezet. Er zijn nauwelijks eiwitconcentraties waarbij
een deel van het DNA bezet is.

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller RutgerHek. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $3.77. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

69052 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now

Start selling
$3.77
  • (0)
Add to cart
Added