Samenvatting Moleculaire Genetica, Hoofdstuk 7 (T. Voet) BMW
9 views 0 purchase
Course
Moleculaire Genetica
Institution
Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)
Book
Human Molecular Genetics
Samenvatting van hoofdstuk 7: Analyzing the structure and expression of genes and genomes , Moleculaire Genetica door T. Voet en op basis van mijn notities en slides van de les. Voor de richting Biomedische Wetenschappen.
Hoofdstuk 7: Analyzing the structure and expression of
genes and genomes
Genome structure analysis and genome projects (adhv Sanger)
Hier bespreken we hoe men heel het humane genoom heeft achterhaald met de technieken
die men toen had.
● Genoom sequeneren = rekening houden met verschillende soorten DNA
○ MtDNA ⇒ in cytoplasma, slechts 1 type en klein = makkelijk
○ Nucleair DNA ⇒ in celkern, verschillende chromosomen en groot = complex
■ Moet verknipt worden in kleine stukjes om mee te werken, maar
verliezen zo de volgorde waarin deze zaten ⇒ oplossing: overlap
creëren tussen fragmenten
● 1 Overlap maken: DNA uit bloedcellen ⇒ restrictie-endonuclease herkent een
knipplaats en knipt + partiële digestie doen = endonucleasen in een lage
concentratie toevoegen en deze maar een korte reactie tijd geven ⇒ er wordt veel
minder geknipt en er wordt overlap gecreëerd ⇒ deze stukjes worden in een vector
gestoken en in een bacterie opgegroeid (zie vorig hoofdstuk)
● 2 Elke bacterie heeft nu een stukje DNA-fragment
○ 3 ⇒ shotgun-sequencing =
willekeurig een bacterie nemen en
het DNA sequeneren + dit herhalen
tot volledig genoom is bedekt
■ Moeilijk omdat humane
genoom veel repetitieve
sequenties heeft
○ 3 ⇒ hierarchical
shotgun-sequencing = eerst een
framework map maken met
fragmenten die overlappen en dan
verder gaan ⇒ biedt oplossing voor
repetitieve sequenties (zie
afbeelding voor begrijpen overlap)
● Hoe framework map maken?
○ Adhv genetische kaarten
■ Gebaseerd op polymorfe genetische merkers en wordt gemeten in cM
1
, ■ Hoe afstand bepalen tussen deze polymorfismen? ⇒ kijken naar
meiose met homologe recombinatie
● Staan deze dichtbij elkaar ⇒ minder waarschijnlijker dat er een
homologe recombinatie heeft plaatsgevonden tussen de 2
● Staan deze verder uit elkaar ⇒ waarschijnlijker dat er een
homologe recombinatie heeft plaatsgevonden tussen de 2
● Hieruit kunnen we dus de afstand tussen bepalen in cM, bv. 1
cM betekent 1% kans op recombinatie
○ Adhv fysische kaarten
■ Gebaseerd op STS-merkers (sequence tagged sites) = sequenties met
een unieke plaats in het genoom, vaak niet polymorf, meestal buiten
genen maar sommigen ook binnen waardoor deze tot expressie
komen = ETS-merkers (expressed sequence tags sites)
In kaart brengen via screening via hybride cellen
Humane cel met hamster cel fusioneren ⇒ uit deze cel gaan at random
aantal soorten chromosomen verloren en verkrijg je een stabiele cellijn
met een aantal chromosomen. Bepalen welke chromosomen er
aanwezig zijn in de cel en hiervan DNA extraheren ⇒ van DNA PCR
uitvoeren en nagaan of STS aanwezig zijn of niet, bv. heeft STS voor van
chromosoom 3 maar niet voor chromosoom 1
2
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller EmilieBMW. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.42. You're not tied to anything after your purchase.
