100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Samenvatting leerdoelen Celbiologie WUR (CBI-10306) $4.35   Add to cart

Summary

Samenvatting leerdoelen Celbiologie WUR (CBI-10306)

28 reviews
 2282 views  99 purchases
  • Course
  • Institution
  • Book

Een samenvatting aan de hand van de leerdoelen van het vak Celbiologie dat aan Wageningen University wordt gegeven. Alle examenstof is in deze samenvatting verwerkt, dus de leesstof uit het boek en de stof uit de colleges, practica en ICT-modules is in deze samenvatting verwerkt. Door louter het ge...

[Show more]
Last document update: 7 year ago

Preview 10 out of 111  pages

  • No
  • Leesstof uit reader celbiologie
  • December 7, 2016
  • December 24, 2016
  • 111
  • 2016/2017
  • Summary

28  reviews

review-writer-avatar

By: rongrongchen • 11 months ago

review-writer-avatar

By: samrexwinkel • 4 year ago

review-writer-avatar

By: Vanbluca • 4 year ago

review-writer-avatar

By: jaccomeewisse • 4 year ago

review-writer-avatar

By: cncornelissen01 • 5 year ago

review-writer-avatar

By: glory04flu • 5 year ago

review-writer-avatar

By: mikehoffman • 6 year ago

Show more reviews  
avatar-seller
Leerdoelen week 1
Leerdoel 1 – Labeling eiwitten
Label eiwit dat aangeeft waar eiwit naartoe moet = signaalsequentie: aminozuurvolgorde binnen
eiwit die bepaald waar eiwit na synthese terechtkomt.

Eiwit met signaalsequentie? -> naar celkern, mitochondriën, chloroplasten, peroxisomen of ER
Eiwit zonder signaalsequentie? -> blijft in cytosol

Eiwitten voorzien van signaalsequentie wordt verricht door vrije ribosomen in cytosol, deze starten
immers met de eiwitsynthese door translatie van een stuk mRNA en hierbij wordt allereerst de
signaalsequentie gevormd. Aminozuurvolgorde van de signaalsequentie wordt herkend door signal-
recognition particle (SRP) dat zich in het cytosol bevindt en dit bindt zich aan het ribosoom en aan de
signaalsequentie. De translatie stopt en het ontstane complex beweegt zich naar organel dat
bestemming voor eiwit vormt en daar bindt het complex zich aan SRP-receptor, waarna het eiwit
wordt opgenomen door het organel dat de bestemming van het eiwit vormt. Tijdens deze opname
wordt de translatie van het eiwit hervat en zodoende wordt het eiwit dan afgewerkt.

Leerdoel 2 – Functie lysosomen/vacuole
Lysosomen: kleine bolvormige organellen die bestaan uit een dubbel membraan met daarbinnen een
zeer gevarieerde verzameling van enzymen.

Enzymen lysosomen -> meest actief bij pH binnen lysosoom (= lagere pH dan pH cytosol) ->
membraan lysosoom voorkomt vrijkomen enzymen lysosoom in cytosol, maar mochten er toch
enkele vrijkomen dan zijn deze hierdoor niet of minder schadelijk

Functie lysosomen:
- Afbraak van voor de cel onbruikbare en/of ongewenste stoffen.
- Afbraak van versleten organellen

Lysosomen -> in 3 processen in cel gebruikt:
1. Endocytose:
Stoffen opgenomen door vorming vesikels -> vormen vroeg endosoom -> laat endosoom -> lysosoom
(afbraak vindt plaats)
2. Fagocytose:
Lysosomen versmelten met fagosoom en fagosoom wordt afgebroken
3. Autofagie: proces waarmee een cel verouderde delen van zichzelf afbreekt.
Lysosomen versmelten met autofagosoom en autofagosoom wordt afgebroken

,Fagosoom: door fagocytose opgenomen deeltje waaromheen fagocyterende cel dubbel membraan
vormt.
Fagosoom = opgenomen deeltje + dubbel membraan
Autofagosoom: af te breken organel van autofagocyterende cel waaromheen autofagocyterende cel
dubbel membraan vormt.
Autofagosoom = af te breken organel + dubbel membraan

Vacuole: groot organel dat aanwezig is in plantencellen, dat omgeven wordt door het
vacuolemembraan en dat een waterige oplossing vol eiwitten, enzymen en ionen bevat.

Functies vacuole:
- Handhaven stevigheid cel door mogelijk maken turgor.
- Afbraak van voor de cel onbruikbare en/of ongewenste stoffen.
- Afbraak van versleten organellen

Mannose-6-fosfaat (M6P): gefosforyleerde suiker waarmee enzymen die worden geproduceerd voor
de lysosomen in het ER en cis-Golgi-netwerk worden gelabeld zodat ze wanneer ze in het trans-Golgi-
netwerk terecht komen kunnen worden herkend door mannose-6-fosfaatreceptoren (M6P-
receptoren) wat er toe leidt dat de enzymen daadwerkelijk in lysosomen terechtkomen.

Leerdoel 3 – Beeldvorming
Resolutie/oplossend vermogen (r): de kleinst mogelijke afstand waarop 2 punten nog van elkaar te
onderscheiden zijn.




r = resolutie (m)
λ = golflengte licht (m)
n = brekingsindex van de materie tussen de lens en het dekglas van de microscoop
α = halve openingshoek van lens




N.A. = numerieke appertuur: getal dat op het objectief van de microscoop genoteerd staat en dat
gelijk is aan nsin(α).

Contrast: verhouding tussen licht en donker.

Leerdoel 4 – Microscopie
2 soorten microscopie:
1. Lichtmicroscopie (LM):
- Normale lichtmicroscopie: microscopie waarbij men licht op object laat vallen en door terugkaatsing
van het licht het object waarneemt. -> objecten kleiner dan ongeveer de helft van de golflengte van
licht zijn niet te zien.

,- Fluorescentie lichtmicroscopie: microscopie waarbij fluoriserende stoffen die specifiek aan
bepaalde onderdelen van cellen binden worden gevisualiseerd.




- Lichtmicroscopie waarbij faseverschillen van licht die ontstaan door verschillen in brekingsindexen
tussen bepaalde stoffen worden geconverteerd naar intensiteitsverschillen.
- Super-resolutiemicroscopie: groep technieken voor lichtmicroscopie die gebruik maakt van
stochastische (op toeval berustende) en fysische eigenschappen van fluorescentie en waarmee
resoluties van zo’n 10 nm kunnen worden gehaald (ongeveer 200 nm bij normale lichtmicroscopie).
- Confocale laser scanning microscopie: speciale vorm van fluorescentiemicroscopie waarbij een
laserstraal wordt gericht op een specifiek punt op een bepaalde diepte waardoor alleen de
fluorescentie van dat punt in de afbeelding die wordt gevormd wordt meegenomen en zodoende
door het bewegen van deze laserstraal langs verschillende punten een driedimensionale afbeelding
kan worden gemaakt.
2. Elektronenmicroscopie (EM): microscopie waarbij gebruik wordt gemaakt van elektronen.
- Transmissie-elektronenmicroscopie (TEM): elektronenbundel wordt op preparaat (wat extreem
dunne coupe moet zijn) gericht en valt dwars door preparaat heen op scherm of fotografisch papier
waar beeld ontstaat.

,- Scanning-elektronenmicroscopie (SEM): elektronenbundel wordt op preparaat gericht en a.d.h.v
weerkaatsing van opvallende elektronen wordt beeld van een oppervlak of breukvlak gemaakt.




Lichtmicroscopie -> objecten kleiner dan ongeveer de helft van de golflengte van licht zijn NIET te
zien
Elektronenmicroscopie -> objecten kleiner dan ongeveer de helft van de golflengte van licht zijn WEL
te zien -> veel meer details te zien dan met lichtmicroscopie

,Verschillen tussen lichtmicroscopie en elektronenmicroscopie:
1. Bij elektronenmicroscopie wordt de resolutie niet beperkt door de golflengte van licht, waardoor
er bij elektronenmicroscopie veel meer details te zien zijn dan bij lichtmicroscopie.
2. Om contrast te creëren worden bij elektronenmicroscopie zware metalen gebruikt i.p.v de
kleurstoffen die bij lichtmicroscopie worden gebruikt.
3. Bij elektronenmicroscopie wordt gebruik gemaakt van magnetische lenzen (om de
elektronenbundel te richten) i.p.v van de glazen lenzen die bij lichtmicroscopie worden gebruikt.
4. Elektronenmicroscopie kan alleen worden toegepast op dood materiaal terwijl lichtmicroscopie op
zowel levend als dood materiaal kan worden toegepast, omdat bij het maken van de preparaten
fixatie en inbedding in kunsthars plaatsvindt waarna het materiaal nog in vacuüm wordt geplaatst.

Leerdoel 5 – Preparatietechnieken
Fixatietechnieken en inbeddingstechnieken
Doel = preparaten geschikt maken voor elektronenmicroscopie
Uitvoering:
1. Fixatie van object -> doel = behouden structuur object
- Cryofixatie: snel invriezen van object
- Chemische fixatie: fixatie door toevoegen van chemicaliën die ervoor zorgen dat moleculen binnen
object ondeling verbonden worden waardoor stijve structuur ontstaat.
2. Dehydratatie: het verwijderen van het aanwezige water in het preparaat.
3. Inbedden gefixeerd object in gemakkelijk te snijden materiaal (bv. kunsthars) -> doel =
ondersteunen structuur materiaal waardoor deze tijdens het snijden niet ineengedrukt wordt.
4. Snijden van coupes (hele dunne plakjes die geschikt zijn voor microscopie) -> m.b.v:
- Microtoom -> LM
- Ultramicrotoom -> EM -> dunnere coupes nodig dan bij LM

Contrasteringstechnieken
Doel = transparante celstructuren die zonder gebruik te maken van contrasteringstechnieken niet te
zien zijn toch zichtbaar maken.
Uitvoering -> 2 opties:
1. Kleurstoffen toevoegen die aan bepaalde delen van cel hechten en zodoende contrast creëren.

,2. Faseverschillen van licht die het gevolg zijn van verschillen in brekingsindices tussen verschillende
onderdelen van de cel m.b.v software converteren naar intensiteitsverschillen.

Localisatietechnieken
Doel = het aantonen van bepaalde organellen in cellen.
Uitvoering = door toevoegen van bepaalde stoffen worden bepaalde organellen zichtbaar gemaakt ->
voorbeeld van stof die kan worden toegevoegd = jodium in kaliumjodide (JKJ) -> kleurt zetmeel
blauw, waardoor zetmeelkorrels (amyloplasten) in plantaardige cellen zichtbaar kunnen worden
gemaakt

Vriesbreektechniek: techniek om oppervlaktestructuren van cellen te kunnen bekijken door de cellen
zeer snel in te vriezen en vervolgens te breken met een mes -> breukvlak dat door hydrofobe midden
van membranen loopt ontstaat (fosfolipiden niet afzonderlijke waarneembaar, grote
membraaneiwitten breken niet maar zijn als partikels te zien)

Vriesbreken -> 2 breukvlakken ontstaan:
1. Protoplasmatische fractuur (PF): breukvlak dat aan zijde cytoplasma ligt. -> protoplasmatische
oppervlakte (PS)
2. Extracellulaire fractuur (EF): breukvlak dat aan buitenzijde cel ligt. -> extraplasmatische
oppervlakte (ES)




Vriesetstechniek: techniek waarbij eerst vriesbreken wordt toegepast op de te onderzoeken cellen en
waarna het materiaal wordt geëtst door het ijs de kans te geven te sublimeren waardoor het reliëf
van de gemaakte afdruk wordt vergroot.

Shadow-casten: het opdampen van een metaal (bv. platina) op een afdruk onder een hoek waardoor
alle uitstekende deeltjes van de afdruk een schaduw krijgen.

Spreidingstechniek: techniek om het chromatine van de celkern zichtbaar te maken.
1. Chromatine celkern in contact gebracht met wateroppervlak -> chromatine = draadvormige
structuur -> draden zullen zich onder invloed van de oppervlaktespanning van het wateroppervlak
uitspreiden over het wateroppervlak
2. Chromatinedraden hechten aan vlies dat tegen grensvlak wordt aangehouden
3. Na droging + contrastering kan zo ontstane preparaat met EM bekeken worden.

,Leerdoel 6 – Verschillen tussen structuren van cellen
Eukaryoten: organismen met cellen die een celkern en organellen hebben.
- Planten:
1. Celwand
2. Chloroplasten
3. Vacuole(s)
- Dieren:
1. Geen celwand
- Schimmels:
1. Celwand
2. Geen chloroplasten

Alle eukaryote cellen bevatten ER, Golgi-apparaat, mitochondriën, peroxisomen, lysosomen en
endosomen.

Prokaryoten: organismen met cellen zonder celkern en organellen.

Organellen: door membranen omgeven eenheden binnen cellen met specifieke bouw en functie
binnen de cel.

Leerdoel 7 – Nucleus
Nucleus = celkern -> omgeven door kernenvelop: dubbel membraan met daarin kernporiën dat de
nucleus omgeeft.

Kernenvelop:
1. Binnenmembraan -> bevat:
- Eiwitten waaraan de chromosomen zich kunnen hechten
- Eiwitten waaraan het nucleaire lamina zich kan hechten.
2. Buitenmembraan -> bouw is overeenkomstig met bouw membranen ER die verbonden zijn met
buitenmembraan celkern
3. Kernporiën: openingen waardoor kleine in water oplosbare moleculen en bepaalde grotere
moleculen (zoals RNA) kernenvelop via passief/non-selectief transport kunnen passeren.w




Nucleaire lamina: netwerk van eiwitfilamenten dat de binnenzijde van het binnenmembraan van de
nucleus bedekt en zodoende voor stevigheid van de kernenvelop zorgt.

,Kernporiën -> bestaan uit complex van eiwitten waarvan veel polypeptideketens ongestructureerd
zijn en voor de opening hangen waardoor toegang tot kern voor grotere moleculen door dit netwerk
van polypeptideketens wordt versperd.




Voor transport door kernporiën hoeven eiwitten NIET ontvouwen te worden
Voor transport van eiwitten ER, mitochondrium of chloroplast in moet het eiwit WEL ontvouwen
worden

Nucleus -> bevat kernplasma -> bevat:
1. DNA -> opgerold rond de histonen (eiwittten) en opgerold tot chromosomen
2. Nucleolus (kernlichaampje): compacte structuur die bestaat uit fibrillaire (draadachtige) en
granulaire (korrelige) delen waar het rRNA (ribosomaal RNA) wordt gemaakt, omdat zich in dit
gedeelte van het DNA de meeste genen voor rRNA bevinden.
- Granulaire delen = ribosoom-voorstadia
- Fibrillaire delen = draadvormige RNA-transcripten
3. Chromatine:
- Euchromatine: DNA dat is uitgerold en waaraan transcriptie plaatsvindt (lichte vlekken in
afbeeldingen kern). -> bevat veel genen
- Heterochromatine: DNA dat is opgerold en waaraan geen transcriptie plaatsvindt (donkere vlekken
in afbeeldingen kern). -> bevat weinig genen




Functie celkern = het bevatten van het DNA en d.m.v transcriptie van dit DNA tot mRNA, dat in
tegenstelling tot DNA klein genoeg is om via de kernporiën de celkern te verlaten, allerlei processen
in de cel aansturen.

Leerdoel 8 – Mitochondriën
Structuur

,Structuur mitochondrium van buiten naar binnen:
1. Buitenmembraan
2. Intermembraanruimte
3. Binnenmembraan
4. Matrix

Elk onderdeel bevat voor dat onderdeel unieke verzameling eiwitten die samenhangt met doel van
het onderdeel binnen het mitochondrium.

Buitenmembraan mitochondrium -> bevat veel moleculen porin: transporteiwit dat zorgt voor de
vorming van waterachtige transportkanaaltjes in membraan. -> buitenmembraan = permeabel voor
kleine moleculen + ionen ( < 5000 dalton)
Binnenmembraan -> GEEN porin -> impermeabel voor kleine moleculen + ionen -> behalve op
plaatsen waar specifieke transporteiwitten voor deze kleine moleculen + ionen aanwezig zijn ->
matrix bevat alleen moleculen die door selectief transport over binnenmembraan matrix in zijn
getransporteerd

Chemische samenstelling intermembraanruimte = chemische samenstelling cytosol

Binnenmembraan = locatie oxidatieve fosforylering

Onderdelen binnenmembraan mitochondrium:
1. Dubbele laag fosfolipiden
2. Benodigdheden voor oxidatieve fosforylering:
- Eiwitten die onderdeel zijn van elektronentransportketen van oxidatieve fosforylering
- Protonpompen
- ATP-synthase: enzym dat nodig is voor productie ATP.
- Transporteiwitten om bepaalde kleine moleculen (bv. pyruvaat) matrix in te laten.

Binnenmembraan van mitochondrium -> bevat cristae: plooiingen van het binnenmembraan van een
mitochondrium.

Veel cristae? -> sterke plooiing binnenmembraan mitochondrium -> groot beschikbaar oppervlak
voor oxidatieve fosforylering -> grotere ATP-productie -> veel energie

, Functie
Via citroenzuurcyclus en oxidatieve fosforylering vormen van ATP-moleculen die nodig zijn om allerlei
processen in de cel van energie te voorzien.

Plaatsen in cel met grote energiebehoefte? -> veel mitochondriën

Leerdoel 9 – ER
2 soorten ER:
1. Ruw endoplasmatisch reticulum (RER): ER met ribosomen aan het cytosolische oppervlak
2. Glad endoplasmatisch reticulum (SER): ER zonder ribosomen aan het cytosolische oppervlak

Normale cel:
Kleine hoeveelheid SER, grote hoeveelheid RER

In principe bevinden alle ribosomen zich vrij in cytosol -> signaalsequentie gevormd bij synthese
eiwit? -> ribosoom naar RER

2 soorten ribosomen:
1. Ribosomen die zich op RER bevinden -> synthese van eiwitten die in ER worden afgewerkt
2. Ribosomen die vrij in cytosol liggen -> synthese van alle overige eiwitten

Structuur
ER bestaat uit verzameling membranen met al dan niet ribosomen erop + is vergroeid met
kernenvelop

Lumen: ruimte binnen membranen waaruit ER bestaat.

Functie
1. RER:
- Synthese eiwitten
- Synthese vetten
2. SER:
- Zeer gespecialiseerde functies (bv. afbraak gifstoffen) afhankelijk van type cel

Leerdoel 10 – Golgi-apparaat
Locatie = dichtbij celkern

Structuur




Golgi-apparaat bestaat uit cisternen: door membraan omsloten platte schijven.

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller hugocloudt. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $4.35. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

75323 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now

Start selling
$4.35  99x  sold
  • (28)
  Add to cart