Samenvatting BMW moleculen (organische chemie & enzymen/eiwitten) UU 2022/2023
9 views 0 purchase
Course
Moleculen (BMW10505) (BMW10505)
Institution
Universiteit Utrecht (UU)
In dit document zijn de hoorcolleges en de leerdoelen van het eerste deel van het vak moleculen samengevat. Het gaat om de delen:
- Organische chemie
- Enzymen en eiwitten
Samenvatting organische chemie
HC 1/2 atoom- en molecuulbouw
- Isotopen zijn atomen met verschillende hoeveelheden neutronen. De proton
hoeveelheid blijft hetzelfde en het blijft dus dezelfde stof alleen de atoommassa
veranderd.
- Kwantum theorie bij elektronen luidt dat ze beide een golf en deeltjes karakter
hebben tot dat je het begint te meten dan is het alleen nog een deeltje.
- De octetregel houdt in dat alle atomen volle elektronen schillen willen bezitten.
- Ion bindingen zijn afhankelijk van ladingsverschillen die aantrekking veroorzaken.
- Covalente bindingen zijn gebaseerd op twee atomen die een elektron delen en
daardoor verbonden zijn.
- Lewisstructuren is het tekenen van elektronen rond om atomen door twee gepaarde
stippen of een streep te tekenen. Hierin worden alleen valentie elektronen getekend.
- Wanneer een atoom een elektron meer bezit in zijn buitenste schil dan normaal, dan
krijgt het een formele negatieve lading. Bezit het een elektron minder dan krijgt het
een formele positieve lading.
- Wanneer twee atomen een covalente binding delen zal de positievere/grotere kern
harder trekken aan de elektronen dan de andere kern. Dit heeft als gevolg dat de ene
kern relatief negatief gaat zijn, omdat er meer negatieve lading omringt. Dit heet een
partiele negatieve of positieve lading.
- Ken S P en SP bindingen
Regels rondom het opstellen van lewisstructuren
- Bepaal de som van valentie elektronen
- Minst elektro-negatieve atoom bevindt zich in het midden en de rest daaromheen
- Teken bindings-elektronen en trek deze af van de totale som
- Vul valentie schil van de buitenste atomen en trek deze af van de totale som
- Vul valentie schil van het binnenste atoom met de resterende elektronen
- Als er te weinig elektronen over zijn kan je dubbele bindingen toevoegen
- Bepaal tot slot de formele lading van elk atoom
De beste structuur heeft zo min mogelijk afzonderlijke ladingen en heeft negatieve ladingen
op meer negatieve ladingen en positieve ladingen op de minst negatieve.
Verschillende orbitalen
In de eerste schil bevindt alleen één s-orbitaal en in de tweede schil bevindt één s-orbitaal
en drie p-orbitalen. Een orbitaal bestaat uit twee elektronen zoals te zien in lewisstructuren.
Hoe verder van de kern een schil bevindt hoe meer de orbitalen daarin energie bezitten. Een
schaal van energie is hieronder weergeven.
,De drie regels voor ground-state electronic configuration
1. Aufbau principe: elektronen bevinden zich altijd in het orbitaal met de laagste
energie.
2. Pauli exclusion principe: er bevinden niet meer dan twee elektronen per orbitaal, ook
hebben de twee elektronen een tegenovergestelde spin.
3. Regel van Hund: gedegenereerde orbitalen:
eerst in lege orbitalen?
Vormen van orbitalen
- S-orbitalen zijn rond vormig
- P-orbitalen bestaan uit twee ballonvormige
cirkels die tegenover elkaar staan.
Energie in moleculen bevindt zich in de
overlap in orbitalen. Hoe meer overlap er is,
hoe meer energie er in het molecuul
gestopt moet worden.
Bindingen in moleculen
Er zijn twee soorten bindingen, Sigma en Pi
bindingen. Een Sigma binding is in het
zelfde vlak als de binding (S+S, S+P en
P+P). Een Pi binding bestaat uit twee P-
orbitalen die zich loodrecht bevinden t.o.v.
de binding.
,Koolstof en orbitalen
Koolstof heeft vaak vier gelijke verbindingen, maar de grondtoestand van verbindingen heeft
geen gelijkwaardige elektronen, want 2s bezit minder energie dan de 2p bindingen. Hier
gebeurt iets genaamd hybridisatie. De s en p orbitalen binden fuseren samen tot sp3-
hybriden, met allemaal evenhoge energie niveaus en dus gelijke bindingen.
Wanneer er een dubbele
binding tussen C atomen
aanwezig is dan is er geen
sprake meer van gelijkwaardige
bindingen. De Pi binding die
haaks van de binding verbindt
vormt de tweede/dubbele
binding naast de centrale Sigma
binding. De 2p orbitaal van de Pi
binding bezit meer energie dan de
rest van de bindingen.
, Dingen om te onthouden, alle enkele bindingen zijn Sigma bindingen, voor elke binding die
erbij komt is er een extra Pi binding. Bij drie dubbele binding is er 1 sp binding ofwel sp1, bij
dubbele binding is dit sp2.
Benzeen
Bij een bezeen ring wisselen de Pi-bindingen constant. De p2 orbitalen steken uit de ring en
staan dus haaks op de binding. Het wisselen van bindingen wordt het mesomeer resonantie
effect genoemd.
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller RutgerHek. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $8.56. You're not tied to anything after your purchase.
