Summary
Samenvatting Biochemie VOLLEDIG (J. Van Lint: BMW & THK)
- Course
- Institution
Voor deze samenvatting heb ik zowel gebruik gemaakt van de cursus als van mijn eigen aantekeningen van in de les.
[Show more]
1 review
By: mohamedourimchi13 • 1 year ago
Seller
Follow
merelBMW
Reviews received
Content preview
Biochemie1 Biomoleculen
1.1 Aminozuren
De persoonlijkheid van biomoleculen = functionele groepen
o D en L-vorm (mensen, zoogdieren)
o Hydrofiel/hydrofoob
o Naamgeving: 3 letter code/1 letter code
o Pkr waarden = lading van AZ afhankelijk van Ph
1.2 Indeling der aminozuren volgens eigenschappen zijketens
Nonpolair, alifatische zijketens
- Niet asymmetrisch
- Grote conformationele
flexibiliteit
(kunnen roteren rond de -C-
binding
- Inert en alifatisch
- Nonpolair, hydrofoob
- Geen functionele groepen
- Zijketens clusteren samen
In vitro mutagenesis (alanine)
: Het bepalen van belangrijke AZ -
zijketens bij een bepaalde binding
➔ Alle eiwitten (leucine) in een
plasmide (drager)
DNA + codons -> codon vervangen ->
RNA -> nieuw eiwit (alanine)
= ‘afknippen van zijketens’
5
, AZ met aromatische R-groepen
- Zeer hydrofoob
- Apolair
- Weinig reactief
- OH-groep
- Intermediair polair
Deelname aan H-bruggen
- Functionele groep in enzymen
= fosforylatieplaats
➔ Fosfaat inplanten op eiwit
- Intermediair polair (N)
- Zeldzaam
- Structurele studies
Lichttechniek: meten van hoeveelheid eiwitten in
bijvoorbeeld medicatie
- Licht door een monochromator
- Licht met een bepaalde intensiteit uitgezonden,
door cuvette met vloeistof (eiwitten)
- Hoeveelheid opgenomen/uitgezonden licht
gemeten (absorbantie) = hoeveelheid eiwitten
6
,AZ met polaire, ongeladen R-groepen
- SH-groep
- Polair
- pKa: 8
- OXIDATIE: cystine vorming
- Disulfidebrug eiwit = 3D vorm
Belangrijke groep ih katalytisch
centrum enzyme:
: S aanval op enzym -> CoA los
- OH groep
- Polair
- Kunnen worden
gefosforyleerd
- Nemen deel aan H-bruggen
- Amiden
- Polair
- H-brugvorming
- Geen deelname aan H-
bruggen
- Cyclisch
- Gematigd polair
- Rigide vanwege ringvorm
Knikvorming ter hoogte van prolines
in peptideketen
➔ Bochtvorming binnen
eiwitketens (2 AZ verbonden
door peptide binding)
➔ TRANS configuratie is
gunstigst bij alle AZ
! Proline heeft CIS configuratie
= knikvorming ipv zigzagvorm
7
, AZ met positieve geladen R-groepen
- Lysine: primaire Amine
- Arginine: Guanidinogroep
- pKa= 10
Histidine
- Dubbele binding: Imidazol
groep (R-groep)
- pKa= 7
- ‘multitool’ -> populair bij
katalitisch centra
- Zowel aanval nucleofiel als
elektrofiel
- 50/50 geladen/ongeladen
AZ met negatief geladen R-groep
- Zeer polair
- pKa 3,65 (D)
- pKa 4 (E)
- Volledig geïoniseerd op pH 7
- Metalen en kationen cheleren
= Ca2+ kan binden op –
plaats (bv. bij
spiercontractie)
8
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller merelBMW. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $13.40. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
67474 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now