100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Samenvatting ALLE STOF THEORETISCHE BIOLOGIE - KWANTITATIEVE BIOLOGIE (deeltoets 2) Universiteit Utrecht (UU) $5.38   Add to cart

Summary

Samenvatting ALLE STOF THEORETISCHE BIOLOGIE - KWANTITATIEVE BIOLOGIE (deeltoets 2) Universiteit Utrecht (UU)

 48 views  2 purchases
  • Course
  • Institution

Ik begreep eerst helemaal niets van Theoretische biologie, het ging me allemaal veel te snel en ik had nog niet eens door wat al die letters nou precies betekenen?! Toch heb ik voor deeltoets 2 een 9.1 gehaald!! Dit is een samenvatting (in begrijpelijk Nederlands) over wat er nou precies allemaal i...

[Show more]
Last document update: 1 year ago

Preview 3 out of 16  pages

  • April 12, 2023
  • August 16, 2023
  • 16
  • 2022/2023
  • Summary
avatar-seller
Theoretische Biologie


Deeltoets 2 van Kwanti tati eve Biologie
Jaar 1, periode 3
Bevat alle uitgewerkte leerdoelen




In ODE modellen (Ordinary Differential Equations) gaan ze ervan uit dat:
- Alle individuen gelijk zijn en beschreven kunnen worden door een enkele variabele.
- De populatie gemixt is, dus ruimtelijke locatie is irrelevant
- De populatie is groot, je hoeft je niet bezig te houden met 0.1 individuen
- De parameters zijn constant, geen seizoensgebonden veranderingen in b of d

b = per capita birth rate Het model dat hier bij hoort:
bN = aantal geboortes stijgt lineair met populatie
d = per capita death rate dN
=( b−d ) N
dN = aantal sterfgevallen stijgt lineair met populatie dt

kleine populatie heeft de neiging om te groeien, een grote heeft de neiging om af te nemen. Als er een evenwicht is
blijft het aantal individuen in de populatie gelijk omdat geboorte en sterfte elkaar in evenwicht houden, dit heet de
steady state.

Als je ‘density dependent death’ gaat toevoegen ziet je model er iets anders uit. Je vervangt de constante d dan
door: f ( N )=d +cN
Je kan dit ook schrijven als: g ( N )=1+ N /k met k =d /c
(k is een maat voor hoe erg je sterfte toeneemt met de populatiegrootte)


Het model dat bij ‘density dependent death’ hoort:

dN
=(b−d ( 1+ N /k )) N met g ( N )=1+ N /k
dt
d is hier je minimale per capita ‘sterfte’ en g hoe je ‘sterfte’ stijgt in relatie tot N
Je noemt het niet-triviale evenwicht ‘K’ ook wel de carrying capacity van het
ecosysteem. Deze kan opgelost worden uit de bovenstaande formule door
dN b−d
=0 in te vullen. Je krijgt dan K=k
dt d

,Een triviaal evenwicht (bijv. N=0) betekent dat een van de populaties is uitgestorven.
Een niet-triviaal evenwicht houdt in dat er co-existentie is.

R0 = b/d Dit is de fitness

Bij een 1-dimensionaal systeem teken je een faseplaatje door een horizontale lijn te tekenen. Vervolgens ga op de
lijn aannames over de afgeleide van de groei tekenen:

a. Als de grafiek > 0 is (boven de x-as), teken je een  om te laten zien dat N toeneemt.
b. Als de grafiek < 0 is (onder de x-as), teken je een  om te laten zien dat N afneemt.
c. Als de grafiek = 0 is, teken je een cirkel om een evenwicht (steady state) aan te duiden.

0 is wel een evenwicht, maar een instabiel evenwicht



Attractor Repellor

Als je meerdere attractoren hebt bepalen de begincondities naar welke attractor het evenwicht beweegt. De grens
tussen twee attractoren is altijd een instabiel evenwicht.
Het interval van de begincondities waarvoor een evenwicht naar een bepaalde attractor beweegt noem je de Basins
of attraction.




dN
Als je ‘density dependent birth’ toevoegt ziet je model ( =( b−d ) N ) er weer iets anders uit.
dt
we vervangen b nu met f ( N )=b−cN , met k =b /c
dit kan je ook weer schrijven als g( N )=1−N /k
(k is nu de populatiegrootte waarbij je geboortecijfer 0 is geworden)

Het model dat hier bij hoort:

dN
=(b ( 1−N /k )−d ) N met g ( N )=1−N /k
dt
b is hier je maximale per capita ‘geboorte’ en g hoe je ‘geboorte’ daalt in relatie tot N
Je noemt het niet-triviale evenwicht ‘K’ ook wel de carrying capacity van het ecosysteem.
dN
Deze kan opgelost worden uit de bovenstaande formule door =0 in te vullen.
dt
Je kan ook een model maken voor logistieke groei, dit doe je met een vergelijking van de vorm:


Logistieke groei:

dN
=rN (1−N / K ) met r =b−d
dt
r is ‘natural rate of increase’ en K is de carrying capacity

, De drie typen functies die we nu behandeld hebben zijn:

dN
Density dependent death: =(b ( 1−N /k )−d ) N Hebben allemaal de vorm:
dt
dN dN 2
Density dependent birth: =(b−d ( 1+ N /k )) N =aN −b N
dt dt

dN
Functie voor logistieke groei: =rN (1−N / K )
dt


Het is natuurlijk zeer onwaarschijnlijk dat ‘geboorte’ en ‘sterfte’ lineair afhangen van N.
Dat zou betekenen dat ‘geboorte’ negatief zou kunnen zijn en ‘sterfte’ oneindig. We gaan nu kijken naar
verzadigingsfuncties, ook wel Hill-functies

xn
Hill-functie: f ( x )=
x n +hn
n n
x h
Reverse Hill-functie: g ( x )=1− n n
= n n
x + h x +h

Nu gaan we kijken naar 2-dimensionale systemen!

Het klassieke predator-prooi model van de ecologie; Lotka-Volterra model



Lotka-Volterra model

dR dN
=( bf ( R ) −d−aN ) R en =( caR−δ ) N Met f ( R )=1−R /k
dt dt
dR dN
=( b (1−R /k)−d−aN ) R en =( caR−δ ) N
dt dt
(a is de killing rate van prooidieren door predatoren, c is hoeveel ‘roofdiermassa’ elk
opgegeten prooidier levert, δ is de sterfte van de roofdieren)


Als je een Lotka-Volterra evenwicht wilt vinden moeten beiden vergelijkingen gelijk zijn aan 0.

Stap 1. Vul 0 in voor de makkelijkste vergelijking en los deze op.
Als je het bovenstaande model gebruikt:

dN
=0 , als je dit oplost krijg je N=0 of R=δ /ca
dt
(dit betekent dus: er zijn 0 predatoren of δ /ca prooidieren)

Stap 2. Substitueer deze oplossingen een voor een in de 2e formule, terwijl je deze gelijkstelt aan 0.
dR
Eerst substitueer je N=0 in =0  ( b ( 1−R /k )−d ) R=0 .
dt
Hier komen weer 2 oplossingen uit: R=0 of (b ( 1−R /k )−d)=0
(dit betekent dus: er zijn 0 prooidieren -beide populaties uitgestorven- of prooidieren op carrying capacity,
geen predatoren, er staat namelijk R=k ( 1−d /b )=K )

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller VetStudentUU. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $5.38. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

73918 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now

Start selling
$5.38  2x  sold
  • (0)
  Add to cart